Il kit di estrazione, amplificazione ed elettroforesi PTC con CarolinaBLU® e provette da 0,2 mL consente un esperimento affascinante e imperfetto per il test per l’SNP alla posizione 145, che ha la più alta correlazione con la degustazione dei 3 polimorfismi. Gli studenti isolano il DNA dalle cellule delle guance ottenute con un semplice collutorio salino e amplificano una regione del gene TAS2R38. Il frammento amplificato (amplicon) è incubato con l’enzima di restrizione HaeIII, che include l’SNP nella sua sequenza di riconoscimento GGCC. HaeIII taglia l’allele assaggiatore (con la sequenza GGCC) ma non riesce a tagliare l’allele nontaster (GGGC). Questo crea un polimorfismo di lunghezza e i 2 alleli sono facilmente separati in un gel di agarosio.
Per ottenere il miglior effetto, produrre i genotipi prima e avere ogni studente prevedere il loro fenotipo degustazione. Quindi tira fuori la carta PTC e chiedi agli studenti di segnare la loro capacità di degustazione come forte, debole o inesistente. La previsione della degustazione amara è buona ma non perfetta.
Praticamente tutti gli assaggiatori omozigoti (tt) non possono assaggiare il PTC, mentre gli assaggiatori omozigoti (TT) occasionalmente lo segnalano come debole o non resistente. Il genotipo eterozigote (Tt) ha il fenotipo “leakiest”, con debole o non resistente essendo abbastanza comune. (Questo è formalmente chiamato effetto eterozigote.) Le spiegazioni degli studenti per queste discrepanze arrivano al cuore della variabilità genetica e mostrano i limiti dei test genetici.