Morgan diende als persoonlijke archivaris en bibliograaf van Ginsberg van de vroege jaren ‘ 80 tot de dood van de auteur aan kanker in 1997. Over hun 20-jarige professionele relatie, Morgan werd vrij dicht bij Ginsberg, en heeft uitgebreid geschreven over de Beat generatie en de belangrijkste cijfers.Bill Morgan ‘ s interesse in de Beats gaat terug tot het begin van de jaren zeventig, toen hij naar school ging aan de Universiteit van Pittsburgh. Voor zijn masterscriptie schreef hij een bibliografie van de werken van Lawrence Ferlinghetti, dichter en eigenaar van City Lights Books, de beroemde San Francisco Boekwinkel en een van de belangrijkste uitgevers van de vroege Beat schrijvers, met name Allen Ginsberg. Na het afronden van zijn proefschrift, Morgan werd aangemoedigd door de redacteuren van de University Of Pittsburgh Press om dit project voort te zetten met het oog op de uiteindelijke publicatie. Hij zette zijn onderzoek inderdaad voort, in nauwe samenwerking met Ferlinghetti als zijn persoonlijke bibliograaf, en na een decennium van onderzoek publiceerde hij Lawrence Ferlinghetti: A Comprehensive Bibliography (New York: Garland Publishing, 1982).In 1980 verhuisde Morgan naar New York City. Terwijl hij nog bezig was met het Ferlinghetti boek, had de dichter van San Francisco hem doorverwezen naar Allen Ginsberg, wiens eigen persoonlijke bibliotheek en archief van onschatbare waarde waren bronnen van informatie over de Beats. Vroeg overleg met de dichter groeide uit tot een blijvende relatie die duurde van de vroege jaren 1980 tot Ginsberg ‘ s dood in 1997. Gedurende deze jaren werkte Morgan als Ginsbergs archivaris en bibliograaf, waarmee hij de dichter hielp bij het organiseren en onderhouden van zijn steeds groeiende bibliotheek en archieven. Als bibliograaf van Ginsberg besteedde Morgan vijftien jaar aan het corresponderen met en bezoeken aan tal van uitgevers, redacteuren, geleerden en bibliotheekcollecties om voldoende informatie te verzamelen om de geschiedenis van Ginsberg ‘ s wonderbaarlijke werk en de wereldwijde aandacht die het heeft getrokken te documenteren. De resultaten van zijn onderzoek verschenen in een tweedelige bibliografie: The Works of Allen Ginsberg, 1941-1994: A Descriptive Bibliography and The Response to Allen Ginsberg, 1926-1994: A Bibliography of Secondary Sources (Westport, Conn.: Greenwood Press, 1995, 1997). In 2006 publiceerde Morgan I Celebrate Myself: The Somewhat Private Life of Allen Ginsberg (New York: Viking, 2006). Hij volgde dat in 2010 met The typemachine is Holy: The Complete, Uncensored History of The Beat Generation (New York, NY: Free Press, 2010).Morgan heeft ook een half dozijn andere werken met betrekking tot de Beats geschreven of geredigeerd, waaronder collecties van Ginsberg ’s essays (Deliberate Prose: Selected Essays, 1952-1995, New York: HarperCollins, 2000), van The poet’ S last poems (Death & Fame: Poems, 1993-1997; samen met Bob Rosenthal en Peter Hale, New York: HarperFlamingo, 1999), en van Gregory Corso ‘ s correspondence (An Accidental Autobiography: the Selected Letters of Gregory Corso, new york: new directions, 2003). Via City Lights in San Francisco heeft hij twee gidsen gepubliceerd, The Beat Generation in New York. : A Walking Tour of Jack Kerouac ‘ s City (1997) en The Beat Generation in San Francisco: A Literary Tour (2003). De laatste verscheen tijdens de vijftigste verjaardag van City Lights, waaraan Morgan ook bijdroeg met een reeks gratis wandeltochten door het North Beach gedeelte van San Francisco, ooit een centrum van bohemien leven in de stad en thuis voor veel van de Beats in de jaren 1950 en 1960.
in de loop van zijn decennia van onderzoek naar de Beats, verzamelde Morgan misschien wel de grootste privécollecties van gedrukte werken van en over Ferlinghetti en Ginsberg in privé handen. Hij vond het steeds moeilijker om deze twee zeer grote en waardevolle collecties in zijn appartement in New York te onderhouden, en besloot met tegenzin om ze te delen. Wetende dat Ferlinghetti een UNC-Chapel Hill alumnus was, besloot hij in de herfst van 2001 om zijn collectie van de San Francisco poet aan te bieden aan de Universiteit van North Carolina in Chapel Hill libraries. Gesprekken met bibliotheekambtenaren leidden tot de overdracht van de collectie naar Chapel Hill in December van dat jaar, deels als verkoop en deels als geschenk. Tevreden met het resultaat, Morgan bood vervolgens een soortgelijk arrangement voor zijn nog uitgebreidere Allen Ginsberg collectie. Het materiaal werd geleverd aan de Rare Book Collection in Wilson Library in augustus 2002.