popularna historia HIV / AIDS opisuje człowieka znanego jako Pacjent Zero, seksualnie aktywną stewardessę, która podróżowała po świecie i zapoczątkowała epidemię AIDS w Ameryce Północnej. Nowa analiza genomu wirusa odzyskanego z jego surowicy i innych pacjentów w latach 70. dowodzi ponad wszelką wątpliwość, że nie był pacjentem Zero (link do papieru).
w heroicznym wysiłku tysiące zarchiwizowanych próbek surowicy pierwotnie pobranych od kohort mężczyzn uprawiających seks z mężczyznami w latach 70. W Nowym Jorku i San Francisco, zbadano pod kątem obecności HIV za pomocą analizy western blot. W sumie 83 próbki okazały się HIV dodatnie i poddane głębokiemu sekwencjonowaniu, ale wirusowy RNA został zdegradowany i obecny tylko w krótkich kawałkach. Aby rozwiązać ten problem, użyto wielu starterów DNA do amplifikacji krótkich fragmentów RNA metodą PCR w procedurze barwnie zwanej „młotkiem pneumatycznym”. Imponujący wynik jest taki, że kompletne sekwencje kodujące HIV – 1 uzyskano z 8 próbek: 3 Z San Francisco i 5 z Nowego Jorku.
analiza sekwencji genomu HIV i porównanie z wcześniejszymi i późniejszymi danymi ujawniły, że wirus prawdopodobnie podróżował z Afryki na Karaiby około 1967 roku, a stamtąd do Nowego Jorku w 1971 roku. Wyniki te obalają wcześniejsze pomysły, że HIV przybył na Karaiby z USA.
analiza sekwencji ujawnia również, że Nowy Jork był ośrodkiem wczesnego zróżnicowania HIV i że epidemia była już dojrzała i zróżnicowana genetycznie pod koniec lat 70. wydaje się, że doszło do pojedynczego wprowadzenia HIV do San Francisco z Nowego Jorku w 1976 roku. Z tych dwóch miast wirus rozprzestrzenił się gdzie indziej w USA i za granicą.
zasugerowano, że seksualnie aktywna stewardessa, zidentyfikowana jako Gaetan Dugas przez Randy 'ego Shiltsa w jego książce „the Band Played On”, była źródłem północnoamerykańskiej epidemii AIDS. Chociaż co najmniej jedno badanie lata temu stwierdziło, że nie był to pierwszy przypadek, przekonanie to utrzymuje się. Sekwencjonowanie HIV z surowicy tego pacjenta wykazało, że z pewnością nie był pierwszą osobą w Ameryce Północnej zakażoną tą linią HIV-1 (Grupa m, Podtyp B) .
historyczna rekonstrukcja pierwszych dni AIDS w USA pokazuje, jak Dugas zdobył Etykietę „Pacjent Zero”. Śledczy CDC, którzy badali sieć seksualną 40 gejów, umieścili w jej centrum jednego mężczyznę, którego nazwali „pacjentem O”, co oznacza „poza Kalifornią”, ponieważ był Kanadyjczykiem (na zdjęciu; wizerunku). Po opublikowaniu tej pracy „O” zostało błędnie zinterpretowane jako zero i tak zaczęło się przekonanie, że to on jest źródłem epidemii AIDS w Ameryce Północnej.