den opprinnelige patent som er grunnlaget for nCounter Analysis System ble oppfunnet og lisensiert fra Institute For Systems Biology. Forretningsplanen ble skrevet Av Amber Ratcliffe Og Aaron Coe og vant seed finansiering i flere forretningsplan konkurranser. NanoString ble spunnet ut Av Institute For Systems Biology og grunnlagt som et eget selskap i 2003 Av Krassen Dimitrov, Amber Ratcliffe og Dwayne Dunaway.
I 2004 hevet NanoString sin første betydelige finansiering i en $4,3 M serie a finansiering. De har siden reist flere finansieringsrunder for å utvide seg til utviklingen av molekylær diagnostikk. Per 2011, Hadde NanoString Technologies hevet nesten $70M med sin serie D.
I 2009, Perry Falt Som hadde vært ADMINISTRERENDE DIREKTØR siden 2004, forlot selskapet brått og uten offisiell forklaring. Mellom 2009 og 2010 opererte Selskapet Med En fungerende ADMINISTRERENDE DIREKTØR, Wayne Burns. Brad Gray, En Tidligere Genzyme executive, ble ansatt som president og ADMINISTRERENDE DIREKTØR i 2010.
Per juni 2010 var selskapet ennå ikke lønnsomt. I et intervju foreslo Gray At NanoString ville begynne å utvikle klinisk diagnostikk. Per juli 2012 Begynte NanoString indikerer et trekk mot å bli et offentlig selskap ved å ansette flere ledende ansatte med offentlig selskap erfaring. NanoString fikk EN CE – merkebetegnelse for å selge Prosigna breast cancer prognostic gene signature assay (PAM50-basert brystkreft test) I Israel og EU i September 2012, Og i September 2013 Mottok NanoString FDA 510 (k) clearance For Prosigna.
i 2013, selskapets BØRSNOTERING hevet $ 54 millioner som ble brukt til å utvide NanoString salg og markedsføring. Som et resultat, Har NanoString inntekter økt med 52% i 2014-2015 regnskapsåret.