Parque Patagonia ligt in de overgangszone tussen de droge steppe van Argentijns Patagonië en de gematigde Zuidelijke beukenbossen van Chileens Patagonië en omvat een reeks ecosystemen, waaronder grasland, oeverbossen en Wetland.
de droge steppegraslanden van Argentijns Patagonië worden gekenmerkt door minimale regenval, koude, droge wind en zandgrond.Het Andesgebergte blokkeert vocht uit het westen, waardoor dit dorre gebied ontstaat.Een aantal planten hebben zich kunnen aanpassen aan deze barre omgeving, waaronder struiken zoals calafate, quilembay en yaoyín,en tuft grassen zoals flechilla en coirón poa. Deze graslanden ondersteunen winterharde dieren zoals de gravende uil,de grijze vos, tuco-tuco, mara, gordeldieren, verschillende Arend-en haviksoorten en keystone roofdieren zoals de puma.Een breed scala aan dieren gedijen in de meer bewoonbare buitenwijken van de woestijn en rond vluchtige meren gevormd uit de Andes ‘ runoff, waar bomen en meer voedzame waterige grassen kunnen groeien.
Als u naar het westen gaat en de verticale helling van het Andesgebergte beklimt, verandert de flora en fauna van het park aanzienlijk.Het landschap begint te veranderen in bossen, die meestal bestaat uit drie soorten van de Zuidelijke beuk (Nothofagus)geslacht: lenga, ñire, en coiue. Hier kan de regenval erg hoog zijn, waardoor dichte bossen ontstaan, vol voedingsstoffen van hoogbladvuil. Deze bossen Herbergen 370 vasculaire plantengeslachten, die van vitaal belang zijn voor het voortbestaan van de omliggende fauna.Enkele belangrijke zoogdieren zijn de bedreigde huemul herten, puma, rode vos, en verschillende soorten vleermuizen. De bossen van Parque Patagonia bevatten ook een grote diversiteit aan vogelsoorten, waaronder de Andes condor, Magelhaense specht, Brileend,Zwartkopzwaan, pygmeeuil, Zwartkop ibis, Chileense flamingo, Austral negrito, Zuidelijke kievit en een scala aan amfibieën en reptielen.In heel Patagonië is de guanaco, een grote kamelide die een wilde verwant is van de lama, de meest voorkomende herbivore.It leeft op 75% van alle plantensoorten in de Patagonische steppe.De guanaco fungeert als een hoeksteen soort: het voorkomt dominantie van grassoorten, werkt als een disperger enbevrucht, en heeft hoge reproductieve tarieven, het verstrekken van voedsel voor lokale carnivoren, vooral Puma ‘ s.
hoewel het park aan de oostelijke kant van de Andes ligt, lopen de door gletsjers gevoede beken en rivieren richting de Grote Oceaan.Hun turquoise blauwe water is de thuisbasis van aanzienlijke populaties van inheemse vissen zoals baars (Percichthys trucha), pejerrey patagonico (Patagonina hatcheri) en puyen. Atlantische zalm, maar ook Beek, bruine forel, andrainbow forel, zijn geïntroduceerd in het gebied.