De invloed van aërobe en anaërobe omstandigheden op de overleving van de enteropathogens Escherichia coli O157:H7 en Salmonella serovar Typhimurium werden onderzocht in microkosmos met bouillon, rundermest of drijfmest. Deze substraten werden geïnoculeerd met een groene fluorescente eiwit getransformeerde stam van de enteropathogenen bij 107 cellen G−1 drooggewicht. De overlevingsdata werden aangepast aan het Weibull model. De overlevingskrommen in aërobe omstandigheden vertoonden over het algemeen een concave kromming, terwijl de kromming convex was in anaërobe omstandigheden. De geschatte overlevingstijden toonden aan dat E. coli O157:H7 significant langer overleefde onder anaerobe omstandigheden dan onder aerobe omstandigheden. De overleving varieerde van ongeveer. 2 weken voor aërobe mest en drijfmest tot meer dan zes maanden voor anaërobe mest bij 16 °C. Gemiddeld was bij 56,3% van de monsternemingen het aantal teruggewonnen E. coli O157:H7 cellen door anaërobe incubatie van Petrischalen significant (p < 0,05) hoger in vergelijking met aërobe incubatie. De overleving van Salmonella serovar Typhimurium verschilde niet tussen aerobe en anaerobe opslag van LB bouillon of mest en tussen aerobe en anaerobe incubatie van petrischaaltjes. Het belang van veranderingen in microbiële gemeenschap en chemische samenstelling van mest en drijfmest werd onderscheiden voor de overleving van E. coli O157:H7 in verschillende zuurstofomstandigheden.