glândulas e toxinas
as glândulas de aracnídeos são geralmente peculiares a ordens individuais. Em Aranhas, a seda é armazenada como um líquido viscoso nas glândulas de seda, que estão localizadas dentro do abdômen. O número de spinnerets, através do qual o material glandular é extrudido, é variável. O líquido viscoso, uma proteína, passa através de tubos minúsculos nas pontas dos spinnerets e muda de fio líquido para fio sólido. Um rearranjo estrutural das moléculas de proteína ocorre quando a seda é retirada de uma gota de seda. A seda dos pseudoscorpions é produzida por um espinereto localizado em uma projeção móvel das queliceras. Os poucos ácaros que produzem seda têm glândulas na área da boca.
substâncias tóxicas são segregadas por glândulas especiais encontradas nas queliceras das aranhas, no pedipalpo de falsos escorpiões, e nas glândulas venenosas dos escorpiões. Estas substâncias e os seus efeitos diferem mesmo dentro de espécies da mesma ordem. O veneno fortemente alcalino das Aranhas é muito menos venenoso para os mamíferos do que para os artrópodes. Picadas de aranhas dos gêneros Loxosceles (reclusa castanha) e Latrodectus (viúva negra) podem causar desconforto humano, enquanto as das viúvas podem causar doenças graves. O veneno da maioria dos escorpiões, suficientemente tóxico para matar a maioria dos invertebrados, geralmente não é perigoso para os humanos. No entanto, os venenos de alguns escorpião gêneros (Androctonus e Buthus da África, várias espécies de Centruroides do México, Arizona e Novo México), são altamente tóxicos nervo venenos. A toxicidade do veneno de pseudoscorpiões não é conhecida. As glândulas emparelhadas localizadas perto do ânus dos escorpiões segregam ácidos específicos (ácido fórmico e ácido acético) que servem como irritantes e aparentemente são usados para a defesa. As aberturas das glândulas odoríferas emparelhadas são encontradas no cefalotórax do Papai pernas longas; quando irritado, estes animais secretam um fluido contendo ácido ciânico que provavelmente serve para repelir predadores.