kun, missä ja kuinka paljon geeni ilmaistaan, sitä säätelee ensisijaisesti CIS-säätelyjärjestelmän DNA-sekvenssien vuorovaikutus Trans-säätelytranskriptiotekijöiden (TFs) kanssa. Muutokset TF: n sitoutumiskohdissa edistävät tautitiloja, fenotyyppien monimuotoisuutta terveiden yksilöiden välillä ja eri lajien välisiä fenotyyppejä. Huolimatta niiden tärkeydestä, monet kysymykset ovat edelleen siitä, miten cis-sääntelyyn DNA-sekvenssien kääntää TF sitoutuminen transkriptiotoimintaan (Wittkopp and Kalay 2012). Keltaisten tehostajien nopea kehitys tarjoaa meille erinomaisen mahdollisuuden tutkia CIS-säätelysekvenssien kehitystä (Wittkopp et al. 2002; Gompel ym. 2005).
käyttäen reportterin geenejä D: ssä. melanogaster, havaitsimme, että kudoskohtaisten pigmenttigeenin keltaisten tehostajien sijainnit ovat muuttaneet kantoja perimässä lajien kesken (KS.Kuva) (Kalay and wittkopp 2010). Sekvenssianalyysin mukaan tämä johtui todennäköisemmin transkriptiotekijöiden sitoutumispaikkojen vähittäisestä lisääntymisestä ja häviämisestä kuin päällekkäisyyksistä tai uudelleenjärjestelyistä. Näin voimme käyttää näitä alueita vertailemaan DNA-sekvenssiä, TF-sidontaa ja cis-säätelytoimintaa sekvensseissä, jotka ovat itsenäisesti saaneet saman funktion, sekä ortologisissa DNA-sekvensseissä, joiden funktiot ovat eronneet toisistaan.
tällä hetkellä analysoimme (1) hiiva-1-hybriditietoja, joilla tunnistetaan TFS: ää, joka sitoutuu lajikohtaisiin keltaisen tehostajiin, (2) paikallistaa sekvenssejä, jotka vastaavat kudoskohtaisesta aktiivisuudesta kullakin tehostaja-alueella, ja (3) käytämme tästä työstä saatuja tietoja selvittääksemme vatsan kuviointia ohjaavia kehitysmekanismeja poikasten kehityksen aikana.