聖書の記述では、イスラエル人によるカナンの征服が完了した後、ヨシュアは十二部族の中に土地を割り当てました。 有名な聖書の考古学者であるケネス・キッチンは、この出来事を紀元前1200年以降のものとしているが、他の学者はヨシュア書の歴史性に異議を唱えている。
ナフタリはガリラヤの東側（ガリラヤ海のすぐ西）、現在は下ガリラヤと上ガリラヤと呼ばれる地域に定住し、西はアッシャー、北はダン、南はゼブルン、東はヨルダン川に接していた。 最も重要な都市はHazorでした。
ガリラヤ海に接し、ヨセフスが自然の野心、地上の楽園として特徴づけた非常に肥沃なジェンネサレット平野があり、地域の南部はカナンの高地の間の自然の峠として機能し、いくつかの主要道路（ダマスカスからタイヤやエーカーまでの道路など）がそれを通っていた。 この状況がもたらした繁栄は、モーセの祝福の中で預言されているように見えますが、テキストの学者はこれをpostdictionと見なし、部族が土地に設立された後の詩を年代測定しています。
ヨシュアによる土地の征服後から紀元前1050年にイスラエル第一王国が形成されるまで、ナフタリ族はイスラエル民族の緩やかな連合の一部であった。 中央政府は存在せず、危機の時には裁判官として知られるアドホックな指導者が人々を率いていた（裁判官の本を参照）。 ペリシテ人の侵略からの脅威の成長に伴い、イスラエルの部族は挑戦に対応するために強力な中央集権君主制を形成することを決定し、ナフタリの部族はサウルを最初の王として新しい王国に加わった。 サウルの死後、ユダ以外のすべての部族はサウルの家に忠実であったが、サウルの息子でイスラエルの王位の後継者であるイシュ＝ボシェトの死後、ナフタリの部族は他の北部イスラエルの部族に加わり、当時ユダの王であったダビデをイスラエルの再統一王国の王とした。 しかし、紀元前930年にダビデの孫であるレホボアムが即位すると、北の部族はダビデの家から分裂し、イスラエル王国を北の王国として改革した。
紀元前732年、ペカはアラムの王レジンと同盟してエルサレムを脅かし、ユダの王アハズはアッシリアの王ティグラト-ピレセル三世に助けを求めた。 AhazがTiglath-Pileserに敬意を表した後、(2王16:7-9)Tiglath-Pileserはダマスカスとイスラエルを解雇し、アラムとイスラエルの大部分を併合しました。”二王16:9と15:29によると、アラムの人口とイスラエルの併合された部分はアッシリアに追放されました。 イスラエル王国は紀元前723年まで存在し続け、再びアッシリアに侵略され、残りの人口は追放された。
その時から、ナフタリの部族はイスラエルの失われた10部族の一つに数えられている。 詩篇1:24