den 27. oktober 1962 under Cubansk missilkrise, en gruppe på 11 United States Navy destroyere og hangarskibet USS Randolph lokaliserede den dieseldrevne, atomvåbnede ubåd B-59 i nærheden Cuba. På trods af at de var i internationale farvande, begyndte den amerikanske flåde at droppe signaldybdeafgifter, sprængstoffer beregnet til at tvinge ubåden til at komme til overfladen til identifikation. Der havde ikke været nogen kontakt fra Moskva i et antal dage, og selvom ubådens besætning tidligere havde hentet amerikanske civile radioudsendelser, når B-59 begyndte at forsøge at skjule sig for sine US Navy-forfølgere, var det for dybt til at overvåge enhver radiotrafik. De om bord vidste ikke, om krigen var brudt ud eller ej. Ubådens kaptajn, Valentin Grigorievitch Savitsky, besluttede, at en krig måske allerede var startet og ønskede at starte en nuklear torpedo.
i modsætning til de andre ubåde i flotillen måtte tre officerer om bord på B-59 enstemmigt blive enige om at godkende en nuklear lancering: kaptajn Savitsky, den politiske officer Ivan Semonovich Maslennikov og flotilla commodore (og Administrerende Direktør for B-59) Arkhipov. Typisk krævede sovjetiske ubåde bevæbnet med det “specielle våben” kun kaptajnen for at få tilladelse fra den politiske officer til at lancere en nuklear torpedo, men på grund af Arkhipovs position som commodore var B-59s kaptajn også forpligtet til at få Arkhipovs godkendelse. Et argument brød ud, med kun Arkhipov mod lanceringen.
selvom Arkhipov var næstkommanderende for ubåden B-59, var han faktisk commodore for hele ubådsflotillaen, inklusive B-4, B-36 og B-130. Det ry, Arkhipov havde opnået ved hans modige opførsel i det foregående års K-19-hændelse, hjalp ham også med at sejre. Arkhipov overtalte til sidst Savitsky til at dukke op og afvente ordrer fra Moskva. Dette afværgede effektivt den generelle atomkrig, som sandsynligvis ville have fulgt, hvis atomvåbenet var blevet fyret. Ubådens batterier havde kørt meget lavt, og klimaanlægget var mislykket, hvilket forårsagede ekstrem varme og høje niveauer af kulsyre inde i ubåden. De blev tvunget til at dukke op midt i de amerikanske forfølgere og vende tilbage til Sovjetunionen som et resultat.
Aftermatedit
umiddelbart efter tilbagevenden til Rusland blev mange besætningsmedlemmer udsat for skændsel fra deres overordnede. En admiral fortalte dem “det ville have været bedre, hvis du var gået ned med dit skib.”Olga, Arkhipovs kone, sagde endda” han kunne ikke lide at tale om det, han følte, at de ikke havde værdsat, hvad de havde gennemgået.”Hver kaptajn var forpligtet til at fremlægge en rapport om begivenheder under missionen til den sovjetiske forsvarsminister, marskal Andrei Grechko i erstatning på grund af sygdom af den officielle forsvarsminister. Grechko blev rasende over besætningens manglende overholdelse af de strenge hemmeligholdelsesordrer efter at have fundet ud af, at de var blevet opdaget af amerikanerne. En officer bemærkede endda Grechkos reaktion og sagde, at han “efter at have lært, at det var diesel ubåde, der gik til Cuba, fjernede hans briller og ramte dem mod bordet i raseri, brækkede dem i små stykker og pludselig forlod rummet efter det.”
i 2002 afholdt den pensionerede kommandør Vadim Pavlovich Orlov, en deltager i begivenhederne, en pressekonference, der afslørede, at subs var bevæbnet med nukleare torpedoer, og at Arkhipov var grunden til, at disse enheder ikke var blevet fyret. Orlov præsenterede begivenhederne mindre dramatisk og sagde, at Kaptajn Savitsky mistede sit humør, men til sidst roede sig ned.
da vi diskuterede den cubanske missilkrise i 2002, sagde Robert McNamara, den amerikanske forsvarsminister på det tidspunkt, “vi kom meget tæt på” atomkrig, “tættere end vi vidste på det tidspunkt.”Arthur M. Schlesinger Jr., en rådgiver for John F. Kennedy-administrationen og en historiker, fortsatte denne tanke ved at sige “dette var ikke kun det farligste øjeblik i Den Kolde Krig. Det var det farligste øjeblik i menneskets historie.”