Desde su independencia en 1963, Kenya ha mantenido una estabilidad notable, a pesar de los cambios en su sistema político y las crisis en los países vecinos. Particularmente desde el resurgimiento de la democracia multipartidista, los kenianos han disfrutado de un mayor grado de libertad.En otoño de 1997, una iniciativa de reforma parlamentaria multipartidista revisó algunas leyes opresivas heredadas de la era colonial que se habían utilizado para limitar la libertad de expresión y reunión. Esto mejoró las libertades públicas y contribuyó a la celebración de elecciones nacionales generalmente creíbles en diciembre de 1997.
En diciembre de 2002, Kenya celebró elecciones democráticas y abiertas y eligió a Mwai Kibaki como su nuevo presidente. Las elecciones, que fueron juzgadas libres y justas por observadores locales e internacionales, marcaron un importante punto de inflexión en la evolución democrática de Kenia. El Presidente Kibaki hizo campaña sobre una política de generación de crecimiento económico, mejora de la educación, lucha contra la corrupción e implementación de una nueva constitución, cuyo borrador fue elaborado por el profesor Ghai bajo el régimen del Ministerio del Interior. Se ha logrado un éxito considerable en las dos primeras esferas de política, el proceso constitucional se ha estancado (véase más adelante) y la lucha contra la corrupción ha sido un desastre.
Ha habido escándalos importantes (incluido el arrendamiento Anglo), que el gobierno no ha investigado. John Githongo, entonces Secretario Permanente de Ética y Gobernanza del Presidente, renunció en protesta, y los países donantes, en particular los británicos, han hecho críticas públicas a la falta de progreso.A raíz de los desacuerdos entre los asociados de la coalición gubernamental de entonces, la reforma constitucional se había llevado a cabo más lentamente de lo previsto. La facción NAK (aliada al presidente Kibaki) favorecía un sistema presidencial centralizado, mientras que la facción del PLD, que tenía menos escaños parlamentarios en esa coalición que NAK, exigía un sistema parlamentario federal, conocido en algunos círculos como Majimbo.
Antes de las elecciones de 2002, se acordó un Memorando de Entendimiento entre la NAK y el PLD, que sentó las bases para que los dos grupos participaran en las elecciones bajo la bandera del NARC (Alianza Arco Iris). En el Memorando de Entendimiento se acordó que se establecería una nueva constitución poco después de las elecciones, en la que se preveía el nuevo papel de un Primer Ministro fuerte, al tiempo que se debilitaba el papel del Presidente. Raila Odinga, entonces líder del PLD, mantuvo sus aspiraciones de convertirse en Primer Ministro. Sin embargo, ese proyecto de constitución fue modificado por el Gobierno a partir de lo escrito por el profesor Ghai y enmendado por el comité Bomas.
Esto mantuvo un Presidente fuerte, que controla a un Primer Ministro más débil. Esto llevó a una división entre el NAK y el PLD, con el primero haciendo campaña por el » Sí «en un referéndum de 2005 sobre la constitución y el segundo un «No». También apoyó un voto negativo la mayoría del partido KANU de Uhuru Kenyatta, el único partido de gobierno desde la independencia hasta 2002. El resultado de ese referéndum, en el que se rechazó el proyecto de constitución, señaló un mayor alineamiento antes de las elecciones de 2007, en las que el equipo del No se reorganizó como el Movimiento Democrático Naranja con Raila Odinga como su abanderado presidencial, mientras que los del equipo del Sí terminaron en varios partidos políticos, incluido el Partido de Unidad Nacional.
Las disputas internas dentro de esa coalición de gobierno también afectaron negativamente a otras áreas cruciales de la gobernanza, en particular la privatización a gran escala planificada de las empresas estatales. Se creía en gran medida que las elecciones presidenciales de 2007 habían sido defectuosas y que los observadores internacionales afirmaban que no cumplían las normas regionales o internacionales. La mayoría de los observadores sugieren que el proceso de recuento de los resultados presidenciales fue manipulado en beneficio del presidente en ejercicio, Mwai Kibaki, a pesar de las abrumadoras indicaciones de que su rival y el subsecuente Primer Ministro de Kenia, Raila Odinga, ganaron las elecciones. En julio de 2008, se publicaron encuestas a pie de urna encargadas por el gobierno de los Estados Unidos, revelando que Odinga había ganado las elecciones por un cómodo margen del 6%, muy por encima del margen de error del 1,3% de la encuesta.
Hubo violencia significativa y generalizada en Kenia—crisis de Kenia de 2007-2008–tras el anuncio sin precedentes de Kibaki como ganador de las elecciones presidenciales de 2007. La violencia causó la muerte de casi 1.000 personas y el desplazamiento de casi 600.000 personas. Algunos investigadores señalan que permitió el arreglo violento de disputas por la tierra entre grupos étnicos sobre conceptos controvertidos de «tierras ancestrales».
Se logró una solución diplomática, ya que los dos rivales se unieron más tarde en un gran gobierno de coalición tras la mediación internacional, dirigida por el ex Secretario General de la ONU, Kofi Annan, en virtud de un Acuerdo Nacional de Reconciliación para compartir el Poder, consagrado en la Constitución. Tras el acuerdo, el poder fue compartido entre el Presidente Mwai Kibaki y el Primer Ministro Raila Odinga.Se recomendaron varias medidas para garantizar la estabilidad y la paz de la Nación durante las negociaciones que condujeron a la formación del gobierno de coalición. Una de estas reformas fue la famosa Agenda 4, que trata de reformas en varios sectores. Se determinó que una nueva constitución era una esfera fundamental para cumplir el Programa 4. Se publicó un proyecto de constitución que los kenianos aprobaron en votación el 4 de agosto de 2010.En 2013, el gobierno de coalición se volvió ineficaz debido a la constitución. Se celebraron elecciones generales y la coalición Jubilee con el Presidente Uhuru Kenyatta y el Vicepresidente William Samoei Ruto logró la victoria. La nueva constitución también preveía una cámara bicameral, el Senado y la Asamblea nacional. Estos se llenaron debidamente con candidatos electos. La nación también estaba dividida en condados encabezados por gobernadores y representados en el senado por senadores. Las mujeres de esos condados también estuvieron representadas por la elección de mujeres representantes.El mandato de cinco años terminó en 2017 y el país se presentó a las elecciones.El Presidente Uhuru Kenyatta y el diputado William Samoei Ruto fueron reelegidos el 30 de octubre de 2017. Esto se extenderá hasta 2022, cuando se llevarán a cabo las próximas elecciones. El histórico apretón de manos en marzo de 2018 entre el presidente Uhuru Kenyatta y su antiguo oponente Raila Odinga significó la reconciliación seguida por el crecimiento económico y una mayor estabilidad.