進化
最古のディプノイは、デボン紀初期のもので、特徴的なディプノイドであったが、シーラカンスのようなcrossopterygianと呼ばれる別のサルコプテリギアン群と共通する多くの特徴を持っていた。 ディプノイは三畳紀（約251.9万年前から201.3万年前）まで豊富であり、その後数は減少した。
最も古い肺魚の一つであるDipterusは、現代のオーストラリアの肺魚と同様の葉状の胸鰭および骨盤鰭を有しており、初期の形態も今日の種と同等の機能的な肺を有していたと仮定するのは妥当であると思われる。 円筒形の粘土の硬化した部分は、ペンシルベニアとペルム紀の時代（約323.2万年前から251.9万年前）の堆積物から発見されている。 現存するアフリカや南アメリカの種と密接に同盟している二枚貝Gnathorhizaの遺跡が粘土に埋め込まれていた。 このような状況での彼らの発見は、これらのジプノイドが泥に埋もれた不利な条件を通過したことを強く示唆している。
進化の系統は、現存するオーストラリアの属であるDipterusからNeoceratodusまでさかのぼることができます。 デボン紀後期（約3億8270万年前から3億5890万年前）のスカウメナシアとファネロプレウロンは、第一背鰭（第一背鰭）が大幅に縮小された（第二背鰭は拡大され、尾に向かってさらにシフトしていた）ことを示した。 ペルム紀の肺魚は背に沿ったフィンと垂直正中線の残りの部分の明らかな融合を示した。 この延長されたフィンは尾の先端の点まで先を細くし、現代の肺魚にも発生します。 ディプノイの進化にも様々な側枝が現れたが、これらのどれも現代に生き残っていない。
一部の科学者は、四肢動物（四肢の脊椎動物およびその子孫）に共通する歩行および境界行動が、筋甲殻類の魚で最初に進化したと主張している。 彼らは証拠として、現代のアフリカの肺魚、Protopterus annectensが、長い鰭を支持のために使用して、プールの底などの基質に沿って自分自身を推進する能力を挙げている。 フィンには数字が含まれていませんが、動物は足のような付属物のように機能するようにそれらを曲げることによって、基板からその体を持ち上げる 動物は日常的に四足歩行を採用していますが、時には二足歩行を採用することもできます。 四肢動物は筋足類の魚から生じたので、肺魚における歩行と境界行動の存在は、これらの形質が四肢動物の出現前に進化したことの証拠かもしれない。