Polysomi

Elektronimikroskopiatekniikat, kuten värjäys, metallien varjostus ja erittäin ohuet solulohkot, olivat alkuperäisiä menetelmiä polysomin rakenteen määrittämiseksi. Kryoelektronimikroskopiatekniikoiden kehittyminen on mahdollistanut kuvan paremman resoluution, mikä on johtanut tarkempaan menetelmään rakenteen määrittämiseksi. Polyribosomien erilaiset rakenteelliset konfiguraatiot voisivat heijastaa moninaisuutta mRNAs: n kääntämisessä. Polyribosomaalisen muodon suhdetta tutkittaessa selvisi, että useiden käännöskierrosten jälkeen löydettiin suuri määrä pyöreä-ja siksak-polysomeja. Pidempiaikainen translaatio aiheutti tiheästi pakattujen 3-D-kierteisten polysomien muodostumisen. Eri solut tuottavat erilaisia polysomien rakenteita.

prokaryoottien

bakteerien polysomien on todettu muodostavan kaksirivisiä rakenteita. Tässä konformaatiossa ribosomit ovat yhteydessä toisiinsa pienempien alayksiköiden kautta. Näillä kaksirivisillä rakenteilla on yleensä ”sinimuotoinen” (siksak) tai 3-D kierteinen polku. ”Sinimuotoisessa” polussa pienten alayksiköiden välillä on kahdenlaisia kontakteja:” ylhäältä alas ”tai”ylhäältä alas”. 3D-kierteisessä polussa havaitaan vain” ylhäältä-ylös ” -kontakti.

Polysomeja esiintyy arkaiassa, mutta rakenteesta ei tiedetä paljoakaan.

eukaryoottiset polysomit

in cellsEdit

in situ (in cell) tutkimukset ovat osoittaneet, että eukaryoottiset polysomit ovat lineaarisia. Tiheästi pakattuja 3-D-heliseitä ja tasomaisia kaksirivisiä polysomeja löydettiin muuttuvine pakkauksineen, mukaan lukien prokaryoottisten polysomien kaltaisia” top-to-top ” – kontakteja. Eukaryoottiset 3-D-polyribosomit muistuttavat prokaryoottisia 3-D-polyribosomeja siinä, että ne ovat ”tiheästi pakattuja vasenkätisiä kierteitä, joissa on neljä ribosomia per kierros”. Tämä tiivis pakkaus voi määrittää niiden toiminnan translaation säätelijöinä, ja 3-D-polyribosomeja löytyy sarkoomasoluista fluoresenssimikroskopian avulla.

Cell freedit

in vitro-tutkimuksissa käytetty atomivoimamikroskopia on osoittanut, että ympyränmuotoisia eukaryoottisia polysomeja voi muodostua vapaasta polyadenyloidusta mRNA: sta aloitustekijän eIF4E ollessa sitoutuneena 5′ cap: hen ja PABP sitoutuneena 3′ – poly(A): n häntään. Kuitenkin tämä vuorovaikutus cap ja poly(a)-häntä välittämä proteiini monimutkainen ei ole ainutlaatuinen tapa kiertää polysomaalinen mRNA. On havaittu, että topologisesti ympyränmuotoiset polyribosomit voidaan translaatiojärjestelmässä muodostaa onnistuneesti mRNA: lla, jossa ei ole lakkia eikä Poly(A) häntää, sekä rajatulla mRNA: lla, jossa ei ole 3′-poly(A) häntää.

Kalvosidonnaisia

kalvoihin sitoutuneita Polyribosomeja rajoittaa kalvopinnan antama 2-ulotteinen tila. Ribosomien välisten kontaktien rajoittaminen aiheuttaa pyöreän muotoisen konfiguraation, joka järjestää ribosomit mRNA: ta pitkin niin, että sisään-ja ulostulopaikat muodostavat tasaisen reitin. Jokainen ribosomi kääntyy suhteessa edelliseen, muistuttaen planaarispiraalia.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.