hoatsinin kuvasi alun perin saksalainen eläintieteilijä Statius Müller vuonna 1776. Hoatsinien suhteista muihin lintuihin on keskusteltu paljon. Erottuvuutensa vuoksi sille on annettu oma heimo Opisthocomidae ja oma alalahko Opisthocomi. Se on eri aikoina liittoutunut sellaisten taksonien kuin tinamien, Galliformes (gamebirds), kiskojen, bustardien, seriemojen, hietakyyhkyjen, kyyhkyjen, turakoiden ja muiden Cuculiformes-ja hiirulaisten kanssa. Vuonna 2014 julkaistu koko genomin sekvensointitutkimus sijoittaa hoatsinin Gruiformes-ja Charadriiformes-kladien sisarraksoniksi.
vuonna 2015 tehty geenitutkimus osoitti, että hoatsin on viimeinen elossa oleva jäsen lintulinjasta, joka haarautui omaan suuntaansa 64 miljoonaa vuotta sitten, pian lintuihin kuulumattomat dinosaurukset tappaneen sukupuuton jälkeen.
Fossiiliaineistoa
muista aineellisista todisteista voidaan todeta, että hoatsinin lähisukulaisen kiistaton fossiiliaineisto on yksilö UCMP 42823, yksi kallon takapuoli. Se on Mioseenilaista alkuperää ja sitä löydettiin Magdalena-joen laakson yläjuoksulta Kolumbiasta tunnetusta la ventan eläimistöstä. Se on sijoitettu erilliseen, vähemmän periytyvään hoazinoides-sukuun, mutta olisi selvästi sijoitettu samaan sukuun kuin olemassa oleva laji. Se eroaa huomattavasti siinä, että elävän hoatsinin kallo on tunnusomainen: se on paljon kupumainen, pyöristynyt ja lyhentynyt, ja että nämä autapomorfiat olivat mioseenilinnulla vähäisempiä. Miller käsitteli näitä havaintoja hoatzinien ja Galliformien oletetun yhteenliittymisen valossa, mikä oli tuohon aikaan suosittu hypoteesi, mutta oli ollut kiistanalainen lähes alusta lähtien. Hän kuitenkin varoitti, että” Hoazinoides ei missään tapauksessa Luo fyleettistä yhtymäkohtaa muiden galliformien kanssa ” ilmeisistä syistä, kuten me nykyään tiedämme. Mitään muuta kuin Millerin ensisijaisia havaintoja ei ole joka tapauksessa odotettavissa, sillä Hoazinoidesin aikoihin käytännössä kaikki nykyiset lintusuvut joko tunnetaan tai niiden uskotaan olleen olemassa ja erillisiä. Myöhäiseltä Eoseenilta tai varhaiselta Oligoseenilta (noin 34 miljoonaa vuotta sitten) peräisin olevaa Filholornisia on pidetty myös ”todisteena” hoatsinien ja gamebirdien välisestä yhteydestä. Fragmentaarinen fossiili Onychopteryx Argentiinan Eoseenilta ja melko täydellinen mutta yhtä arvoituksellinen varhaiskeski-eoseeni (Ypresian-Lutetian, noin 48 miljoonaa vuotta sitten) Foro panarium käytetään joskus argumentoida hoatsinin-cuculiform (mukaan lukien turacos) yhteys. Mutta kuten edellä on osoitettu, tätä on pidettävä erittäin spekulatiivisena, ellei jopa niin pahasti pielessä kuin Millerin käsittelemää suhdetta Cracidae-heimoon.
opisthocomiformes-lahkon varhaisin havainto on Protoazin parisiensis viimeisimmältä Eoseenilta (noin 34 mya) Romainvillestä Ranskasta. Lajin holotyyppi ja ainoa tunnettu yksilö on NMB PG.70, joka koostuu osittaisesta coracoidista, osittaisesta lapaluusta ja osittaisesta pedaalisesta falangista. Kirjoittajien suorittaman fylogeneettisen analyysin mukaan Namibiavis, vaikkakin myöhemmin, on Basaalisempi kuin Protoatsiini. Opistokoomibakteerit näyttävät aiemmin olleen paljon yleisempiä, nykyisen Etelä-Amerikan levinneisyyden ollessa vain jäänne. Mioseenin alku-ja keskivaiheilla ne olivat luultavasti jo hävinneet Euroopasta, sillä tälle ajalle ajoittuneet ja fluviaalisia tai lacustrisia paleoenympäristöjä edustavat muodostumat, joissa hoatsinit viihtyvät nykyään, ovat tuottaneet kymmeniä lintuyksilöitä, mutta ei opisthocomiformusta. Mahdollinen selitys Protoatsiinin häviämiselle myöhäisen Eoseenin ja varhaisen Mioseenin välillä Euroopassa ja Namibiaviksen häviämiselle Keskisen Mioseenin jälkeen Saharan eteläpuolisessa Afrikassa on arboreaalisten lihansyöjien saapuminen.saalistuksella olisi voinut olla tuhoisa vaikutus paikallisiin opisthocomiformeihin, jos ne olisivat olleet yhtä huonoja lentäjiä ja niillä olisi ollut yhtä haavoittuva pesimästrategia kuin nykyisillä hoatzineilla. Felidit ja viverridit saapuivat Eurooppaan ensimmäisen kerran Aasiasta Turgain meren sulkeuduttua, mikä merkitsi eoseenin ja Oligoseenin välistä rajaa. Mikään näistä petoeläimistä, ja itse asiassa, ei istukallisia petoeläimiä ollut lainkaan Etelä-Amerikassa ennen suurta Amerikan Interchange 3 mya, mikä voisi selittää hoatsinien selviytymisen siellä. Sen lisäksi, että Protoatsiini on varhaisin opisthocomiform-fossiililöydös, se oli myös varhaisin löydös yhdestä (1912), mutta se unohdettiin yli vuosisadaksi, sillä se kuvattiin vasta vuonna 2014.
Hoazinavis on sukupuuttoon kuollut varhaisten opisthocomiformisten suku Myöhäisoligoseenin ja varhaisen Mioseenin (noin 24-22 mya) kerrostumista Brasiliasta. Se kerättiin vuonna 2008 Tremembé-muodostelmasta São Paulosta Brasiliasta. Lajin nimesi ensimmäisenä Gerald Mayr, Herculano Alvarenga ja Cécile Mourer-Chauviré vuonna 2011 ja tyyppilaji on hoazinavis lacustris.
Namibiavis on toinen sukupuuttoon kuollut varhaisten opisthocomoformien suku varhaiskeski-Mioseenin (noin 16 mya) esiintymistä Namibiassa. Se kerättiin Arrisdriftistä, eteläisestä Namibiasta. Lajin nimesi ensimmäisenä Cécile Mourer-Chauviré vuonna 2003 ja tyyppilaji on Namibiavis senutae.