Morgan se desempeñó como archivero personal y bibliógrafo de Ginsberg desde principios de los años 80 hasta la muerte del autor por cáncer en 1997. Durante sus 20 años de relación profesional, Morgan se acercó bastante a Ginsberg, y ha escrito extensamente sobre la Generación Beat y sus figuras clave.
El interés de Bill Morgan en los Beats se remonta a principios de la década de 1970, cuando asistía a la escuela en la Universidad de Pittsburgh. Para su tesis de maestría, compiló una bibliografía de las obras de Lawrence Ferlinghetti, poeta y propietario de City Lights Books, la famosa librería de San Francisco y una de las editoriales más importantes de los primeros escritores Beat, especialmente Allen Ginsberg. Después de terminar su tesis, Morgan fue alentado por los editores de la University of Pittsburgh Press a continuar con este proyecto con vistas a una eventual publicación. De hecho, continuó su investigación, trabajando en estrecha colaboración con Ferlinghetti como su bibliógrafo personal, y, después de una década de investigación, publicó Lawrence Ferlinghetti: A Comprehensive Bibliography (Nueva York: Garland Publishing, 1982).
En 1980 Morgan se había mudado a la ciudad de Nueva York. Mientras todavía estaba trabajando en el libro de Ferlinghetti, el poeta de San Francisco lo había referido a Allen Ginsberg, cuya biblioteca y archivo personal eran fuentes invaluables de información sobre los Beats. Las primeras consultas con el poeta se convirtieron en una relación duradera que duró desde principios de la década de 1980 hasta la muerte de Ginsberg en 1997. Durante estos años, Morgan se desempeñó como archivero y bibliógrafo de Ginsberg, ayudando al poeta a organizar y mantener su biblioteca y registros en constante aumento. Como bibliógrafo de Ginsberg, Morgan pasó quince años en correspondencia y visitando numerosas editoriales, editores, académicos y colecciones de bibliotecas con el fin de reunir suficiente información para documentar la historia de la prodigiosa producción de Ginsberg y la atención mundial que ha atraído. Los resultados de su investigación aparecieron en una bibliografía de dos volúmenes: The Works of Allen Ginsberg, 1941-1994: A Descriptive Bibliography and The Response to Allen Ginsberg, 1926-1994: A Bibliography of Secondary Sources (Westport, Conn.: Greenwood Press, 1995, 1997). En 2006, Morgan publicó I Celebrate Myself: The Somewhat Private Life of Allen Ginsberg (Nueva York: Viking, 2006). Lo siguió en 2010 con The Typewriter Is Holy: The Complete, Uncensored History of the Beat Generation (Nueva York, NY: Free Press, 2010).
Morgan también ha escrito o editado media docena de otras obras relacionadas con los Ritmos, incluidas colecciones de ensayos de Ginsberg (Prosa deliberada: Ensayos seleccionados, 1952-1995, Nueva York: HarperCollins, 2000), de los últimos poemas del poeta (Muerte & Fama: Poemas, 1993-1997; coeditado con Bob Rosenthal y Peter Hale, Nueva York: HarperFlamingo, 1999), y of Gregory Corso’s correspondence (An Accidental Autobiography: The Selected Letters of Gregory Corso, Nueva York: New Directions, 2003). A través de City Lights en San Francisco, ha publicado dos guías, The Beat Generation en Nueva York: A Walking Tour of Jack Kerouac’s City (1997) y The Beat Generation in San Francisco: A Literary Tour (2003). Este último apareció durante la celebración del cincuentenario de City Lights, a la que Morgan también contribuyó con una serie de recorridos gratuitos a pie por la sección de North Beach de San Francisco, una vez un centro de la vida bohemia en la ciudad y hogar de muchos de los Beats en las décadas de 1950 y 1960.
En el curso de sus décadas de investigación sobre los Beats, Morgan reunió quizás las colecciones privadas más grandes de obras impresas de Ferlinghetti y Ginsberg en manos privadas. Encontró cada vez más difícil mantener estas dos colecciones muy grandes y valiosas en su apartamento de Nueva York, y decidió a regañadientes separarse de ellas. Sabiendo que Ferlinghetti era un ex alumno de UNC-Chapel Hill, decidió en el otoño de 2001 ofrecer su colección del poeta de San Francisco a la Universidad de Carolina del Norte en las bibliotecas de Chapel Hill. Las conversaciones con los funcionarios de la biblioteca llevaron a la transferencia de la colección a Chapel Hill en diciembre de ese año, en parte como venta y en parte como regalo. Satisfecho con el resultado, Morgan ofreció un arreglo similar para su colección aún más extensa de Allen Ginsberg. Los materiales fueron entregados a la Colección de Libros Raros de la Biblioteca Wilson en agosto de 2002.