de terugkeer van Aguinaldo en de inname van Manilla
op 4 mei stuurde Dewey een telegram dat op 7 mei in Washington werd ontvangen: “I control bay completely, and can take city at any time, but I have not sufficient men to hold.”De kruiser USS Charleston en de stoomboot USS Peking, met munitie, voorraden en troepen, moesten onmiddellijk naar Manilla worden gezonden. Generaal-Majoor. Wesley Merritt, die het bevel kreeg over de grondoperatie, vroeg aanvankelijk om een leger van ongeveer 14.000 man, maar verhoogde dit later tot 20.000 man. Op 25 mei voer brigadegeneraal T. M. Anderson en de 2491 Amerikaanse troepen onder zijn bevel in drie transporten vanuit San Francisco en sloot zich aan bij een konvooi met de USS Charleston bij Honolulu.Terwijl de Amerikanen hun troepen verzamelden, kondigde de Filipijnse verzetsleider Emilio Aguinaldo aan dat hij zijn strijd tegen Spanje zou hervatten. Aguinaldo leefde in zelf opgelegde ballingschap als onderdeel van een overeenkomst met de Spaanse autoriteiten, maar hij nam contact op met de Amerikanen en bood zijn hulp aan in hun militaire campagne. Door een Amerikaans schip vanuit Hongkong landde Aguinaldo op 19 mei bij Cavite, verzamelde zijn aanhangers en veroverde onmiddellijk enkele steden ten zuiden van Manilla. Hij verklaarde de onafhankelijkheid van de Filipijnen Op 12 juni en werd president van de Filipijnse Republiek. Aguinaldo ‘ s acties werden niet goedgekeurd door de Amerikanen, maar er was weinig dat ze konden doen om zijn vooruitgang te vertragen. Aan het hoofd van een groot opstandelingenleger, begon Aguinaldo een nauwe belegering van Manilla.Op 20 juni pauzeerde het USS Charleston konvooi naar shell en nam bezit van het eiland Guam alvorens verder te reizen en aan te komen in de Baai van Manilla op 30 juni. Een tweede detachement, 3.586 troepen onder leiding van brigadegeneraal F. V. Greene, arriveerde op 17 juli en Merritt, die benoemd was tot gouverneur-generaal, bereikte de Baai van Manilla op 25 juli. Op 31 juli arriveerden er nog vijf transporten met 4.847 man, waardoor de totale Amerikaanse troepensterkte bij Manilla op bijna 11.000 kwam, met nog eens 5.000 onderweg. Merritt verplaatste onmiddellijk zijn troepen van Cavite en verschanste zich binnen 1.000 meter (914 meter) van de Spaanse positie bij Manilla. In de nacht van 31 juli onderwierpen de Spanjaarden de Amerikaanse linies onder vuur, waarbij 10 doden vielen en 43 gewonden vielen.
gedurende de volgende nachten werd er vaak geschoten vanaf de Spaanse Linies. Op 7 augustus werd een gezamenlijke nota van Dewey en Merritt gestuurd naar de Spaanse gouverneur Fermín Jáudenes, die hem 48 uur gaf om niet-strijders uit Manilla te evacueren. Jáudenes antwoordde dat hij omringd was door Aguinaldo ‘ s leger en dat er geen toevluchtsoord was voor de zieken en voor de vrouwen en kinderen. Een tweede gezamenlijke nota om overgave te eisen werd afgewezen door de Spaanse commandant, die aanbood om het naar Madrid te verwijzen. Dit werd geweigerd en er werden voorbereidingen getroffen voor een aanval.Er waren 13.000 Spaanse troepen binnen de vestingwerken, maar met Dewey ‘ s vloot die de baai controleerde en met de belegerende troepen van Amerikanen en opstandelingen aan land, was het verzet hopeloos. Toen de gecombineerde grond-en marineaanval op 13 augustus plaatsvond, was er geen grote weerstand en werd om 11:00 uur een witte vlag gehesen, ongeveer anderhalf uur nadat de vloot het vuur opende. De volgende dag werd een officiële capitulatie ondertekend.