Fem typer zymogener av pepsiner, gastrisk fordøyelsesproteinaser, er kjent: pepsinogener A, B og F, progastricsin og prochymosin. Aminosyre-og / eller nukleotidsekvensene av mer enn 50 pepsinogener enn pepsinogen B har blitt bestemt til dags dato. Fylogenetiske analyser basert på disse sekvensene indikerer at progastricsin divergerte først etterfulgt av prochymosin, og at pepsinogener A Og F er nært beslektet. Tertiære strukturer, avklart Ved røntgenkrystallografi, er vanligvis bilobale med en stor aktiv-site kløft mellom lobene. To aspartater I midten Av spalten, Asp32 Og Asp215, fungerer som katalytiske rester, og dermed klassifiseres pepsinogener som asparaginaser. Konvertering av pepsinogener til pepsiner foregår autokatalytisk ved sur pH ved to forskjellige veier, en ett-trinns vei for å frigjøre det intakte aktiveringssegmentet direkte, og en trinnvis vei gjennom et pseudopepsin (er). Den aktive-site kløften er stor nok til å romme minst syv rester av et substrat, og dermed danner S4 Gjennom S3 ‘ subsites. Hydrofobe og aromatiske aminosyrer foretrekkes I p1-og P1-posisjonene. Interaksjoner ved andre sekundære områder er viktige i noen tilfeller, for eksempel ved spalting av κ-kasein av chymosin. To potente naturlig forekommende hemmere er kjent: pepstatin, et pentapeptid Fra Streptomyces, og en unik proteinøs hemmer Fra Ascaris. Pepsinogen-gener omfatter ni eksoner og kan være flere, spesielt for pepsinogen A. Sistnevnte og progastricsin dominerer hos voksne dyr, mens pepsinogen F og prochymosin er hovedformene hos fosteret / spedbarnet. Bytte av genuttrykk fra foster/spedbarn til voksen-type pepsinogener under postnatal utvikling er bemerkelsesverdig, regulert av flere faktorer, inkludert steroidhormoner.