스템 루프는 프리 마이크로 나 구조에서 발생하며 가장 유명하게 전송 아르 자형 유전자,여기에는 3 개의 진정한 스템 루프와 클로버 잎 패턴으로 만나는 하나의 스템이 포함됩니다. 번역 과정에서 코돈을 인식하는 안티코돈은 코돈의 페어링되지 않은 루프 중 하나에 있습니다. 두 개의 중첩 된 줄기 루프 구조는 아르 자형 슈도 노츠,여기서 한 구조의 루프는 두 번째 줄기의 일부를 형성합니다.
많은 리보 자임은 또한 줄기 루프 구조를 특징으로합니다. 자기 절단 귀상어 리보 자임은 분열 사이트 거짓말 중앙 페어링되지 않은 지역에서 만나는 세 줄기 루프가 포함되어 있습니다. 귀상어 리보 자임의 기본 2 차 구조는 자기 절단 활동에 필요합니다.
머리핀 루프는 종종 원핵 생물의 5 피트 내에서 발견되는 요소입니다. 이러한 구조는 종종 단백질에 의해 바인딩 또는 번역을 조절하기 위해 성적 증명서의 감쇠를 일으킬 수 있습니다.
리보솜 결합 부위에서 형성되는 미르나 스템-루프 구조는 번역의 개시를 제어할 수 있다.
줄기-루프 구조는 또한 원핵 생물 로-독립적 전사 종결에 중요하다. 머리 핀의 자형 루프 전사 하는 동안 밀리나 가닥에 형성 하 고 리나 중 합 효소 리나 템플릿 가닥에서 해리 될 수 있습니다. 이 프로세스는 로 독립 또는 고유 종료로 알려져 있으며 관련된 시퀀스를 터미네이터 시퀀스라고합니다.