Cleaver měl na starosti organizaci studentské konference na Fisk University v Nashvillu v Tennessee. Na konferenci se Cleaver setkal s ministrem informací pro stranu Black Panther, Eldridge Cleaver, který na konferenci hovořil. Právě se dostal z vězení a vydal Soul on Ice. Ona se přestěhovala do San Francisca, v listopadu 1967 se připojit k Black Panther Party, a to jen o měsíc a půl později, hned po Vánocích, Eldridge a Kathleen se oženil. Připojila se asi tři až čtyři týdny poté, co byl Huey Newton obviněn ze zabití policisty z Oaklandu v předem nakreslené přestřelce. To bylo v San Francisku, že Kathleen se stal Komunikace Tajemník strany a pracoval na organizování demonstrací, vytváření brožur, pořádání tiskových konferencí, vytváření plakátů, a mluví na shromážděních a v TELEVIZI. Cleaver aplikovala vše, co se naučila od SNCC, na stranu Black Panther. Pozici si vytvořila sama, motivovaná Julianem Bondem v SNCC. Navzdory skutečnosti, že více než dvě třetiny členů Black Panthers byly ženy, Cleaver byl jedním z mála, který zastával vedoucí pozice ve straně. Sekáčová se stala sekretářkou komunikace a první členkou rozhodovacího orgánu strany. Působila také jako mluvčí a tisková mluvčí. Zejména, organizovala národní kampaň za osvobození ministra obrany strany, Huey Newton, který byl uvězněn. Kathleen Neal Cleaver byla mezi malou skupinou žen, které byly prominentní ve straně Black Panther, který zahrnoval Elaine Brown a Ericka Huggins.
první velký útok proti Black Panther Party byl v 1960 Los Angeles vůbec první SWAT tým. Během několika let bylo v roce 1971 zabito téměř 30 členů strany black panther. Cleaver měl těžké uzdravení z odchodu tolika svých kolegů a byl emocionálně zjizvený. To, co jí nejvíce pomohlo, bylo jít do kořene toho všeho, což bylo zjištění, odkud pochází úzkost a trauma. Jak šel čas, tam byla skupina žen z Černých Panterů, včetně Sekáček, kteří by se sejít a probrat, co se jim stalo, obnovit své zdraví, a zotavit se z poranění a traumatické zážitky, které čelí V roce 1968 (ve stejném roce její muž kandidoval na prezidenta na Mír a Svobodu lístek) běžela pro Kalifornii je 18 státní okresní shromáždění, také jako kandidát strany Míru a Svobody. Cleaver získal 2 778 hlasů za 4,7% z celkového počtu hlasů a skončil třetí v závodě čtyř kandidátů.
v důsledku jejich zapojení s Black Panther Party, Sekáčky byly často terčem policejního vyšetřování. Sekáčky‘ byt byl vpadl v roce 1968 před Panther rally do San Francisco Taktické Komando na podezření, že skrývá zbraně a střelivo. Později téhož roku, Eldridge Cleaver představil úmyslné přepadení policistů v Oaklandu, během kterého byli zraněni dva policisté. Cleaver byl zraněn a kolega Black Panther člen Bobby Hutton byl zabit v přestřelce po počáteční výměně střelby. Obviněn z pokusu o vraždu, skočil na kauci, aby uprchl na Kubu a později odešel do Alžírska.
když se Cleaver vrátil do Spojených států, uvedl, že přestřelka byla úmyslným přepadením proti policii. Stejný autor, který zlomil zprávy o tomto tvrzení pochybovat, jeho pravdivost, protože to bylo v kontextu netypický projev, ve kterém Cleaver prohlásil „potřebujeme policii jako hrdinové,“ a řekl, že on odsoudil civilní recenzi desky z policejní střelby z důvodu, že „je to razítko za vraždu.“Autor spekuluje, že to mohlo být vyplatí Alameda County justice, jehož soudce jen dny dříve dal Eldridge Cleaver podmínku místo ve vězení; Sekáček byl odsouzen na komunitní služby poté, co dostal třikrát obviněn z útoku na tři Oaklandu policie. Dokument PBS příběh Huey Newton zjistí, že “ Bobby Hutton byl zastřelen více než dvanáctkrát poté, co se již vzdal a svlékl se do spodního prádla, aby dokázal, že není ozbrojen.“Během doby Kathleen Cleaverové s Black Panther Party pomáhala krmit lidi, poskytovala lékařskou péči rodinám a vzala rodiny na návštěvu blízkých ve vězení. Ona také „pomohl dát dohromady léčení ustoupí pro ženy, které byly v Black Panther Party, ženy, kteří žili v podzemí, kteří byli mučeni, který byl vyhoštěn“