Venustiano Carranza não tomou muita ação para impor os artigos anti-clericais, no entanto, durante a administração de Álvaro Obregón a hostilidade entre o governo e a hierarquia da Igreja aumentou acentuadamente. Obregón expulsou alguns sacerdotes espanhóis do país, bem como o núncio Papal, Monsenhor Ernesto Filippi. Mas foi Plutarco Elías Calles, sucessor de Obregón em 1924, que tomou a cabeça da igreja para trazer uma feroz ideologia anti-clerical para a presidência. Ele reagiu fortemente ao desafio da hierarquia da Igreja, particularmente às declarações públicas feitas pelo Arcebispo José Mora y del Rio denunciando os artigos anti-clericais da Constituição. Calles fechou igrejas e conventos e mandou deportar duzentos padres estrangeiros. Ele até mandou prender, julgar e condenar um bispo por se opor publicamente às leis do país. E introduziu um novo Código penal que estabelece penas de um a cinco anos para sacerdotes e clérigos que criticam as leis, as autoridades ou o governo. (Camín & Meyer, P.87) grupos populares rapidamente se formaram para protestar contra essas ações. Entre eles, a Asociación Católica de la Juventud Mexicana (ACJM), a Unión Popular (UP) e a Liga Nacional Defensora da Libertad Religiosa (la Liga). Bispos indignados apareceram perante o Congresso com uma petição para revogar as leis, mas sem sucesso. Em 25 de julho de 1926, o Episcopado Mexicano decidiu suspender todo o culto público. A partir daquele dia, os sacerdotes não administravam nenhum dos sacramentos, na esperança de despertar o apoio público à igreja e contra Calles. (González, p. 1). 211) ” a negação dos serviços religiosos criou uma profunda crise entre os católicos devotos.”(González, p. 211) uma vez que a rebelião ocorreu, no entanto, o alto clero não forneceu direção política para o movimento e o Vaticano foi ainda mais cauteloso, temendo a repressão religiosa como eles tinham visto durante as revoluções francesa e Bolchevique. Muitos sacerdotes procuraram refúgio nas casas de católicos ricos em centros urbanos ou simplesmente deixaram o país. A liderança foi deixada aos movimentos populares, particularmente à La Liga. A rebelião, liderada por Soldados de Cristo ou os Cristeros, ocorreu principalmente nas regiões central e ocidental do país: Michoacán, Jalisco, Guanajuato y Colima, onde a igreja tinha sido fortemente enraizada desde os tempos coloniais.Devido à falta de treinamento e suprimentos militares por parte de Cristero, a maioria deles se baseava em táticas de guerrilha que dificultavam a derrota do exército nacional. Em julho de 1927, La Liga recrutou um ex-general Huertista, Enrique Gorostieta, para coordenar seus esforços. Ele não era necessariamente um homem religioso, mas representava as forças conservadoras desprotegidas pela revolução. Ele publicou um manifesto no qual ele exigiu “reforma agrária justa com indenização por hackeados, bem como a revogação das leis de reforma que tinham despojado a Igreja de seus tribunais especiais e fazendas.”(González, P. 215) como Calles não foi capaz de reprimir esta rebelião, ele mais tarde se voltou para os homens que haviam beneficiado da “Reforma Agrária” da revolução e pediu seu apoio. Embora a redistribuição da terra tenha sido sempre um objectivo primordial da revolução, a terra acabou por se concentrar nas mãos de alguns poderosos “senhores da guerra agrária”.”Estes senhores da guerra foram convidados a levantar batalhões de “agraristas” para ajudar as tropas federais na luta contra os Cristeros. Em 1928, o embaixador dos Estados Unidos, Dwight Morrow, serviu como mediador entre o Vaticano, a hierarquia católica mexicana e o governo de Calles, durante as conversações para uma resolução pacífica do problema de Cristero. No entanto, esses planos foram postos em Espera Quando Mais tarde naquele ano o presidente eleito Alvaro Obregón foi assassinado por um jovem católico zeloso chamado José de León Toral. Calles então nomeou don Emilio Portes Gil para ser o presidente provisório, que assumiria a tarefa de organizar uma nova eleição. Durante a presidência de Portes Gil, o embaixador Morrow ressuscitou a negociação de paz, e em junho de 1929 um acordo foi alcançado entre Portes Gil e o Arcebispo Leopoldo Ruiz y Flores, que finalmente pôs fim à guerra Cristero. De acordo com o historiador Michael Gonzales este foi um compromisso agridoce no qual muito pouco foi realmente resolvido. Apesar das dezenas de milhares de vidas perdidas durante a guerra, nada de fundamental mudou politicamente. As leis anti-clericais permaneceram na Constituição, mas o governo não as impunha “de uma forma hostil à Igreja.”Nos anos vindouros, o governo federal iria estabelecer cada vez mais sua hegemonia sobre a Igreja Católica, no entanto, o clero continuaria a resistir, tanto quanto possível, às tentativas do governo de reformas educacionais e religiosas. Gonzales observa que o “impasse Sangrento” no qual a guerra terminou ainda deixou por resolver os conflitos entre a cultura tradicional mexicana, fortemente enraizada no catolicismo, e os objetivos para a reforma social do governo revolucionário. (Gonzales, pp. 218-219)
–escrito por Elizabeth Garcia e Mike McKinley, Maio de 2004