Eugene Science Center 1961-ben alakult, mint a Southwest Oregon Museum of Science and Industry (SWOMSI). A SWOMSI kezdeti támogatást kapott Anyaszervezetétől, Oregon tudományos és Ipari Múzeum (OMSI) Portland, de nem sokkal később független múzeum lett, amelynek Igazgatósága elsősorban helyi oktatókból állt.
SWOMSI először elfoglalta az Oregon Electric Railway Station, jelenleg az Oregon Electric Station étterem, található 5th Avenue és Willamette Street. A korai években az Oregon Electric Railway Station, SWOMSI kínált kiállítások és osztályok és futott Planetárium mutatja a Spitz Planetárium, a létesítmény által működtetett OMSI.
1973-ban, amikor a vasútállomás nem megfelelő, a Spitz Planetárium pedig hasznos élettartamának végéhez közeledik, a SWOMSI igazgatótanácsa felkereste a Lane Megyei biztosokat, hogy helyet kérjenek az újonnan létrehozott Alton Baker parkban. Az OMSI-tól való szünetet követően SWOMSI lett a Willamette tudományos és Technológiai Központ (WISTEC). Az új múzeum jelentős finanszírozását a Gazdaságfejlesztési Igazgatóság szerezte meg, és a konzorcium tagjai (Lane Community College, Lane Education Service District, University of Oregon és WISTEC) jelentősen hozzájárultak a projekthez, anyagilag és természetbeni szolgáltatások révén. Abban az időben az Oregon Electric vasútállomást eladták, és 50 000 dollár wistec alapot fektettek a jelenlegi épület építésébe az Alton Baker parkban.
1978-79 között épült a WISTEC épület és az új Planetárium. Amikor Eugene városa az 1980-as évek közepén átvette az irányítást az Alton Baker Park nagy részén, a wistec épület tulajdonjogát is átvette. A WISTEC jelenlegi helyén 1980-ban nyílt meg. A planetárium abban az időben funkcionálisan és pénzügyileg elkülönült a múzeumtól. A planetárium végül a Lane Education Service District kizárólagos felelősségévé vált, finanszírozási válság után 2002 decemberében bezárták. 2002 januárjában a WISTEC megváltoztatta nevét Tudományos gyárra, és a planetárium 2003-ban a Science Factory tulajdonába került, így a Science Factory Children ‘ s Museum & Planetárium lett. A név 2016-ban visszatért a Science Factory-ra, majd 2018 januárjában hivatalosan Eugene Science Center-re változott.