körtlar och toxiner
körtlarna av araknider är vanligtvis speciella för enskilda order. I spindlar lagras silke som en viskös vätska i silkekörtlarna, som ligger i buken. Antalet spinneretter, genom vilka det glandulära materialet extruderas, är variabelt. Den viskösa vätskan, ett protein, passerar genom små rör vid spetsarna på spinnerets och ändras från vätska till fast tråd. En strukturell omläggning av proteinmolekylerna sker när Silken dras från en silkesdroppe. Pseudoskorpionernas silke produceras av en spinneret belägen på en rörlig projektion av chelicerae. De få kvalster som producerar siden har körtlar i munnen.
giftiga ämnen utsöndras av speciella körtlar som finns i spindlarnas chelicerae, i pedipalps av falska skorpioner och i skorpionernas giftkörtlar. Dessa ämnen och deras effekter skiljer sig även inom arter av samma ordning. Spindlarnas starkt alkaliska gift är mycket mindre giftigt för däggdjur än för leddjur. Biter av spindlar av släktena Loxosceles (brown recluse) och Latrodectus (black widow) kan orsaka mänskligt obehag, medan de hos änkorna kan orsaka allvarlig sjukdom. Giftet hos de flesta skorpioner, tillräckligt giftigt för att döda de flesta ryggradslösa djur, är vanligtvis inte farligt för människor. Venomerna hos vissa skorpionsläkter (Androctonus och Buthus i Afrika, olika arter av Centraroides i Mexiko, Arizona och New Mexico) är dock mycket giftiga nervförgiftningar. Toxiciteten hos giftet hos pseudoskorpioner är inte känd. De parade körtlarna som ligger nära anus av piskskorpioner utsöndrar specifika syror (myrsyra och ättiksyra) som fungerar som irriterande och tydligen används för försvar. Öppningarna av parade luktkörtlar finns på cephalothorax av daddy longlegs; när de irriteras utsöndrar dessa djur en vätska innehållande cyansyra som förmodligen tjänar till att avvisa rovdjur.