kumulativt har det omfattande antalet prover som samlats häri kombinerat med tillgängligheten av mycket högt lösta faderliga fylogenier som sträcker sig tillbaka många generationer, möjliggjort vissa slutsatser om Ashkenazi-levitens haplogrupp R1a-grundlinje som ska formuleras med en hög grad av förtroende. En summa av 71 individer förklara en Ashkenazi Levite eller Ashkenazi icke-Levite Fader arv fastställdes vid starten av studien att tillhöra haplogrupp R1a-M582, och baserat på deras STR profiler, att representera ett brett spektrum av variationen finns inom denna haplogrupp. Påfallande kunde alla 71 Y-kromosomer omfördelas till en enda expanderande klad kapslad inom R1a-M582 och märkt häri R1a-Y2619, efter en av de sex varianterna som hittades på den nivån (Fig. 2 och kompletterande figur S1). De enda tidigare rapporterade proverna som delade denna klad var fem prover av Ashkenazi judiska arv för vilka levitens status inte rapporterades26. Följaktligen är alla R1A-Y2619-individer, oavsett om de är självanslutna som judar eller icke-judar, oavsett om de är Ashkenazi eller icke-Ashkenazi, oavsett om de är leviter eller icke-leviter, de direkta manliga ättlingarna till faderlinjen till en gemensam manlig förfader som levde ~1743 ybp (Tabell 1). Som samtida män från alla grenar av R1a-Y2619 samplade hittills bär en av de många leviterna efternamn, det kan starkt hävdas att denna manliga förfader själv anslutna som en Levite och kan ha burit patronymikon efternamn Levite. Storleken på grundhändelsen kan uppskattas genom att beräkna antalet samtida individer som förväntas bära en R1A-Y2619 Y-kromosom. Två oberoende provuppsättningar av Ashkenazi-judar där Levitstatusen var Okänd har på samma sätt uppskattat andelen R1A-Y2619 faderlig haplogrupp, R1a-M17/M198, i Ashkenazi-befolkningen vid 9.6% 20 och 11,5%, respektivt27. Det tidigare papperet rapporterade att haplogrupp R1a-M582 stod för 7,9% av den totala Ashkenazi-befolkningen20. Här visar vi att alla Ashkenazi-prover som tillhör haplogrupp R1a-M582 kan omklassificeras till R1a-Y2619. Baserat på en Ashkenazi-befolkningsstorlek på ~4 000 00013 män, varav cirka 7,9% är R1a-Y2619, skulle det finnas ~300 000 Ashkenazi-män som faller på sin direkta manliga linje från en enda relativt ny förfader, med många av dessa män självanslutande som Levite.
två faktorer gjorde det möjligt för oss att uppnå mer exakta koalescensåldrar och konfidensintervall än tidigare beräknat för Ashkenazi Levite R1a lineage18,20. För det första det stora antalet tillgängliga hela Y-kromosomer (kompletterande tabell S1) och för det andra tillgängliga data från Horowitz-stamtavlan som tillät en intern Kalibreringspunkt (Fig. 3). De väldokumenterade genealogiska register över Horowitz stamtavla visar hur robusta hela y-kromosomsekvenser kan vara att rekonstruera faderliga förfäder. Kalibreringspunkten baserades på tre Horowitz-prover med väldokumenterade släktforskning som samlade 402 ybp. Ytterligare två individer, självanslutande med Horowitz-dynastin, men utan tydliga släktforskningar grupperade tätt med dessa tre prover. Inget av proverna i de omedelbara systerkladerna identifierade sig själv som en del av Horowitz-dynastin. Påfallande beräknades den molekylära åldern för noden som innefattade alla fem Horowitz-proverna vara ~690 ybp, medan den genealogiska koalescenstiden antyder att den är 546 ybp. Detta tyder på att Horowitz-noden R1a-YP268 (g.23133909G > A) kan representera den faktiska rekonstruerade hel-y-sekvensen för den namngivna grundaren av denna stamtavla (Fig. 3b). Det är dock viktigt att notera att de uppskattade koalescensåldrarna är ungefärliga, eftersom några metodologiska variationer kan leda till något olika resultat. Till exempel skulle tillämpningen av vår koalescensmetod på data som erhållits från Illumina-plattformen ensam ha gett en koalescensålder på ~1,398 ybp för Ashkenazi Levite R1a-Y2619 clade och ~645 år ybp för R1a-YP268 clade. Sådana skillnader kan hänföras till förmågan att använda längre överlappande sträckor av Y-kromosomen när man jämför prover sekvenserade av samma maskiner och parametrar. Vi beräknade inte en koalescenstid baserad på str-variationer, som vi tidigare har visat ger de ingen ytterligare information för nyligen koalescerande clades6.
den föreslagna Mellanöstern ursprung Ashkenazi Levite härstamning baserat på vad som tidigare var ett relativt begränsat antal rapporterade prover20, kan nu anses fast valideras. Medan de högsta frekvenserna av haplogrupp R1a finns i Östeuropa18,28, våra data avslöjade en rik variation av haplogrupp R1a utanför Europa som är fylogenetiskt skild från de typiskt Europeiska R1A-filialerna. Uppenbarligen är R1a-Y2619 väl kapslad i en uppsjö av fylogenetiskt nära Systerklader i Mellanöstern, samplade i iranska azerier, en Kerman, en Yazidi och en man från Iberia. Detta ger de nödvändiga bevisen för dess ursprung (Fig. 2 och kompletterande figur S1). Den exakta migrationsvägen för R1a-Y2619 till Europa är dock fortfarande svårfångad. De flesta historiska dokument tyder på två stora vägar Judisk migration till Europa (Fig. 1)29,30. Ashkenazi-judendomen anses ha grundats som ett resultat av judisk migration via Italien till Rhendalen och sedan Polen. Sefardiska (spanska) judar anses ha migrerat tillsammans med den gradvisa islamiska expansionen till Nordafrika och sedan Spanien14. Eftersom R1a-Y2619 är av Mellanöstern ursprung, är det möjligt att dess introduktion till Europa var av endera eller båda av dessa rutter. Naturligtvis, den starka grundande händelsen för R1a-Y2619 bland Ashkenazi-judar, i kombination med närvaron av alla kända grenar av R1a-Y2619 i Ashkenazi-judar, Frestar att dra slutsatsen att dess migrationsväg från Levanten var direkt relaterad till Ashkenazi-grundarna. Dessa fakta kan dock bara återspegla en expansion inom Ashkenazi-judar snarare än ett bevis på R1a-Y2619s första ankomst med eller in i Ashkenazi-befolkningen. Mer förvirrande är det faktum att genealogiska register över Horowitz rabbinska dynastin, nu visat sig bära R1A-Y2619 Y-kromosomen, föreslå deras närvaro i den Iberiska halvön i den 15: e århundradet och förmodligen tidigare (Fig. 3)17. Faktum är att upprepade judiska migrationer som kan ha transporterat R1A-Y2619 Y-kromosomer till Katalonien dokumenteras sedan 4: e århundradet och under den muslimska expansionen till Iberia31. Dessutom, eftersom Katalonien återigen var kristen territorium sedan 800 CE, kunde proto-Horowitz R1A-Y2619 förfäder också representera migration av Ashkenazi-judar till Iberia. Följaktligen, närvaron av R1a-Y2619 i Spanien på 15-talet kunde inte fastställa bevis för den första ankomsten av R1A-Y2619 härstamning till den Iberiska halvön, eftersom detta helt enkelt skulle kunna återspegla upprepade och oregistrerade rörelser judar fram och tillbaka mellan östra och västra Europa och den Iberiska halvön. Tidigare bevis från mtDNA och autosomala markörer har redan föreslagit ett troligt genflöde mellan Ashkenazi och sefardiska judar inom Europa32,33,34. Sammantaget tenderar våra resultat att gynna en enda väg till Europa som en del av Ashkenazi migration och expansion i Europa. Eftersom koalescenstiden för alla samtida R1a-Y2619 leviter är ~1 743 ybp, väl inom tiden för den romerska exildiasporan, och var och en av grenarna i R1a-Y2619 finns i Ashkenazi-judar, är våra resultat oförenliga med ett scenario med snabb expansion i Levanten följt av en spridning via flera rutter till Europa. Resultaten från icke-Ashkenazi R1a-Y2619 Levite-prover föreslår också en enda expansionsväg. Hade R1a-Y2619 Levite härstamning redan varit så utbredd i Levanten, de icke-Ashkenazi leviterna skulle ha förväntats att dela från Ashkenazi Levite prover före tiden för diasporan och att bilda en annan kluster. Resultaten visar emellertid att icke-Ashkenazi-leviterna faller inom flera relativt nyligen sammanfallande undergrenar av R1a-Y2619 (Fig. 2 och kompletterande figur S1). Detta mönster är mer kompatibelt med kontinuerligt genflöde från Ashkenazi-befolkningen till den icke-Ashkenazi-befolkningen under diasporan, snarare än flera ingångsvägar för haplogrupp R1a-Y2619 till Europa från Levanten.
ytterligare stöd för en enda migrationsväg och efterföljande expansion inom Ashkenazi-judar härrör från de observerade utvidgningsmönstren för ytterligare Ashkenazi-haplogrupper. Följaktligen, det är viktigt att skilja mellan en Ashkenazi Levite specifik grundande händelse för haplogrupp R1a-Y2619 som kunde ha varit resultatet av en gynnsam socioekonomisk eller annan status, och en allmän expansion av Ashkenazi grundande y kromosomlinjer, inklusive R1a-Y2619 Ashkenazi leviter. För detta ändamål har vi studerat en handfull andra haplogrupper som tidigare beskrivits vara förhärskande bland Ashkenazi Jews19, 24, 35. Våra resultat visar att utvidgningen av R1a-Y2619 bland Ashkenazi-judar inte är specifik eller unik för denna haplogrupp. Till exempel representerar sammanslagningen av haplogrupp G-M377 (kompletterande figur S4) och Q-M242 (kompletterande figur S5), som är kända för var och en 5% av Ashkenazi-Faderns variation24, sammanfogas vid ~1 223 ybp respektive ~1 672 ybp (Tabell 1). Y-kromosomstrategin som antogs häri gjorde det möjligt för oss att lösa haplogrupp E-linjer i sina minutundergrenar (kompletterande figur S3). Koalescensåldrarna för haplogrupp E-Z838, E – PF3780, E – B923 och E-B933, kända för att kumulativt representera 20% av Ashkenazi fadervariation24, uppskattades till ~1 200-1 600 ybp. Detta mönster av flera grundhändelser, som inte observerats bland spanska Judar36 ger ytterligare stöd för att R1a-Y2619 Ashkenazi Levite förfader kom in i Europa via Ashkenazi-rutten snarare än via den judiska expansionen till den Iberiska halvön. Andra mönster är också tydligt synliga i Ashkenazi judiska faderliga anor. Haplogrupp T-M70, utbredd i Mellanöstern, finns också bland Ashkenazi-judar (kompletterande figur S6). De genotypade proverna visade djupt rotade splittringar som förmodligen pekade på bevarandet av en gammal mångfald av denna haplogrupp i Levanten, dejting tillbaka till pleistocen. Samtidigt föreslår mönstret som observerats för haplogrupp R1b-M269 (kompletterande figur S7), som förekommer i Västeuropa, främst upprepad punkterad introgression av Europeiska Y-kromosomer till Ashkenazi-samhället och är kompatibel med tidigare rapporter36.
vi jämförde vidare Den vanligaste grundlinjen som hittades bland Ashkenazi Cohen-män, kapslade inom haplogrupp J1a-P58, till Ashkenazi Levite R1a-Y2619-linjen. Uppenbarligen delar medlemmar av R1a-Y2619 Levite-kasten och J1a-P58 Cohen-kasten inte en gemensam manlig förfader inom tidsramen för den bibliska berättelsen. Som i fallet med Ashkenazi-leviterna bildade Ashkenazi Cohen J1a-P58-linjen ett tätt kluster kapslat i en Mellanösternuppsättning av prover som bekräftade dess ursprung och delades i vår studie endast med icke-Ashkenazi Cohens (kompletterande figur S2). Men annorlunda än det mönster som erhållits för R1a-Y2619 Ashkenazi leviter, samlas klustret ~2,570 ybp, vilket pekar på början av dess expansion under pre-Diasporaperioden. Omfattande fulla y-kromosomsekvenser från större antal Cohen prover från fler judiska samhällen på bakgrunden av andra Levantine populationer, inklusive fastställande av familj och klan specifika varianter skulle vara mycket informativ att ta itu med konstaterandet att Ashkenazi och icke-Ashkenazi Cohen individer delar en Överlappande fördelning av härstamningar. Särskilt, studien av den mest dominerande Cohen härstamning kapslade med den förhärskande haplogrupp J1-P58, tillsammans med expert historiska input, kan ge kritisk insikt till förståelsen av Hebreerbrevet i den gamla världen. Dessutom kan forntida DNA-studier av Levanten erbjuda direkt information. Faktum är att en ny studie avslöjade närvaron av både J1a-P58 och J2-M12 Y-kromosomer, frekventa bland samtida judar, i två kanaanitprover dateras till 3700 ybp37.
det är svårt att simulera det maximala antalet män som skulle ha behövt vara närvarande vid grunden för Ashkenazi-judendomen för att ge det starka mönstret av grundhändelser som för närvarande observeras i Ashkenazi y-kromosompoolen. Grundläggande index som frekvenser för respektive haplogrupper i förfädernas deme-populationer och omfattningen av introgression som har inträffat genom generationerna saknas. De samtida frekvenserna för dessa y-kromosomgrundande linjer, med tanke på deras mycket lägre frekvenser i icke-judiska Mellanöstern och europeiska befolkningar, tyder dock på att sådana linjer måste ha varit närvarande vid starten av Ashkenazi-judendomen, när knappt antal män bestod av den grundande befolkningen och möjliggjorde drift att spela en roll för att etablera sina nuvarande höga frekvenser. I själva verket föreslog rekonstruktion av den senaste Ashkenazi judiska historien från hela genom en flaskhals på bara 350 individer26,38. Det är viktigt att notera att även om denna flaskhals inte nödvändigtvis sammanfaller med den grundande effektiva manliga befolkningsstorleken och händelserna för Ashkenazi-judar, säger Det oss att Ashkenazi Levite R1a-Y2619 förfader var sannolikt bland de grundande männen på vilka flaskhalsen tillämpades. På motsvarande sätt stöder data från kompletta mitokondriella DNA-sekvenser samma uppfattning om ett begränsat antal större grundande moderlinjer 33.
sammantaget underlättar storleken på de data som presenteras här en nästan fullständig upplösning av den genomiska berättelsen om leviter inom Ashkenazi-judar. Det kan starkt hävdas att samtida R1a-Y2619 Ashkenazi leviter härstammar från en enda levitisk förfader som anlände till Europa från Levanten. Utvidgningen av hans direkta manliga härstamning började inom en tidsram som är kompatibel med expansionsmönstret som observerats för flera ytterligare grundare av Ashkenazi-judarna. Således, förutom att ge insikt om en enda manlig släktforskning, dessa fynd är en viktig och mycket löst exempel på den mer allmänna demografiska historia Ashkenazi manliga och kvinnliga judiska härstamningar, där ett relativt litet antal grundare gör oproportionerligt stora bidrag till samtida Ashkenazi befolkningen genomisk variation. Det kan vidare hävdas att det faktum att icke-Ashkenazi Levite R1a-Y2619 män är väl fördelade inom Ashkenazi Levite fylogeni, snarare än grupperade separat, ger mer tilltro till scenariot att R1A-Y2619 hane in Europa med Ashkenazi grundare. Den mest gåtfulla frågan-tidpunkten och platsen där grundaren av Ashkenazi Levite R1a-Y2619 stamtavla erhållen Levite status – förblir olöst. Denna fråga kan ligga utanför ramen för genetiska studier med samtida genetisk variation, med tanke på frånvaron hittills av testade män vars linjer förgrenades mellan tiden för den delade direkta manliga förfadern till alla R1a-M582-män, ~3,143 ybp, och den delade direkta manliga förfadern till R1a-Y2619 Ashkenazi Levite-män ~1,743 ybp. Framtida historiska eller arkeologiska insikter kan ge möjlighet att ytterligare undersöka denna fråga.