mikor, hol és mennyiben expresszálódik egy gén, azt elsősorban a cisz-szabályozó DNS-szekvenciák és a transz-szabályozó transzkripciós faktorok (TFs) kölcsönhatása szabályozza. A TF kötőhelyeinek változásai hozzájárulnak a betegség állapotához, az egészséges egyének fenotípusos sokféleségéhez és a fajok közötti eltérő fenotípusokhoz. Fontosságuk ellenére sok kérdés marad arról, hogy a cisz-szabályozó DNS-szekvenciák hogyan fordítják le a TF-kötést transzkripciós aktivitásra (Wittkopp and Kalay 2012). A sárga fokozók gyors fejlődése kiváló lehetőséget nyújt számunkra a cisz-szabályozó szekvenciák evolúciójának tanulmányozására (Wittkopp et al. 2002; Gompel et al. 2005).
riporter gének használata D-ben. melanogaster, felfedeztük, hogy a sárga pigmentációs gén szövetspecifikus fokozóinak helye megváltoztatta a genom helyzetét a fajok között (lásd az ábrát) (Kalay and Wittkopp 2010). A szekvenciaelemzés azt sugallta, hogy ez nagyobb valószínűséggel a transzkripciós faktor kötőhelyeinek fokozatos növekedése és elvesztése miatt következett be, mint a duplikációk vagy átrendeződések. Ez lehetővé teszi számunkra, hogy ezeket a régiókat összehasonlítsuk DNS szekvencia, TF kötésés cisz-szabályozó aktivitás olyan szekvenciák között, amelyek egymástól függetlenül megszerezték ugyanazt a funkciót, valamint az ortológ DNS-szekvenciák között, amelyek funkciói eltérnek egymástól.
jelenleg (1) elemezzük az élesztő-1-hibrid adatokat, amelyek azonosítják a TF-eket, amelyek kötődnek a sárga fajspecifikus fokozóihoz, (2) lokalizáljuk a szövetspecifikus aktivitásért felelős szekvenciákat az egyes fokozó régiókban, és (3) az ebből a munkából nyert információk felhasználásával tisztázzuk a hasi mintázatot szabályozó fejlődési mechanizmusokat a báb fejlődése során.