când, unde și cât de mult este exprimată o genă este controlată în primul rând de interacțiunea secvențelor ADN reglatoare cis cu factorii de transcripție trans-reglatori (TFs). Modificările situsurilor de legare a TF contribuie la stările de boală, diversitatea fenotipică în rândul indivizilor sănătoși și fenotipurile divergente între specii. În ciuda importanței lor, rămân multe întrebări cu privire la modul în care secvențele ADN de reglementare cis traduc legarea TF în activitatea transcripțională (Wittkopp și Kalay 2012). Evoluția rapidă a potențiatorilor galbeni ne oferă o oportunitate excelentă de a studia evoluția secvențelor CIS-regulatoare (Wittkopp și colab. 2002; Gompel și colab. 2005).
folosind gene reporter în D. melanogaster, am descoperit că locațiile potențiatorilor specifici de țesut ai genei galbene de pigmentare au schimbat pozițiile în genom în rândul speciilor (vezi figura) (Kalay și Wittkopp 2010). Analiza secvenței a sugerat că acest lucru s-a datorat mai probabil câștigului și pierderii treptate a siturilor de legare a factorului de transcripție decât duplicărilor sau rearanjamentelor. Acest lucru ne permite să folosim aceste regiuni pentru a compara secvența ADN, legarea TF și activitatea de reglementare cis între secvențele care au dobândit în mod independent aceeași funcție, precum și între secvențele ADN ortologe ale căror funcții au divergent.
în prezent, analizăm (1) datele drojdie-1-hibrid care identifică TF-urile care se leagă de potențiatori specifici speciilor de galben, (2) localizând secvențe responsabile de activitatea specifică țesutului în fiecare regiune de intensificare și (3) folosind informațiile obținute din această lucrare pentru a elucida mecanismele de dezvoltare care controlează modelarea abdominală în timpul dezvoltării pupale.