ødelæggelsen og nedbrydningen af den tropiske regnskov, især lavlandsskov, i Borneo og Sumatra er hovedårsagen til, at orangutanger trues med udryddelse.
dette er primært forårsaget af menneskelig aktivitet (intens ulovlig skovhugst, omdannelse af skov til palmeolieplantager og tømmergoder, minedrift, rydning af skov til bosættelser og vejbygning) og også af store brande lettet af El Nino Vejrfænomener. Derudover har den ulovlige Dyrehandel været en faktor i nedgangen i vilde orangutangpopulationer. Endelig jages og spises orangutanger lejlighedsvis af nogle af de oprindelige folk i Borneo såvel som vandrende skovhuggere og plantagearbejdere, der ikke har diætforbud mod at spise primatbuskekød.
ulovlig skovhugst (Gunung Leuser National Park) foto Kristian Ruvindrijarto/Environmental Investigation Agency
på et tidspunkt omfattede verdens vilde orangutangpopulationer sandsynligvis op mod hundreder af tusinder af individer, men de nuværende skøn indikerer, at langt færre vilde orangutanger nu er tilbage. I løbet af det sidste årti er orangutangpopulationerne sandsynligvis faldet med 50% i naturen. Selvom tidligere klimaskift kan have været ansvarlig for noget af dette fald, er orangutanger primært truet af menneskelige aktiviteter og udvikling, der forårsager tab og nedbrydning af deres skovhabitater. I øjeblikket har Iunc klassificeret både Bornean og Sumatran orangutang som kritisk truet
de seneste skøn over orangutang populationsstørrelser og fordelinger kan findes på IUCN Red List of threated Species hjemmeside. IUCNs Red List-vurderinger viser, at cirka 14.600 Sumatran-orangutanger (Pongo abelii) forbliver i naturen. Det Bornean orangutang (Pongo pygmaeus) befolket anslås at være omkring 104.700 individer. På grund af betydeligt tab af orangutang habitat på begge øer er det sandsynligt, at de nuværende tal på begge øer faktisk er under dem, der er angivet på IUCNs Rødliste. Cirka 2.000-3.000 Borneanske orangtuaner blev dræbt hvert år i de sidste fire årtier alene, hvilket repræsenterer et tab på mere end 50% af den oprindelige befolkning på kun 40 år. Med denne drabshastighed kunne orangutangpopulationer reduceres til udryddelse i de næste 50 år.