BetisEdit
Joaquín syntyi el Puerto de Santa Maríassa, Cádizin maakunnassa. Vuonna 1999-2000 hän aloitti senior uransa, esiintyy säännöllisesti Real Betis B (vietettyään kaksi vuotta nuorten riveissä) koska se lopulta putosi kolmannen divisioonan; seuraavalla kaudella hän siirtyi ensimmäinen joukkue, jolloin hänen ammatillinen debyyttinsä 3 syyskuuta 2000 ja jolla on välitön vaikutus – 38 ottelua ja kolme maalia – kuin andalusialaiset palasi La Liga yhden vuoden kuluttua ulos.
tämän jälkeen Joaquín keräsi seuraavien viiden vuoden aikana Betisille reilusti yli 200 virallista esiintymistä sekä avustaen että tehden maaleja. Aikana 2004-05 hän pelasi kaikki pelit pisteytys viisi kertaa, ja lisäsi kolme maalia kampanjan Copa del Rey: jälkimmäisessä, koska lopullinen pelattiin Vicente Calderón Stadium 11 kesäkuuta 2005, hän pelasi täydet 90 minuuttia plus lisäaikaa Betis voitti 2-1 vastaan CA Osasuna.
seuraavan kauden Mestarien liigassa Joaquín esiintyi Betisin kaikissa kuudessa lohkovaiheen ottelussa, mukaan lukien 1-0-voitossa Chelseasta ja 0-0-tasapelissä Liverpoolia vastaan Anfieldillä (kolmanneksi sijoittunut, UEFA Cupin ”demotion”).
heinäkuun lopulla 2006 Betisin puheenjohtaja José León kertoi Joaquínin kanssa käydyn keskustelun jälkeen pelaajan vakuuttaneen hänelle, että hän jää seuraan vielä vuodeksi. ”Se on yllättänyt minut paljon”, hän myönsi. ”Tulin vakuuttamaan hänet ja päinvastoin, hän on vakuuttanut minut”, hän lisäsi. Elokuun puolivälissä pelaaja aiheutti järkytyksen seurajohdossa ilmoittamalla lehdistötilaisuudessa lähtöaikeistaan.
ValenciaEdit
Joaquín pelaa Valencian joukkueessa 2010
Joaquínin oli tarkoitus siirtyä Valencia CF: ään elokuun alussa 2006 18 miljoonalla eurolla vaihtokaupassa, johon kuului myös Mario Regueiro. Maksuvaikeuksia kuitenkin ilmeni, ja uruguaylainen halusi pysyä Valenciassa, minkä vuoksi siirto viivästyi.
Joaquín lainattiin Albacete Balompiélle rangaistukseksi Betisin omistajalta Manuel Ruiz de Loperalta, koska pelaaja otti tietyn prosenttiosuuden siirtokorvauksesta. Lopera käytti sopimuksessaan pykälää, jonka mukaan hänet voitiin lainata mihin tahansa seuraan, jos Betis niin päätti (Joaquín matkusti uuden seuransa tiloihin omalla kuljetuksellaan ja todistaakseen tehneensä niin, hän valokuvatti itsensä lähistöllä työskentelevien agenttien toimesta. Vaihto peruttiin myöhemmin).
Joaquín siirtyi virallisesti Valenciaan elokuun lopulla 2006 25 miljoonalla eurolla, mikä teki hänestä seuran siihen mennessä kalleimman sopimuksen, sillä pelaaja teki viisivuotisen jatkosopimuksen. Ensimmäisenä vuotenaan hän pelasi 35 ottelua ja teki viisi maalia, kun Che selviytyi Mestarien liigan karsintoihin.
kaudella 2009-2010 Joaquín alkoi kilpailla ankarasti aloituspaikasta nuoremman Pablo Hernándezin haastamana; kampanjan aikana-Valencia pelasi myös UEFA Europa Leaguessa-molemmat pelaajat saivat suurin piirtein saman verran minuutteja ja tekivät yhteensä yhtä paljon maaleja.
David Villan lähdettyä FC Barcelonaan Joaquín sai pelipaidan numero 7 kaudeksi 2010-11. Hän johti pistepörssiä ensimmäisen kierroksen jälkeen napaten kahdesti 3-1-voiton Málaga CF: stä. Jäsenen 12 helmikuu 2011 hän teki toisen ahdin, auttaa Valencia tulla takaapäin Atlético Madrid voittaa sen 2-1, lopulta sijoittui kolmanneksi ja saada Mestarien liigan.
MálagaEdit
Joaquín tositoimissa Levantea vastaan 2011
24. kesäkuuta 2011 Joaquín jätti Valencian ja siirtyi Málagaan kolmeksi vuodeksi 4 miljoonan euron siirtosummalla. Hän debytoi seuran edustusjoukkueessa 28. elokuuta 1-2-vierastappiossa Sevilla FC: tä vastaan ja avasi pistetilinsä verkolla kahdesti toisessa paikallisderbyssä, 4-0-kotivoitossa Granada CF: ää vastaan.
lokakuun 2012 kahdessa kotiottelussa vain neljän päivän erolla Joaquín onnistui maalinteossa ja ratkaisi málagalle lopullisen voiton, molemmilla kerroilla jäätyään rangaistuspotkusta: hän aloitti Real Valladolidia vastaan (2-1) ja syötti ottelun ainoan osuman A. C. Milania vastaan Mestarien liigan lohkovaiheessa.
FiorentinaEdit
13.kesäkuuta 2013 lähes 32-vuotias Joaquín siirtyi ensimmäistä kertaa ulkomaille ja teki kolmivuotisen sopimuksen italialaisen ACF Fiorentinan kanssa. Hän teki debyyttinsä uudessa seurassaan 29. elokuuta 0-1-kotitappiossa Grasshopper Club Zürichiä vastaan Eurooppa-liigan pudotuspelikierroksella.
Joaquínin ensimmäinen maali Violalle tuli vaihtopelaajana 20. lokakuuta 2013 4-2-kotivoitossa Serie A: n mestarista Juventus FC: stä, ja toisen liigakauden ainoa voitto tuli S. S. C. Napolista 23.maaliskuuta. Hän oli myös mukana joukkueen paetessa loppuotteluun Coppa Italiaa vastaan 2-0-kotivoitolla A. C. Chievoveronasta 16.
paluu Betiseditiin
31.elokuuta 2015 Joaquín palasi Betisiin kolmivuotisella sopimuksella. Vuonna 2017 hän hankki 2 prosentin osuuden ensimmäisestä seurastaan.
15.syyskuuta 2019 Joaquín löysi maalipörssin 1-1-tasapelissä Getafe CF: ää vastaan ja merkkautti 400. esiintymisensä vihervalkoisille. hän oli myös Julio Cardeñosan kanssa Betisin eniten Espanjan pääsarjatasolla pelannut pelaaja numerolla 307. Jäsenen 8 joulukuuta, hän teki 18 minuutin hattutempun (ensimmäinen hänen pitkän uransa) 3-2 kotivoitto Athletic Bilbao, tulossa vanhin pelaaja koskaan saavuttaa feat La Liga iässä 38 vuotta ja 140 päivää, rikkoo edellinen ennätys 37 vuotta asettama Alfredo Di Stéfano vuonna 1964. Vuoden lopussa hän sopi jatkosopimuksesta vuoteen 2021 asti.
16.heinäkuuta 2020 2-1-kotitappiossa Deportivo Alavésille Joaquín teki 551. Espanjan pääsarjaottelunsa ja ohitti näin Raúlin eniten otteluita pelanneena laitapelaajana. Hänen edellään pysyi vain maalivahti Andoni Zubizarreta, 622.