Venustiano Carranza nem tett túl sok intézkedést az anti-papi cikkek érvényesítésére, azonban közben kb Obrega, a kormányzat és az egyházi hierarchia közötti ellenségeskedés jelentősen megnőtt. Obreg adapn kiutasított néhány spanyol papot az országból, valamint a pápai nunciust, Monsignor Ernesto Filippi. De ez volt Plutarco el ons Calles, Obreg Kb utódja 1924-ben, aki átvette az egyház fejét, hogy heves anti-klerikális ideológiát hozzon az elnökségbe. Határozottan reagált az egyházi hierarchia dacára, különösen az érsek nyilvános kijelentéseire Jos ons Mora y del Rio elítélve az alkotmány antiklerikális cikkeit. Calles templomokat és kolostorokat zárt be, és kétszáz külföldi papot deportált. Még egy püspököt is letartóztattak, bíróság elé állítottak és elítéltek, mert nyilvánosan ellenezte az ország törvényeit. Bevezette az új büntető törvénykönyvet, amely egy évtől öt évig terjedő büntetési tételt szabott ki azokra a papokra és papokra, akik bírálták a törvényeket, a hatóságokat vagy a kormányt. (Cam Enterprises & Meyer, p.87) alulról szerveződő csoportok gyorsan alakultak, hogy tiltakozzanak ezen akciók ellen. Ezek közé tartozott az Asociaci (Acjm), az Uni (up) és a Liga Nacional Defensora De La Libertad Religiosa (la Liga). Felháborodott püspökök jelentek meg a Kongresszus előtt a törvények visszavonására irányuló petícióval, de hiába.
július 25, 1926, a Mexikói Püspöki úgy döntött, hogy felfüggeszti az összes nyilvános istentisztelet. Attól a naptól kezdve a papok nem szolgáltak a szentségek egyikében sem, remélve, hogy felkeltik a közvélemény támogatását az egyház és Calles ellen. (Gonz xhamlez, p. 211) “a vallási szolgáltatások megtagadása mély válságot okozott a hívő katolikusok körében.”A felkelés bekövetkezte után azonban a magas papság nem adott politikai irányt a mozgalomnak, és a Vatikán még óvatosabb volt, félve a vallási elnyomástól, mint ahogy azt a francia és bolsevik forradalmak idején tapasztalták. Sok pap keresett menedéket a gazdag katolikusok otthonában a városi központokban, vagy egyszerűen elhagyták az országot. A vezetést a népi mozgalmakra bízták, különösen la Liga. A Krisztus vagy a Cristeros katonái által vezetett lázadások főként az ország középső és nyugati régióiban zajlottak: Michoac, Jalisco, Guanajuato y Colima, ahol az egyház a gyarmati idők óta erősen gyökerezik.
a Cristero katonai kiképzésének és ellátmányának hiánya miatt többnyire gerilla taktikákra támaszkodtak, amelyek megnehezítették a nemzeti hadsereg legyőzését. 1927 júliusában a la Liga toborzott egy volt Huertista tábornokot, Enrique Gorostieta, hogy összehangolják erőfeszítéseiket. Nem feltétlenül volt vallásos ember, inkább a forradalom által jogfosztott konzervatív erőket képviselte. Kiadott egy kiáltványt, amelyben követelte: “méltányos földreform a hacendados kártalanításával, valamint a reformtörvények visszavonásával, amelyek megfosztották az egyházat különleges bíróságaitól és haciendáitól.”(Gonz 615. o.) mivel Calles nem tudta elfojtani ezt a lázadást, később olyan férfiakhoz fordult, akik hasznot húztak a forradalom “földreformjából”, és támogatást kért tőlük. Bár a föld újraelosztása mindig is a forradalom elsődleges célja volt, a Föld továbbra is néhány hatalmas “Agrár hadúr” kezébe került.”Ezeket a hadurakat felkérték, hogy emeljenek “agrarista” zászlóaljakat, hogy segítsék a szövetségi csapatokat a Cristeros elleni küzdelemben.
1928-ban az Egyesült Államok nagykövete, Dwight Morrow közvetítőként szolgált a Vatikán, a Mexikói katolikus hierarchia és a Calles-kormány között a Cristero-probléma békés megoldására irányuló tárgyalások során. Ezeket a terveket azonban felfüggesztették, amikor még abban az évben Alvaro Obregot, a megválasztott elnököt meggyilkolta egy buzgó fiatal katolikus, a neve: Josuplicians de le Enterprises Toral. Calles ezután Don Emilio Portes Gil-t nevezte ki ideiglenes elnöknek, aki vállalja az új választások megszervezésének feladatát. Portes Gil elnöksége alatt Morrow nagykövet feltámasztotta a béketárgyalásokat, és 1929 júniusában megállapodás született Portes Gil és Leopoldo Ruiz y Flores érsek között, amely végül véget vetett a Cristero háborúnak. Michael Gonzales történész szerint ez keserédes kompromisszum volt, amelyben nagyon kevés volt igazán megoldva. Annak ellenére, hogy a háború alatt több tízezer ember vesztette életét, politikailag semmi alapvető nem változott. Az antiklerikális törvények megmaradtak az Alkotmányban, de a kormány nem hajtotta végre őket “az egyházzal szemben ellenséges módon.”Az elkövetkező években a szövetségi kormány egyre inkább kialakítja hegemóniáját a katolikus egyház felett, a papság azonban továbbra is ellenáll, amennyire csak lehetséges, a kormány oktatási és vallási reformokra irányuló kísérleteinek. Gonzales megjegyzi, hogy a “véres patthelyzet”, amelyben a háború véget ért, továbbra is megoldatlan maradt a katolicizmusban gyökerező hagyományos mexikói kultúra és a forradalmi kormány társadalmi reformjának céljai közötti konfliktusok között. (Gonzales, PP. 218-219)
— írta: Elizabeth Garcia és Mike McKinley, 2004. május