návrat Aguinaldo a zachycení Manila
4. Května Dewey poslal telegram, že byla přijata ve Washingtonu dne 7. Května: „jsem kontrolu bay, zcela, a může trvat města kdykoliv, ale nemám dostatek mužů k udržení.“Křižník USS Charleston a parník USS Peking s municí, zásobami a jednotkami měly být okamžitě odeslány do Manily. Generálmajor. Wesley Merritt, který dostal velení nad pozemní operací, původně požadoval sílu asi 14 000 mužů, ale později ji zvýšil na 20 000. 25. května brigádní generál T. M. Anderson a 2491 amerických vojáků pod jeho velením vypluli ve třech transportech ze San Franciska a připojili se ke konvoji s USS Charleston u Honolulu.
zatímco Američané hromadili své síly, Filipínský vůdce odporu Emilio Aguinaldo oznámil obnovení svého boje proti Španělsku. Aguinaldo žil v samozvaném exilu v rámci dohody se španělskými úřady, ale oslovil Američany a nabídl jim pomoc při jejich vojenském tažení. Dopraveno z Hongkongu americkou lodí, Aguinaldo přistál v Cavite v květnu 19, shromáždil své příznivce, a okamžitě přistoupil k zachycení několika měst jižně od Manily. V červnu vyhlásil nezávislost Filipín 12 a byl vyhlášen prezidentem Filipínské republiky. Aguinaldo akce nebyly schváleny Američané, ale tam bylo něco, co mohli udělat, aby zpomalit jeho postup. V čele značné povstalecké armády, Aguinaldo zahájil těsné obléhání Manily.
20. června se konvoj USS Charleston zastavil, aby ostřeloval a zmocnil se ostrova Guam, než pokračoval v cestě a 30. Června dorazil do Manilského zálivu. Druhé oddělení, 3,586 vojáků v rámci Brigádního Generála F. V. Greene, přijel 17. července a Merritt, kteří byli jmenováni generálním guvernérem, dosáhl Manila Bay na 25.července. Pět letadel, nesoucí 4,847 muži, kteří přijeli na 31. července, čímž se celkový Americký sílu vojska v Manile na téměř 11 000, s 5000 více na cestě. Merritt okamžitě přesunul své síly z Cavite a zakotvil do vzdálenosti 1 000 yardů (914 metrů) španělské pozice v Manile. V noci 31. července Španělé podrobili americké linie intenzivní puškové a dělostřelecké palbě a zabili 10 a zranili 43.
po několik následujících nocí byla ze španělských linií častá palba. 7. srpna společné vědomí od Dewey a Merritt byl poslán do španělské Gov. Fermín Jáudenes, což mu 48 hodin na evakuaci civilistů z Manila. Jáudenes odpověděl, že je obklopen aguinaldovou armádou a že neexistuje žádné útočiště pro nemocné a pro ženy a děti. Druhou společnou nótu požadující kapitulaci odmítl španělský velitel, který nabídl, že ji postoupí Madridu. To bylo odmítnuto a byly provedeny přípravy na útok.
uvnitř městského opevnění bylo 13 000 španělských vojáků, ale s deweyovou flotilou ovládající záliv a s sužující silou Američanů a Povstalců na břehu byl odpor beznadějný. Při kombinované pozemní a námořní útok byl proveden na 13. srpna, tam byl žádný velký odpor, a bílá vlajka byla vztyčena v 11:00, zhruba hodinu a půl poté, co flotila zahájila palbu. Následující den byla podepsána formální kapitulace.