Le Kit d’Extraction, d’amplification et d’Électrophorèse de PTC avec CarolinaBLU® et des tubes de 0,2 mL permet une expérience fascinante et imparfaite à tester pour le SNP en position 145, qui a la plus forte corrélation avec la dégustation des 3 polymorphismes. Les élèves isolent l’ADN des cellules des joues obtenues par un simple rince-bouche salin et amplifient une région du gène TAS2R38. Le fragment amplifié (amplicon) est incubé avec l’enzyme de restriction HaeIII, qui inclut le SNP dans sa séquence de reconnaissance GGCC. HaeIII coupe l’allèle taster (avec la séquence GGCC) mais ne parvient pas à couper l’allèle nontaster (GGGC). Cela crée un polymorphisme de longueur et les 2 allèles sont facilement séparés dans un gel d’agarose.
Pour obtenir le meilleur effet, produisez d’abord les génotypes et demandez à chaque élève de prédire son phénotype de dégustation. Ensuite, sortez le papier PTC et demandez aux élèves de noter leur capacité de dégustation comme forte, faible ou inexistante. La prédiction du goût amer est bonne mais pas parfaite.
Pratiquement tous les non-testeurs homozygotes (tt) ne peuvent pas goûter le PTC, tandis que les dégustateurs homozygotes (TT) le signalent parfois comme faible ou non-test. Le génotype hétérozygote (Tt) a le phénotype le plus » fuyant », le faible ou le non-test étant assez commun. (Ceci est formellement appelé un effet hétérozygote.) Les explications des étudiants pour ces divergences vont au cœur de la variabilité génétique et montrent les limites des tests génétiques.