az argentin Patagónia száraz sztyeppei és a chilei Patagónia mérsékelt déli bükkösei közötti átmeneti zónában található Parque Patagonia egy sor ökoszisztémát foglal magában, beleértve a gyepeket, a parti erdőket és a vizes élőhelyeket.
az argentin Patagónia száraz sztyeppei gyepeit minimális csapadékmennyiség, hideg, száraz szél és homokos talaj jellemzi.Az Andok-hegység blokkolja a nedvességet a nyugati áramlástól, létrehozva ezt a száraz területet.Számos növény képes volt alkalmazkodni ehhez a zord környezethez, beleértve a cserjéket, mint a calafate,a quilembay és a yaoy GmbH, valamint a füves füveket, mint a flechilla és a Coir GmbH Poa. Ezek a gyepek támogatják a szívós állatokat, mint például a burrowing bagoly,a szürke róka, a tuco-tuco, a mara, az armadillos, a különböző sas és Sólyom fajok, valamint a keystone ragadozók, mint a puma.Az állatok széles köre virágzik a sivatag lakhatóbb külterületén és az Andok kifutójából kialakult mulandó tavak körül,ahol fák és táplálóbb vizes füvek nőhetnek.
nyugat felé haladva és az Andok-hegység függőleges lejtőjén mászva a park növény-és állatvilága jelentősen megváltozik.A táj erdőkké kezd átalakulni, amely többnyire a déli bükk (Nothofagus)nemzetség három fajából áll: lenga, ons és coiue. Itt a csapadék nagyon magas lehet, sűrű erdőket generálva, tele tápanyagokkala magas levél alomból. Ezekben az erdőkben 370 vaszkuláris növénynemzetség található, amelyek létfontosságúak a környező fauna túléléséhez.Néhány jelentős emlős közé tartozik a veszélyeztetett huemul szarvas, puma, vörös róka, és különböző denevérfajok. A Parque Patagonia erdeiben nagy változatosságú madárfajok is találhatók, köztük az andoki kondor, a Magellán harkály, a Szemüveges kacsa,a fekete nyakú hattyú, a törpe bagoly, a fekete arcú ibis, A Chilei flamingó, az Ausztrál negrito, a déli lapwing, valamint számos kétéltű és hüllő.
Patagóniában a guanaco, egy nagy teve, amely a láma vad rokona, a leggyakoribb herbivore.It a patagóniai sztyeppe összes növényfajának 75% – át táplálja.A guanaco kulcstartó fajként működik: megakadályozza a fűfajok dominanciáját, diszpergálóként ésműtrágyák, magas reprodukciós arányokkal rendelkezik, táplálékot biztosítva a helyi húsevőknek, különösen a pumáknak.
bár a park az Andok keleti oldalán fekszik, gleccserekkel táplált patakjai és folyói a Csendes-óceán felé futnak.Türkizkék vizük olyan őshonos halak jelentős populációinak ad otthont, mint a sügér(Percichthys trucha), a pejerrey patagonico (Patagonina hatcheri) és a puyen. Atlanti lazac, valamint patak, barna, ésrainbow pisztráng, bevezették a területre.