den populære historie om HIV/AIDS beskriver en mand kendt som Patient nul, en seksuelt aktiv flyvehjælper, der rejste verden rundt og indledte AIDS-epidemien i Nordamerika. En ny analyse af det virale genom, der blev genvundet fra hans serum og for andre patienter i 1970 ‘ erne, beviser uden tvivl, at han ikke var Patient nul (link til papir).
i en heroisk indsats blev tusinder af arkiverede serumprøver oprindeligt indsamlet fra kohorter af mænd, der har køn med mænd i 1970 ‘ erne i Ny York og San Francisco, undersøgt for tilstedeværelsen af HIV ved vestlig blot-analyse. I alt 83 prøver viste sig at være HIV-positive og udsat for dyb sekventering, men det virale RNA blev nedbrudt og kun til stede i korte stykker. For at overvinde dette problem blev mange DNA-primere brugt til at forstærke korte RNA-fragmenter ved PCR i en procedure farverigt kaldet ‘jackhammering’. Det imponerende resultat er, at der blev opnået komplette HIV-1-kodningssekvenser fra 8 prøver: 3 Fra San Francisco og 5 fra Ny York City.
analyse af HIV-genomsekvenserne og sammenligning med tidligere og senere data afslørede, at virussen sandsynligvis rejste fra Afrika til Caribien omkring 1967 og derfra til Ny York City i 1971. Disse resultater modbeviser tidligere ideer om, at HIV ankom til Caribien fra USA.
sekvensanalyse afslører også, at Ny York City var et knudepunkt for tidlig diversificering af HIV, og at epidemien allerede var moden og genetisk forskelligartet i slutningen af 1970 ‘ erne. der ser ud til at have været en enkelt introduktion af HIV i San Francisco fra Ny York City i 1976. Fra disse to byer spredte virussen sig andre steder i USA og i udlandet.
det er blevet foreslået, at en seksuelt aktiv flyvehjælper, identificeret som Gaetan Dugas af Randy Shilts i sin bog og bandet spillede på, var kilden til den nordamerikanske AIDS-epidemi. Selvom mindst en undersøgelse for mange år siden konkluderede, at han ikke var den første sag, fortsætter denne tro. Sekventering af HIV fra denne patients serum afslørede, at han bestemt ikke var den første person i Nordamerika inficeret med denne linje af HIV-1 (gruppe M, subtype B) .
en historisk rekonstruktion af de tidlige dage af AIDS i USA afslører, hvordan Dugas tjente etiketten ‘Patient nul’. CDC-efterforskere, der studerede et seksuelt netværk af 40 homoseksuelle mænd, placerede en mand i centrum, som de kaldte ‘Patient O’ og stod for ‘uden for Californien’, fordi han var Canadisk (billedet; billede kredit). Efter offentliggørelsen af dette arbejde blev ‘O’ fejlagtigt fortolket som et nul og begyndte således troen på, at han var oprindelsen til AIDS-udbruddet i Nordamerika.