Morgan a été archiviste et bibliographe personnel de Ginsberg du début des années 80 jusqu’à la mort de l’auteur d’un cancer en 1997. Au cours de leur relation professionnelle de 20 ans, Morgan est devenu assez proche de Ginsberg et a beaucoup écrit sur la Beat Generation et ses personnages clés.
L’intérêt de Bill Morgan pour les Beats remonte au début des années 1970, alors qu’il fréquentait l’école à l’Université de Pittsburgh. Pour son mémoire de maîtrise, il a compilé une bibliographie des œuvres de Lawrence Ferlinghetti, poète et propriétaire de City Lights Books, la célèbre librairie de San Francisco et l’un des plus importants éditeurs des premiers écrivains Beat, notamment Allen Ginsberg. Après avoir terminé sa thèse, Morgan a été encouragé par les éditeurs de l’University of Pittsburgh Press à poursuivre ce projet en vue d’une publication éventuelle. Il a en effet poursuivi ses recherches, travaillant en étroite collaboration avec Ferlinghetti en tant que bibliographe personnel, et, après une décennie de recherche, il a publié Lawrence Ferlinghetti: A Comprehensive Bibliography (New York: Garland Publishing, 1982).
En 1980, Morgan avait déménagé à New York. Alors qu’il travaillait encore sur le livre de Ferlinghetti, le poète de San Francisco l’avait référé à Allen Ginsberg, dont la bibliothèque et les archives personnelles étaient des sources inestimables d’informations sur les rythmes. Les premières consultations avec le poète sont devenues une relation durable qui a duré du début des années 1980 jusqu’à la mort de Ginsberg en 1997. Au cours de ces années, Morgan a servi d’archiviste et de bibliographe à Ginsberg, aidant le poète à organiser et à maintenir sa bibliothèque et ses archives de plus en plus nombreuses. En tant que bibliographe de Ginsberg, Morgan a passé quinze ans à correspondre et à visiter de nombreux éditeurs, éditeurs, chercheurs et collections de bibliothèques afin de recueillir suffisamment d’informations pour documenter l’histoire de la production prodigieuse de Ginsberg et l’attention mondiale qu’elle a attirée. Les résultats de ses recherches sont parus dans une bibliographie en deux volumes : The Works of Allen Ginsberg, 1941-1994: A Descriptive Bibliography et The Response to Allen Ginsberg, 1926-1994: A Bibliography of Secondary Sources (Westport, Conn.: Greenwood Press, 1995, 1997). En 2006, Morgan a publié I Celebrate Myself: The Somewhat Private Life of Allen Ginsberg (New York: Viking, 2006). Il a suivi cela en 2010 avec The Typewriter Is Holy: The Complete, Uncensored History of the Beat Generation (New York, NY: Free Press, 2010).
Morgan a également écrit ou édité une demi-douzaine d’autres œuvres relatives aux Beats, y compris des recueils d’essais de Ginsberg (Deliberate Prose: Selected Essays, 1952-1995, New York: HarperCollins, 2000), des derniers poèmes du poète (Death & Fame: Poems, 1993-1997; coédités avec Bob Rosenthal et Peter Hale, New York: HarperFlamingo, 1999), et de La correspondance de Gregory Corso (An Accidental Autobiography: The Selected Letters of Gregory Corso, New York: New Directions, 2003). À travers City Lights in San Francisco, il a publié deux guides, The Beat Generation in New York: Une visite à pied de la Ville de Jack Kerouac (1997) et de La Beat Generation à San Francisco: Une tournée littéraire (2003). Ce dernier est apparu lors de la célébration du cinquantième anniversaire des Lumières de la ville, à laquelle Morgan a également contribué avec une série de visites à pied gratuites de la section North Beach de San Francisco, autrefois un centre de la vie bohème de la ville et la maison de nombreux Beats dans les années 1950 et 1960.
Au cours de ses décennies de recherche sur les Beats, Morgan a rassemblé peut-être les plus grandes collections privées d’œuvres imprimées de Ferlinghetti et de Ginsberg en mains privées. Il a eu de plus en plus de mal à conserver ces deux collections très importantes et précieuses dans son appartement de New York, et a décidé à contrecœur de s’en séparer. Sachant que Ferlinghetti était un ancien élève de l’UNC-Chapel Hill, il a décidé à l’automne 2001 d’offrir sa collection du poète de San Francisco à l’Université de Caroline du Nord aux bibliothèques de Chapel Hill. Des discussions avec les responsables de la bibliothèque ont conduit au transfert de la collection à Chapel Hill en décembre de la même année, en partie en vente et en partie en cadeau. Satisfait du résultat, Morgan a ensuite proposé un arrangement similaire pour sa collection Allen Ginsberg encore plus étendue. Les documents ont été livrés à la Collection de livres rares de la Bibliothèque Wilson en août 2002.