niszczenie i degradacja tropikalnych lasów deszczowych, w szczególności lasów nizinnych, na Borneo i Sumatrze jest głównym powodem, dla którego orangutany są zagrożone wyginięciem.
jest to spowodowane przede wszystkim działalnością człowieka (intensywny nielegalny Wyręb drewna, przekształcanie lasów w plantacje oleju palmowego i posiadłości drewniane, Górnictwo, oczyszczanie lasów pod osadnictwo i budowa dróg), a także wielkimi pożarami sprzyjającymi zjawiskom pogodowym w El Nino. Ponadto nielegalny handel zwierzętami przyczynił się do spadku populacji dzikich orangutanów. W końcu orangutany są sporadycznie polowane i zjadane przez część rdzennych mieszkańców Borneo, a także migrujących drwali i pracowników plantacji, którzy nie mają dietetycznych zakazów jedzenia buszu naczelnych.
nielegalne pozyskiwanie drewna (Gunung Leuser National Park) Photo © Ruwindrijarto/Environmental Investigation Agency
w pewnym momencie populacja dzikich orangutanów na świecie prawdopodobnie wzrosła do setek tysięcy osobników, ale obecne szacunki wskazują na znacznie mniejszą liczbę dzikich orangutanów. W ciągu ostatniej dekady populacje orangutanów zmniejszyły się prawdopodobnie o 50% w stanie dzikim. Chociaż zmiany klimatu w przeszłości mogły być odpowiedzialne za część tego spadku, orangutany są zagrożone głównie działalnością człowieka i rozwojem, które powodują utratę i degradację ich siedlisk leśnych. Obecnie Iunc sklasyfikowało Orangutan borneański i sumatrzański jako krytycznie zagrożony
najnowsze szacunki wielkości i rozmieszczenia populacji orangutanów można znaleźć na stronie internetowej Czerwonej Listy Gatunków Zagrożonych IUCN. Według Czerwonej Listy IUCN w stanie dzikim żyje około 14 600 orangutanów sumatrzańskich (Pongo abelii). Orangutan borneański (Pongo pygmaeus) zamieszkuje około 104 700 osobników. Ze względu na znaczną utratę siedlisk orangutanów na obu wyspach, jest prawdopodobne, że obecne liczby na obu wyspach są w rzeczywistości niższe od tych podanych na Czerwonej Liście IUCN. Około 2000-3000 orangtuanów borneańskich było zabijanych każdego roku w ciągu ostatnich czterech dekad, co stanowiło stratę ponad 50% pierwotnej populacji w ciągu zaledwie 40 lat. Przy takim tempie zabijania, populacje orangutanów mogą zostać zredukowane do wyginięcia w ciągu następnych 50 lat.