återkomsten av Aguinaldo och tillfångatagandet av Manila
den 4 maj skickade Dewey ett telegram som mottogs i Washington den 7 maj: ”Jag kontrollerar bay helt och kan ta city när som helst, men jag har inte tillräckligt med män att hålla.”Kryssaren USS Charleston och ångbåten USS Peking, med ammunition, förnödenheter och trupper, skulle skickas till Manila på en gång. Generalmajor. Wesley Merritt, som fick befäl över markoperationen, begärde ursprungligen en styrka på cirka 14 000 man men ökade senare detta till 20 000. Den 25 maj Brig. Gen. T. M. Anderson och de 2 491 amerikanska trupperna under hans befäl seglade i tre transporter från San Francisco och gick med i en konvoj med USS Charleston i Honolulu.
medan amerikanerna masserade sina styrkor tillkännagav den filippinska motståndsledaren Emilio Aguinaldo förnyelsen av sin kamp mot Spanien. Aguinaldo hade levt i självpålagt exil som en del av ett avtal med spanska myndigheter, men han nådde ut till amerikanerna och erbjöd sin hjälp i deras militära kampanj. Förmedlas från Hong Kong av ett amerikanskt fartyg, Aguinaldo landade på Cavite maj 19, samlade sina anhängare, och snabbt fortsatte att fånga flera städer söder om Manila. Han förklarade Filippinernas självständighet den 12 juni och utropades till president för den filippinska republiken. Aguinaldos handlingar sanktionerades inte av amerikanerna, men det var lite de kunde göra för att bromsa hans framsteg. I spetsen för en betydande upprorisk här inrättade Aguinaldo en nära belägring av Manila.
den 20 juni stannade USS Charleston-konvojen till shell och tog ön Guam i besittning innan den fortsatte på sin resa och anlände till Manila Bay den 30 juni. En andra avdelning, 3 586 trupper under Briggeneral F. V. Greene, anlände den 17 juli och Merritt, som hade utsetts till generalguvernör, nådde Manila Bay den 25 juli. Ytterligare fem transporter, med 4 847 man, anlände den 31 juli, vilket gav den totala amerikanska truppstyrkan i Manila till nästan 11 000, med 5 000 till på väg. Merritt flyttade omedelbart sina styrkor från Cavite och förankrade sig inom 1000 yards (914 meter) från den spanska positionen vid Manila. Natten den 31 juli utsatte spanjorerna de amerikanska linjerna för intensiv gevär och artillerield, dödade 10 och sårade 43.
för de närmaste nätterna var skjutningen frekvent från de spanska linjerna. Den 7 augusti skickades en gemensam anteckning från Dewey och Merritt till spanska Gov.Ferm Tuborin J Tuboriudenes, vilket gav honom 48 timmar att evakuera icke-stridande från Manila. J. B. I. Aguinaldo svarade att han var omgiven av aguinaldos här och att det inte fanns någon tillflyktsort för de sjuka och för kvinnorna och barnen. En andra gemensam anteckning som krävde kapitulation avvisades av den spanska befälhavaren, som erbjöd sig att hänvisa den till Madrid. Detta nekades, och förberedelser gjordes för en attack.
det fanns 13 000 spanska trupper inom stadens befästningar, men med Deweys flotta som kontrollerade bukten och med den belägrade styrkan av amerikaner och rebeller i land var motståndet hopplöst. När det kombinerade mark-och sjöangreppet gjordes den 13 augusti fanns det inget stort motstånd, och en vit flagga hissades klockan 11:00, ungefär en och en halv timme efter att flottan öppnade eld. En formell kapitulation undertecknades dagen därpå.