tři dospívající chlapci byli obviněni z vraždy a spiknutí za účelem spáchání vraždy. Soudce rozhodl, že by měli být souzeni jako dospělí. Byli uvězněni po dobu šesti měsíců, protože státní zástupci se na ně připravovali. Nicméně, jak Treadway procesu mělo začít v lednu 1999, opožděný DNA testování zjistil, tři kapky Stephanie krev na košili patřící do Tuite. Na základě nových důkazů byla obvinění proti chlapcům zamítnuta, aniž by byla dotčena (což by umožnilo obnovit obvinění proti chlapcům později).
v rozpacích s obrácením Policie Escondido a okresní prokurátor v San Diegu nechali případ dva roky bez obvinění. V roce 2001 požádal okresní prokurátor a oddělení šerifa okresu San Diego, aby případ převzalo Kalifornské ministerstvo spravedlnosti. V květnu 2002 generální prokurátor obvinil Tuite z vraždy Stephanie. Proces začal v únoru 2004. První den výběru poroty, Tuite během polední hodiny odešel z Zadržovací nádrže soudní síně poté, co se osvobodil od pout; opustil soudní budovu a nastoupil do autobusu. Dopadli ho o několik hodin později. Na soud, trestní stíhání souvisí Tuite Stephanie zabíjí tím, že představuje oba nepřímé a fyzické důkazy, včetně důkazů, že Stephanie byla krev na jeho oblečení. Tuite obrana týmu tvrdil, že chlapce zabil, Stephanie, a že Stephanie byla nalezena krev na Tuite oblečení jako výsledek kontaminace způsobené neopatrný policejní práce. 26. května 2004 porota Tuiteho zprostila viny z vraždy, ale usvědčila ho z menšího trestného činu dobrovolného zabití. Porota také zjistila, že použil smrtící zbraň, nůž. Soud odsoudil Tuite k třinácti letům vězení. Následně si k trestu kvůli pokusu o útěk přidal další čtyři roky.
rodiny všech tří chlapců žalovaly města Escondido a Oceanside. V roce 2011 dosáhl Crowes vyrovnání ve výši 7,25 milionu dolarů. V roce 2012 soudce Vrchního soudu Kenneth tak učinil vzácné rozhodnutí, že Michael Crowe, Treadway a Houser jsou fakticky nevinní z obvinění, a trestní řízení proti nim trvale zamítl.
Tuite odvolal jeho odsouzení do Kalifornie Odvolacího Soudu a vychoval několik tvrzení, včetně tvrzení, že jeho Šestá Změna práva byla porušena, protože byl vyloučen z plně křížový výslech svědků obžaloby. 14. prosince 2006 odvolací soud potvrdil ve zdlouhavém nezveřejněném stanovisku. Soud shledal, že se zkušební soudce dopustil ústavní chyby při omezování křížového výslechu, ale považoval chybu za neškodnou a potvrdil přesvědčení. Nejvyšší soud Kalifornie zamítl přezkum. Federální okresní soud zamítl tuiteovu žádost o habeas corpus. V září 8, 2011, panel Odvolací Soud pro Devátý Obvod, zvolen 2-1 převrátit Tuite je zabití přesvědčení, rozhodnutí soudu bylo nespravedlivé, protože soudce omezen křížový výslech svědků obžaloby. Panel uvedl ve svém stanovisku, „Vzhledem k nedostatku důkazů vázání Tuite k trestné činnosti, problémy s DNA důkazy, porota patovou situaci a kompromisní verdikt, a hmotnost a strategické poloze McCrary svědectví, tento případ je jeden z těch „neobvyklých“ okolností, v nichž se ocitáme ve virtuálním rovnováha jako k neškodnosti chyba.“O‘ Neil v. McAninch, 513 U.S. 432, 435 (1995). Musíme považovat chybu za ovlivňující verdikt, a jsme nuceni vyhovět příkazu.“Tuite v. Martel, č. 09-56267. Bylo zjištěno, že během procesu obžaloba by neměla vyvolat žádné stopy dům na oblečení obžalovaného nebo osoba ani žádné stopy obžalovaného osoba nebo oblečení nalezené v domě, skutečností, že Odvolací Soud citované což vedlo k Soudu je stanovení nedostatek důkazů.
Tuite bylo uděleno obnovení řízení, které začalo 24. října 2013. V závěrečné řeči, jeho právník, Brad Patton, řekl porotcům, že Tuite nikdy nebyl v Crowe house, a nebyl by schopen najít Stephaniinu ložnici v temném domě. Vyšetřovatelé navíc v rezidenci nenašli jeho otisky ani DNA. Patton řekl, že Stephanie musela být držena pod přikrývkou, aby byla zticha, zatímco ji někdo bodl. On také řekl, že odborníci vypověděl, že skvrny od krve na Tuite košile nebyly tam, když ty košile byly původně hodnoceny, a dostal tam přes kontaminace během analýzy místa činu. Prokurátor, náměstek generálního prokurátora Alana Butler, řekl během své závěrečné řeči, že Tuite byl v oblasti domu Crowe v noci, kdy byla Stephanie zabita. Klepal na dveře a hledal ženu jménem Tracy, na kterou byl naštvaný, protože ho před pár lety odvrátila. Byl“posedlý a klamný“. Butler řekl, že Tuite putoval do domu Crowe kolem 10 hodin otevřenými dveřmi. Jakmile se dostal do domu, nedokázala říct, co přesně se stalo, ale on šel do Stephanie ložnice a bodl ji nejméně devětkrát, a její krev byla nalezena na dvě košile, které měl na sobě, když kontaktováni policie další den.
dne 5. Prosince 2013 porota vrátila verdikt neviny. Později, porotce řekl, že neexistují žádné důkazy o tom, že Tuite byl tu noc v rezidenci Crowe, a že porotci se obávali, že se krev oběti mohla dostat na jeho košile kontaminací, tak se na tuto možnost tvrdě podívali.