Cumulativamente, o extenso número de amostras montados aqui, combinado com a disponibilidade de muito bem resolvido paterna filogenias que remonta a muitas gerações, permitiram certas inferências sobre o Ashkenazi Levita haplogroup R1a fundador da linhagem a ser formulado com um alto grau de confiança. Um total de 71 indivíduos declarar um Ashkenazi Levita ou Ashkenazi não-Levita paterna património foram constatados no início do estudo pertencer a haplogroup R1a-M582, e com base em sua STR perfis, para representar uma ampla gama de variação encontrado dentro de que haplogroup. Notavelmente, todos os cromossomos 71 Y poderiam ser reassignados a um único clado em expansão dentro do R1a-M582 e rotulados aqui em R1a-Y2619, seguindo uma das seis variantes encontradas nesse nível(Fig. 2 e figura suplementar S1). As únicas amostras anteriormente relatadas que compartilharam este clado foram cinco amostras de herança judaica Ashkenazi para as quais o status de levita não foi relatado26. Por isso, todos os R1a-Y2619 indivíduos, se auto-filiar-se como Judeus ou não-Judeus, se Ashkenazi ou não-Ashkenazi, se Levitas ou não-Levitas, são o descendente masculino da linha paterna de um ancestral comum do sexo masculino que viveu ~1,743 ybp (Tabela 1). Como os machos contemporâneos de todos os ramos de R1a-Y2619 amostrados até agora carregam um dos muitos sobrenomes levitas, pode-se argumentar fortemente que este ancestral Masculino Auto-filiado como um levita e pode ter carregado o sobrenome patronímico levita. A magnitude do evento fundador pode ser estimada calculando o número de indivíduos contemporâneos esperados para transportar um cromossomo R1a-Y2619 Y. Dois conjuntos de amostras independentes de judeus Ashkenazi em que o status de levita era desconhecido estimaram similarmente a percentagem do haplogrupo paterno R1a-Y2619, R1a-M17/M198, na população Ashkenazi em 9.6% 20 e 11, 5%, respectivamente 27. O antigo artigo relatava que o haplogrupo R1a-M582 representava 7,9% do total da população Ashkenazi20. Aqui, mostramos que todas as amostras Ashkenazi pertencentes ao haplogrupo R1a-M582 podem ser reclassificadas como R1a-Y2619. Com base em um tamanho populacional Asquenazi de cerca de 4.000.00013 homens, dos quais cerca de 7.9% São R1a-Y2619, haveria cerca de 300.000 homens Asquenazis descendo em sua linha masculina direta de um único ancestral relativamente recente, com muitos desses homens auto-afiliado como levita.
dois factores permitiram-nos atingir idades de coalescência mais precisas e intervalos de confiança do que os previamente calculados para a linha Ashkenazi Levite R1a 18,20. Em primeiro lugar, o grande número de cromossomas Y inteiros disponíveis (tabela suplementar S1) e, em segundo lugar, os dados disponíveis da genealogia Horowitz que permitiram um ponto de calibração interno (Fig. 3). Os registros genealógicos bem documentados do pedigree de Horowitz demonstram quão robustas sequências de cromossomos Y inteiros podem ser na reconstrução de ancestrais paternos. O ponto de calibração foi baseado em três amostras de Horowitz com genealogias bem documentadas coalescendo 402 ybp. Dois indivíduos adicionais, auto-afiliados com a Dinastia Horowitz, mas sem genealogias claras agruparam-se firmemente com estas três amostras. Nenhuma das amostras nos clades irmãos imediatamente se identificou como parte da dinastia Horowitz. Surpreendentemente, a idade molecular do nó compreendendo todas as cinco amostras de Horowitz foi calculada para ~690 ybp, enquanto o tempo de coalescência Genealógica sugere que seja 546 ybp. Isto sugere que o nó de Horowitz R1a-YP268 (G.23133909G > a) pode representar a sequência y real reconstruída do fundador nomeado desta linhagem(Fig. 3b). No entanto, é importante notar que as idades de coalescência estimadas são aproximadas, uma vez que algumas variações metodológicas podem levar a resultados um pouco diferentes. Por exemplo, a aplicação de nosso coalescência metodologia para os dados obtidos a partir da plataforma Illumina sozinho, teria trazido uma coalescência idade de ~1,398 ybp para o Ashkenazi Levita R1a-Y2619 clado e ~645 anos ybp para o R1a-YP268 clado. Estas diferenças podem ser atribuíveis à capacidade de utilizar períodos de sobreposição mais longos do cromossoma Y quando comparadas amostras sequenciadas pela mesma máquina e parâmetros. Nós não calculamos um tempo de coalescência com base em variações STR, como já mostramos anteriormente eles não fornecem mais informações para clados de coalescing recentemente 6.
a origem proposta do Oriente Médio da linhagem levita Ashkenazi baseada no que era anteriormente um número relativamente limitado de samples relatados20, pode agora ser considerada firmemente validada. Enquanto as frequências mais altas do haplogrupo R1a são encontradas na Europa Oriental 18,28, nossos dados revelaram uma rica variação do haplogrupo R1a fora da Europa, que é filogeneticamente separado dos ramos R1A tipicamente europeus. Evidentemente, R1a-Y2619 está bem aninhado dentro de uma infinidade de clados filogeneticamente próximos do Oriente Médio, amostrados em Azeris Iranianos, um Kerman, um Yazidi e um homem da Ibéria. Isto fornece as provas necessárias para a sua origem (Fig. 2 e figura suplementar S1). No entanto, a via de migração exacta da R1a-Y2619 para a Europa continua a ser esquiva. A maioria dos registros históricos sugerem duas grandes rotas de migração judaica para a Europa (Fig. 1)29,30. Jewry Ashkenazi é considerado como tendo sido fundado como o resultado da migração judaica através da Itália para o Vale do Reno, e, em seguida, a Polônia. Os judeus sefarditas (espanhóis) são considerados como tendo migrado juntamente com a expansão islâmica gradual para o norte da África e, em seguida, Espanha 14. Como a R1a-Y2619 é de origem do Oriente Médio, é possível que a sua introdução na Europa tenha sido feita por uma ou ambas as rotas. Naturalmente, o forte fundador do evento para R1a-Y2619 entre os Judeus Ashkenazi, juntamente com a presença de todos os conhecidos ramos de R1a-Y2619 em Judeus Ashkenazi, tenta inferir que a sua rota de migração a partir do Levante estava diretamente relacionado com o Ashkenazi fundadores. No entanto, estes fatos podem apenas refletir uma expansão dentro dos judeus Ashkenazi, em vez de uma prova da primeira chegada da população R1a-Y2619 com ou para a população Ashkenazi. Mais confuso é o fato de que registros genealógicos da dinastia rabínica de Horowitz, agora mostrados como portadores do cromossomo R1a-Y2619 Y, sugerem sua presença na Península Ibérica no século XV e provavelmente mais cedo (Fig. 3)17. Na verdade, as repetidas migrações judaicas que poderiam ter levado cromossomas R1a-Y2619 Y para a Catalunha são documentadas desde o século IV e durante a expansão muçulmana para a Iberia31. Além disso, como a Catalunha era novamente território cristão desde 800 d. C., proto-Horowitz R1A-Y2619 ancestrais também podiam representar a migração de judeus Ashkenazi para a Ibéria. Assim, a presença de R1a-Y2619 na Espanha, no século 15, não foi possível estabelecer a prova para a primeira chegada do R1a-Y2619 linhagem para a Península Ibérica, como este poderia simplesmente refletir repetidas e não registradas movimentos de Judeus e para trás entre Europa Ocidental e Oriental e a Península Ibérica. Evidências anteriores de marcadores mtDNA e autossômicos já sugeriram um provável fluxo genético entre judeus Ashkenazi e sefarditas na Europa 32,33,34. Em conjunto, os nossos resultados tendem a favorecer uma única via de entrada na Europa como parte da migração Ashkenazi e da expansão na Europa. Porque o tempo de coalescência de todos os contemporâneos R1a-Y2619 Levitas é ~1,743 ybp, bem dentro do tempo dos Romanos exílio, Diáspora, e cada um dos ramos do R1a-Y2619 é encontrado em Judeus Ashkenazi, nossos resultados são inconsistentes com um cenário de rápida expansão no Levante, seguido por uma propagação através de várias rotas para a Europa. Os resultados das amostras levitas não Ashkenazi R1a-Y2619 também sugerem uma única via de expansão. Se a linhagem levita R1a-Y2619 já fosse tão prevalente no Levante, os levitas não-Ashkenazi deveriam ter se separado das amostras levitas Ashkenazi antes da época da Diáspora e formar um conjunto diferente. No entanto, os resultados mostram que os levitas não-Ashkenazi caem dentro de vários sub-ramos de carvão relativamente recentemente de R1a-Y2619 (Fig. 2 e figura suplementar S1). Este padrão é mais compatível com o fluxo genético contínuo da população Ashkenazi para a população não-Ashkenazi durante a diáspora, em vez de múltiplas rotas de entrada para o haplogrupo R1a-Y2619 para a Europa a partir do Levante.
apoio adicional para uma única rota de migração e subsequente expansão dentro dos judeus Ashkenazi, emana dos padrões observados de expansão de haplogrupos Ashkenazi adicionais. Assim, é importante distinguir entre um Ashkenazi Levita específicos fundador do evento para haplogroup R1a-Y2619 que poderia ter sido o resultado de um ambiente sócio-econômico ou outro estado, e uma expansão de Ashkenazi fundação cromossoma Y linhagens, incluindo R1a-Y2619 Ashkenazi Levitas. Para este propósito, nós estudamos um punhado de outros haplogroups anteriormente descritos para ser prevalente entre os judeus Ashkenazi 19, 24, 35. Nossos resultados mostram que a expansão de R1a-Y2619 entre judeus Ashkenazi não é específica ou única a este haplogrupo. Por exemplo, a coalescência de haplogroup G-M377 (Suplementar Figura S4) e Q-M242 (Suplementar Figura S5), conhecidas representam 5% do Ashkenazi paterna variation24, fundem-se no ~1,223 ybp e ~1,672 ybp, respectivamente (Tabela 1). A estratégia cromossómica Y aqui adoptada permitiu-nos resolver as linhagens do haplogrupo e nos seus sub-ramos minúsculos (figura suplementar S3). As idades de coalescência do haplogrupo e-Z838, e – PF3780, e – B923 e e-B933, conhecidos por representar cumulativamente 20% da variação paterna ashkenazi24, foram estimadas em ~1.200–1.600 ybp. Este padrão de múltiplos eventos fundadores, não observado entre os judeus espanhóis 36 fornece mais apoio que o ancestral levita R1a-Y2619 Ashkenazi entrou na Europa através da rota Ashkenazi ao invés de através da expansão judaica para a Península Ibérica. Outros padrões também são claramente visíveis na ancestralidade paterna judaica Ashkenazi. O haplogrupo T-M70, prevalente no Oriente Médio, também está presente entre os judeus Ashkenazi (figura suplementar S6). As amostras genotipadas mostraram divisões profundamente enraizadas, provavelmente apontando para a preservação de uma antiga diversidade deste haplogrupo no Levante, que remonta ao Pleistoceno. Entretanto, o padrão observado para o haplogrupo R1b-M269 (figura suplementar S7), prevalente na Europa Ocidental, sugere primariamente a introgressão pontuada repetida dos cromossomas Y europeus à comunidade Ashkenazi, e é compatível com os relatórios anteriores 36.
nós comparamos a linhagem fundadora mais frequente encontrada entre os homens Ashkenazi Cohen, aninhados dentro do haplogrupo J1a-P58, com a linhagem Ashkenazi Levite R1a-Y2619. Evidentemente, os membros da casta levita R1a-Y2619 e da casta Cohen J1a-P58 não compartilham um ancestral masculino comum dentro do período de tempo da narrativa bíblica. Como no caso dos levitas Ashkenazi, a linhagem Ashkenazi Cohen J1A-P58 formou um aglomerado apertado aninhado dentro de um conjunto de amostras do Oriente Médio confirmando sua origem, e foi compartilhado em nosso estudo apenas com Cohens não-Ashkenazi (figura suplementar S2). No entanto, diferentemente do padrão obtido para os levitas R1a-Y2619 Ashkenazi, o aglomerado coalesces ~2,570 ybp, apontando assim para o início de sua expansão no período pré-diáspora. Extenso completa de sequências do cromossoma Y maior número de Cohen amostras de mais comunidades Judaicas no plano de fundo de outros Levantine populações, incluindo a verificação de família e clã variantes específicas seria muito informativo, abordando a conclusão de que Ashkenazi e não-Ashkenazi Cohen indivíduos compartilham uma sobreposição de distribuição de linhagens. In particular, the study of the most dominant Cohen lineage nested with the prevalent haplogroup J1-P58, along with expert historical input, might grant critical insight to the understanding of Hebreus in The Old World. Além disso, os antigos estudos de ADN do Levante podem oferecer informação directa. De fato, um estudo recente revelou a presença de ambos os cromossomos Y J1a-P58 e J2-M12, frequentes entre os judeus contemporâneos, em duas amostras Cananitas datam de 3.700 ybp37.
é difícil simular o número máximo de homens que precisariam estar presentes na fundação do Judeu Asquenazi para produzir o forte padrão de eventos fundadores atualmente observados no grupo cromossomo Y Ashkenazi. Não existem índices fundamentais como a frequência dos respectivos haplogrupos nas populações Demes ancestrais e a extensão da introgressão que ocorreu ao longo das gerações. No entanto, as frequências contemporâneas destas linhagens fundadoras do cromossoma Y, tendo em conta as suas frequências muito mais baixas nas populações não-judaicas do Médio Oriente e da Europa, sugerem que tais linhagens devem ter estado presentes no início do Judaísmo Asquenazi, quando o número escasso de homens compreendia a população fundadora, e permitindo que a deriva desempenhasse um papel no estabelecimento de suas atuais altas frequências. Na verdade, a reconstrução da recente história judaica Ashkenazi a partir de genomas inteiros sugeriu um gargalo de apenas 350 individuais26, 38. É importante notar que, embora este gargalo não coincide necessariamente com a fundação efetiva da população masculina, tamanho e eventos para os Judeus Ashkenazi, ele nos diz que o Ashkenazi Levita R1a-Y2619 antepassado provavelmente estava entre os fundadores homens sobre os quais o gargalo aplicada. Correspondentemente, os dados de sequências completas de ADN mitocondrial suportam a mesma noção de um número limitado de linhas33 maternas fundadoras principais.A magnitude dos dados aqui apresentados facilita uma resolução quase completa do conto genômico dos levitas dentro dos judeus Ashkenazi. Pode-se argumentar fortemente que os levitas R1a-Y2619 Ashkenazi descendem de um único ancestral levita que chegou na Europa a partir do Levante. A expansão de sua linhagem masculina direta começou em um período compatível com o padrão de expansão observado para vários pais fundadores adicionais de judeus Ashkenazi. Assim, além de fornecer uma visão sobre uma genealogia masculina única, estes achados são um exemplo importante e altamente resolvido da história demográfica mais geral de linhagens judaicas masculinas e femininas Ashkenazi, em que um número relativamente pequeno de fundadores fazem contribuições desproporcionalmente grandes para a variação genômica da população Ashkenazi contemporânea. Pode-se ainda argumentar que o fato de que os homens não-Ashkenazi Levite R1a-Y2619 estão bem distribuídos dentro da filogenia levita Ashkenazi, ao invés de agrupados separadamente, dá mais credibilidade ao cenário de que o macho R1a-Y2619 entrou na Europa com os fundadores Ashkenazi. A questão mais enigmática – o momento e a localização em que o fundador da levita Ashkenazi R1a-Y2619 obteve o estatuto de levita – continua por resolver. Esta questão pode ser para além do âmbito dos estudos genéticos uso contemporâneo de variação genética, dada a ausência da data de qualquer testado homens cujas linhas ramificado entre o momento da partilha direta do sexo masculino ancestral de todos os R1a-M582 homens, ~3,143 ybp, e a partilha direta do sexo masculino ancestral do R1a-Y2619 Ashkenazi Levita, homens ~1,743 ybp. Futuros insights históricos ou arqueológicos podem fornecer os meios para investigar mais esta questão.