Die mobile Clue-Anwendung berechnet und prognostiziert die Periode, das fruchtbare Fenster und das prämenstruelle Syndrom eines Benutzers. Es informiert die Benutzer auch über die wahrscheinlichste oder am wenigsten wahrscheinliche Zeit für eine Schwangerschaft und ermöglicht es ihnen, mehr als 30 Gesundheitskategorien zu verfolgen, darunter Sex, Schlaf, Schmerzen, Bewegung, Haare, Haut, Verdauung, Emotionen und Energie. Die App kann auch erklären, wie Pille Dosierungen Fruchtbarkeit auswirken und enthält ein Alarmsystem für Erinnerungen für die Einnahme von Pillen zu ermöglichen.
Im Jahr 2015 schloss das Unternehmen eine Series-A-Finanzierungsrunde ab und kündigte Pläne an, den Erlös für die Erweiterung der Funktionen der mobilen App und die Einstellung von mehr Mitarbeitern zu verwenden. Clue arbeitete auch mit Universitäten wie Stanford, der Columbia University, der University of Washington und der University of Oxford zusammen, um die Gesundheitsforschung von Frauen voranzutreiben.
Clue integriert mit Apple Inc.’s HealthKit für iOS 9 im September 2015, so dass Daten wie Körpertemperatur, Zervixschleim Qualität, Menstruation, Ovulationstestergebnisse, sexuelle Aktivität und Spotting direkt in die App.
Im Jahr 2016 war Clue in 15 Sprachen auf iOS und Android verfügbar. Im selben Jahr führte Clue eine Cycle-Sharing-Funktion und 2017 eine Pill-Tracking-Option ein.
Im Februar 2018 stellte Clue seine App auf der Fitbit Ionic Smartwatch zur Verfügung.