laços-tronco ocorrem em estruturas pré-micrórna e mais famosa em ARN de transferência, que contêm três laços-tronco verdadeiros e um tronco que se encontram em um padrão de cloverleaf. O anticodon que reconhece um codon durante o processo de tradução está localizado em um dos loops não emparelhados no tRNA. Duas estruturas aninhadas de laço-tronco ocorrem em pseudoknots RNA, onde o laço de uma estrutura forma parte do segundo tronco.
muitas ribozimas também apresentam estruturas de laço-tronco. O ribozyme hammerhead auto-cliving contém três laços de caule que se encontram numa região central não emparelhada onde se situa o local de clivagem. A estrutura secundária básica da hammerhead ribozyme é necessária para a actividade de auto-clivagem.Loops de Gancho de cabelo são frequentemente elementos encontrados dentro do 5 ‘ UTR de procariontes. Estas estruturas são muitas vezes ligadas por proteínas ou causam a atenuação de uma transcrição, a fim de regular a tradução.
a estrutura da linha de caule do ARNm que se forma no local de ligação dos ribossomas pode controlar o início da tradução.
estruturas de ciclo-tronco também são importantes na terminação da transcrição independente Rho procariótica. O laço do gancho forma-se em uma cadeia de ARNm durante a transcrição e faz com que a ARN polimerase se torne dissociada da cadeia de DNA template. Este processo é conhecido como Rho-independente ou terminação intrínseca, e as sequências envolvidas são chamadas sequências terminadoras.