a bibliai beszámolóban, Miután az izraeliták befejezték Kánaán meghódítását, Józsué kiosztotta a földet a tizenkét törzs között. Kenneth Kitchen, egy jól ismert bibliai régész, ezt az eseményt valamivel ie 1200 utánra datálja, míg más tudósok vitatják Joshua könyvének történetiségét.
Naftali a Galilea keleti oldalán (a Galileai-tengertől közvetlenül nyugatra) telepedett le, azokon a területeken, amelyeket ma alsó-Galileának és felső-Galileának neveznek, nyugatról Asher, északon Dan, délen Zebulun, keleten pedig a Jordán folyó határolt. A legjelentősebb város Hazor volt.
a Galileai-tengerrel határos Genezáret rendkívül termékeny síksága volt, amelyet Josephus a természet ambíciójaként, földi paradicsomként jellemzett, és mivel a régió déli része természetes átjáróként működött Kánaán hegyvidékei között, több fő út (például Damaszkuszból Tiruszba és Acre-ba) futott át rajta. Az a jólét, amelyet ez a helyzet hozott, látszólag Mózes áldásában prófétálódik, bár a szöveges tudósok ezt posztdiktációnak tekintik, randevú a vers jóval azután, hogy a törzs létrejött a földön.
a Föld Józsué általi meghódítása után az első megalakulásáig Izrael királysága KR. e.1050-ben a Naftali törzse az izraelita törzsek laza Konföderációjának része volt. Központi kormányzat nem létezett, válság idején az embereket ad hoc vezetők vezették, akiket bíráknak neveztek (lásd a Bírák könyve). A Filiszteus betörések fenyegetésének növekedésével az izraelita törzsek úgy döntöttek, hogy erős központosított monarchiát alkotnak, hogy megfeleljenek a kihívásnak, Naftali törzse pedig Saullal, mint első királlyal csatlakozott az új Királysághoz. Saul halála után Júdán kívül minden törzs hű maradt Saul házához, de Ish-boshet, Saul fia és Izrael trónjának utódja halála után Naftali törzse csatlakozott a többi Észak-Izraelita törzshez, hogy Dávidot, aki akkor Júda királya volt, Izrael újra Egyesült Királyságának királyává tegye. E. 930-ban az északi törzsek elszakadtak Dávid házától, hogy megreformálják Izrael királyságát, mint Északi királyságot.
c. 732-ben Pekah szövetkezett Rezinnel, Arám királyával, megfenyegette Jeruzsálemet, Akház pedig Júda királya, III.Tiglát-Pileser asszír királyhoz fordult segítségért. Miután Akház adót fizetett Tiglát-Pilesernek, (2királyok 16:7-9) Tiglát-Pileser kifosztotta Damaszkuszt és Izraelt, annektálva Arámot és Izrael nagy részét, “beleértve Naftali egész földjét.”A 2királyok 16:9 és 15:29 szerint Arám lakosságát és Izráel elcsatolt részét Asszíriába deportálták. E. 723-ig létezett, amikor ismét megszállta Asszíria a lakosság többi részét pedig deportálták.
ettől kezdve Naftali törzsét Izrael tíz Elveszett törzsének egyikeként tartják számon. Zsoltárok 1:24