siden uafhængigheden i 1963 har Kenya opretholdt bemærkelsesværdig stabilitet på trods af ændringer i sit politiske system og kriser i nabolandene. Især siden genopkomsten af flerpartidemokrati har kenyere haft en øget grad af frihed.Et tværpolitisk parlamentarisk reforminitiativ i efteråret 1997 reviderede nogle undertrykkende love arvet fra kolonitiden, der var blevet brugt til at begrænse ytrings-og forsamlingsfriheden. Dette forbedrede de offentlige friheder og bidrog til generelt troværdige nationale valg i December 1997.
i December 2002 afholdt Kenya demokratiske og åbne valg og valgte Kibaki som deres nye præsident. Valget, som blev bedømt som frit og retfærdigt af lokale og internationale observatører, markerede et vigtigt vendepunkt i Kenyas demokratiske udvikling. Præsident Kibaki kæmpede for en politik for at skabe økonomisk vækst, forbedre uddannelse, bekæmpe korruption og implementere en ny forfatning, hvis udkast blev produceret af Professor Ghai under Moi-regimet. Der er opnået betydelig succes på de to første politikområder, forfatningsprocessen var blevet mired (se nedenfor), og kampen mod korruption har været en katastrofe.
der har været store skandaler (herunder Anglo-Leasing), som regeringen har undladt at undersøge. John Githongo, derefter Permanent sekretær for præsidenten for etik og regeringsførelse, trak sig tilbage i protest, og donornationer, især briterne, har fremsat offentlig kritik af manglen på fremskridt.Efter uenigheder mellem partnerne i den daværende regeringskoalition var forfatningsreformen gået langsommere end forventet. Nak-fraktionen (allieret med præsident Kibaki) favoriserede et centraliseret præsidentsystem, mens LDP—fraktionen—som havde færre parlamentariske pladser i denne koalition end NAK-krævede et føderalt, parlamentarisk system, i nogle kredse omtalt som Majimbo.
forud for valget i 2002 blev der aftalt et aftalememorandum (MoU) mellem NAK og LDP, som lagde grundlaget for de to grupper til at bestride valget under NARC (regnbue Alliance) banner. MoU blev enige om, at en ny forfatning ville blive oprettet kort efter valget, som sørgede for den nye rolle som en stærk premierminister, samtidig med at præsidentens rolle blev svækket. Raila Odinga, derefter leder af LDP, fastholdt ambitioner om at blive premierminister. Dette udkast til forfatning blev imidlertid ændret af regeringen fra det, der blev skrevet af Professor Ghai og ændret af Bomas-udvalget.
dette opretholdt en stærk præsident, der kontrollerer en svagere premierminister. Dette førte til en splittelse mellem NAK og LDP, hvor førstnævnte kæmpede for en ‘ja’ stemme i en folkeafstemning i 2005 om forfatningen og sidstnævnte et ‘nej’. Flertallet af Uhuru Kenyattas KANU-parti støttede også et nej, det eneste regeringsparti fra uafhængighed til 2002. Resultatet af denne folkeafstemning, hvor udkastet til forfatning blev afvist, signaliserede en bredere tilpasning inden valget i 2007, hvor No-holdet reorganiserede sig selv som Orange Democratic Movement med Raila Odinga som deres præsidentflag, mens de i yes-holdet endte i flere politiske partier, herunder Partiet for National enhed.
intern krangel inden for denne regeringskoalition påvirkede også andre vigtige regeringsområder negativt, især den planlagte omfattende privatisering af statsejede virksomheder. Præsidentvalget i 2007 blev stort set antaget at have været mangelfuldt med internationale observatører, der sagde, at de ikke opfyldte regionale eller internationale standarder. De fleste observatører antyder, at optællingsprocessen for præsidentresultaterne blev rigget til fordel for den siddende præsident, på trods af overvældende indikationer på, at hans rival og den efterfølgende premierminister i Kenya, Raila Odinga, vandt valget. I juli 2008 blev afstemninger bestilt af den amerikanske regering frigivet, hvilket afslørede, at Odinga havde vundet valget med en behagelig margin på 6%, langt uden for afstemningens fejlmargin på 1,3%.
der var betydelig og udbredt vold i Kenya—2007–2008 Kenyansk krise—efter den hidtil usete meddelelse om Kibaki som vinder af præsidentvalget i 2007. Volden førte til næsten 1.000 menneskers død og fordrivelsen af næsten 600.000 mennesker. Nogle forskere bemærker, at det tillod voldelig bilæggelse af jordtvister mellem etniske grupper over kontroversielle begreber om ‘forfædres hjemlande’.
en diplomatisk løsning blev opnået, da de to rivaler senere blev forenet i en stor koalitionsregering efter international mægling, ledet af den tidligere FN-generalsekretær Kofi Annan, under en magtdelende National aftale om Forsoningslov, forankret i forfatningen. Efter aftalen blev magten delt mellem præsident Kibaki og premierminister, Raila Odinga.Flere trin blev anbefalet for at sikre stabilitet og fred for nationen under forhandlingerne, der førte til dannelsen af koalitionsregeringen. En af disse reformer var den berømte Agenda 4, der beskæftiger sig med reformer i forskellige sektorer. En ny forfatning blev identificeret som et nøgleområde i opfyldelsen af Agenda 4. Et udkast til forfatning blev offentliggjort, og kenyere vedtog det ved afstemning den 4.August 2010.I 2013 blev koalitionsregeringen gjort ineffektiv på grund af forfatningen. Der blev afholdt parlamentsvalg, og Jubilæumskoalitionen med præsident, Uhuru Kenyatta og vicepræsident, Vilhelm Samoei Ruto opnåede sejr. Den nye forfatning indeholdt også et tokammerhus, Senatet og nationalforsamlingen. Disse blev behørigt fyldt op med valgte kandidater. Nationen blev også opdelt i amter ledet af guvernører og repræsenteret i Senatet af senatorer. Kvinder i disse amter blev også repræsenteret ved at vælge kvindelige repræsentanter.Den femårige periode sluttede i 2017, og Landet gik ind til valget.Præsident Uhuru Kenyatta og næstformand Samoei Ruto blev genvalgt den 30. oktober 2017. Dette vil løbe frem til 2022, når det næste valg vil blive gennemført. Det historiske håndtryk i Marts 2018 mellem præsident Uhuru Kenyatta og hans mangeårige modstander Raila Odinga betød forsoning efterfulgt af økonomisk vækst og øget stabilitet.