게놈이 알려진 생물체의 경우,이제 확인 된 영역의 유전자를 배제하려고 시도 할 수 있습니다.이 기능은 문제의 특성과 연결되어 있지 않은 것으로 알려져 있습니다. 게놈이 유효하지 않은 경우에,확인된 지구를 배열하고 그밖 게놈에서 알려진 기능을 가진 유전자에 그들의 상사성에 의하여 유전자의 추정 기능을,보통 결정하는 선택권 일지도 모릅니다. 이것은 폭발,사용자가 기본 시퀀스를 입력하고 다양한 생물의 유전자의 폭발 데이터베이스 내에서 유사한 시퀀스를 검색 할 수있는 온라인 도구를 사용하여 수행 할 수 있습니다. 통계적 유전학자들의 또 다른 관심은 표현형 형질의 기초적인 유전적 아키텍처의 복잡성을 결정하는 것이다. 예를 들어,그들은 표현형이 많은 독립적 인 유전자좌 또는 몇 가지 유전자좌에 의해 형성되는지 여부를 아는 데 관심이있을 수 있으며,그 유전자좌는 상호 작용합니다. 이것은 표현형이 어떻게 진화 할 수 있는지에 대한 정보를 제공 할 수 있습니다.
최근 개발에서 고전적인 유전자 발현 프로 파일링,즉 유전자 마이크로 어레이에 의해 결합 되었다. 이러한 발현은 종종 질병 관련 유전자의 발현을위한 시스 및 트랜스 제어 요소를 설명합니다. 관찰 된 인식 효과 대사 경로-및 과학 문학 데이터베이스와 상호 작용 하는 위치 내에서 유전자의 교차 검증에 의해 책임 있는 유전자를 식별 하는 데 도움이 발견 되었습니다.
분산 분석편집
가장 간단한 방법은 분산 분석(분산 분석,”마커 회귀”라고도 함)에서 마커 위치. 이 방법에서는 백크로스에서 티 통계를 계산하여 두 마커 유전자형 그룹의 평균을 비교할 수 있습니다. 다른 유형의 경우 교차(예:교차),두 개 이상의 가능한 유전자형이있는 경우,하나는 분산 분석의 일반적인 형태를 사용합니다. 분산 분석 접근 방식에는 세 가지 중요한 약점이 있습니다. 첫째,큐틸터 위치 및 큐틸터 효과에 대한 별도의 추정치를 받지 않습니다. 유전자형 그룹 평균 간의 가장 큰 차이를 나타내는 마커를 보는 것만으로 표식 위치를 표시하고 표식에서의 명백한 표식 효과는 표식과 표식 사이의 재조합의 결과로 실제 표식 효과보다 작을 것입니다. 둘째,우리는 그 유전자형이 마커에 누락 된 개인을 폐기해야합니다. 셋째로,마커들이 넓게 이격될 때,큐틸틀은 모든 마커들로부터 상당히 멀리 떨어져 있을 수 있고,따라서 큐틸틀의 검출에 대한 힘은 감소할 것이다.
구간 맵핑편집
착륙선과 보스타인은 구간 맵핑을 개발하여 마커 위치에서의 분산 분석의 세 가지 단점을 극복했다. 인터벌 매핑은 현재 실험적 교차에서 큐틸틀의 매핑에 가장 많이 사용되는 접근법이다. 이 방법은 입력 된 마커의 유전지도를 사용하며 분산 분석과 마찬가지로 단일 큐틸의 존재를 가정합니다. 구간 맵핑에서 각 궤적은 한 번에 하나씩 고려되며,주어진 궤적이 진정한 큐틸이라는 모델에 대해 승산비(로드 점수)의 로그가 계산됩니다. 승산 비율은 표현형과 실험적인 십자가에서 각 개인에 대한 마커 유전자형 사이의 피어슨 상관 계수와 관련이 있습니다.
‘간격 매핑’이라는 용어는 두 개의 마커(종종’마커-브래킷’으로 표시됨)내에서 큐틸의 위치를 추정하는 데 사용됩니다. 간격 매핑은 원래 최대 가능성을 기반으로하지만 간단한 회귀와 함께 가능한 아주 좋은 근사치도 있습니다.
원칙에 대한 QTL 매핑:1)가능성을 계산할 수 있어 매개변수 세트(특히 QTL 효과 QTL 위치)주어진 관측된 데이터에 고기와 마커 genotypes.2)모수를 위한 견적은 확률이 가장 높은 곳에 그들이다.3)의미 임계 값은 순열 테스트를 통해 설정할 수 있습니다.
양적 형질자좌의 검출을 위한 종래의 방법은 단일 형질자좌 모델의 비교와 형질자좌를 가정하지 않는 모델을 기반으로 한다. 그러나 생물 과학과 같은 다른 분야에 대한 어플리케이션도 있습니다.. 그러나 게놈의 다른 곳에 위치한 큐티클은 간섭 효과를 가질 수 있습니다. 결과적으로 탐지 능력이 손상 될 수 있으며 위치 및 영향 추정치가 편향 될 수 있습니다(착륙선 및 봇스타인 1989; 냅 1991). 그 후,그는”유령”과”유령”이라는 이름을 붙였습니다. 따라서 여러 모델을 사용하여 보다 효율적이고 정확하게 매핑할 수 있습니다. 이것은 수학적으로 정확한 유형 계층구조인,강력한 타입을 정의합니다. 특히 매핑 모집단에서 유전자형 간의 상관 관계의 효과가 문제가 될 수 있는 작은 매핑 모집단에서.이 방법에서는 마커 궤적의 하위 집합을 공변량으로 사용하여 간격 매핑을 수행합니다. 이 마커는 다른 큐티클에 대한 프록시 역할을 하여 인터벌 매핑의 해상도를 높입니다. 이러한 표식을 선택한 후에는 모델 선택 문제를 1 차원 스캔으로 바꿉니다. 그러나 마커 공변량의 선택은 해결되지 않았습니다. 당연히,적절한 마커는 실제 큐틀에 가장 가까운 마커입니다.
가족 혈통 기반 매핑 편집
가족 혈통 기반 매핑 또는 가족 혈통 기반 매핑(연결 및 연결 매핑)은 단일 가족 대신 여러 가족을 포함합니다. 가족 기반 큐티틀 매핑은 실험적인 십자가를 만들기 어려운 유전자를 매핑하는 유일한 방법이었습니다. 그러나 몇 가지 장점으로 인해 이제 식물 유전 학자들은 인간 유전학에서 개척 된 몇 가지 방법을 통합하려고 시도하고 있습니다. 가족 혈통 기반 접근 방식을 사용하여 논의되었습니다(빙크 외. 2008). 가족 기반 연계 및 협회가 성공적으로 구현되었습니다(로샤 라 외. 2009)