przed powstaniem stanu, kongregacje Baptystyczne w pobliżu Natchez zorganizowały się we wrześniu 1807 w stowarzyszenie w Kościele Bethel na Bayou Sara, chociaż w poprzednim roku w kościele Salem sześć zborów spotkało się w tym samym celu. Mississippi Baptist Association przyjęło „articles of faith & gospel order” i opublikowało ich obrady w następnych latach z wieloma odniesieniami do Thomasa Mercera i Davida Coopera.
druga organizacja pod tytułem Konwent. Pierwsza Konwencja Baptystów z Missisipi trwała zaledwie pięć lat, od lutego 1824, kiedy po raz pierwszy spotkała się w Kościele Bogue Chitto w hrabstwie Pike, do 1829, po napotkaniu tak dużego oporu, że uzgodniono, że zostanie rozwiązana w 1828.
drugi zjazd powstał w dniach 23-4 grudnia 1836 roku. Jej pierwszym prezesem został Ashley Vaughan, a pierwszym odpowiadającym jej Sscretary S. S. Lattimore. Lattimore był jeszcze jego prezesem w 1852 roku. Odpowiednim sekretarzem w tym roku był W. J. Denson, a sekretarzem nagrywającym J. T. Freman.
w 1857 roku Konwent założył gazetę The Mississippi Baptist, której redaktorem był J. T. Freeman.
w tym samym roku Konwent wyraził swoją opinię na temat zniesienia niewolnictwa, mówiąc, że jest to próba „umniejszenia społecznych, cywilnych i religijnych przywilejów ludności niewolniczej”. Kościoły baptystyczne w państwie od kilku lat praktykowały segregację. Konwent poinformował w 1938 roku, że ” kilka naszych Kościołów, a niektórzy z naszych przyjaciół Metodystów, przyjęło plan zorganizowania oddzielnych spotkań dla czarnych; i że taki kurs jest ogólnie uczęszczany ze zwiększonym zainteresowaniem wśród nich”.
Stowarzyszenia Kobiet były jednymi z największych finansowych zwolenników konwentu na początku XIX wieku. W 1875 Konwent formalnie uznał organizacje kobiece.