alkuperäisen liigan kuoltua Monarchit viettivät useita vuosia itsenäisenä joukkueena, enimmäkseen barnstormaten läpi Keskilännen, lännen ja läntisen Kanadan. He kiersivät usein House of David baseball-joukkueen kanssa. Hall of Famers Hilton Smith, syöttäjä, ja Willard Brown, lyönti polttaja / laitahyökkääjä johdonmukainen lyöntikeskiarvo yli .300, tuli monarkin tukipylväitä tänä aikana. 1940-luvulla Willard Brownista tuli Monarchsin kunnarihyökkääjä. Andy Cooperin ollessa nyt ruorissa Monarchsista tuli Negro American Leaguen jäseniä vuonna 1937 voittaen ensimmäisen liigamestaruutensa. Andy Cooper oli vastuussa siitä, että Monarchit toivat viirin kotiin vuosina 1939 ja 1940. Tämän jälkeen Kansas City Monarchs voitti kaksi seuraavaa liigamestaruutta ja voitti uudistetun Negro League World Seriesin vuonna 1942 suoraan neljässä ottelussa Homestead Graysia vastaan.
tämän kauden alussa Monarchs hankki kuuluisimman pelaajansa, Hall of Fame syöttäjä Satchel Paigen, joka oli tulokaskaudestaan 1927 lähtien luonut mainetta mustan baseballin parhaana heittäjänä Birmingham Black Baronsin, Pittsburgh Crawfordsin ja useiden muiden joukkueiden riveissä. Kärsii käsivamma ja yleensä ajatellut tehdään, Paige liittyi Monarchs ’B joukkue 1939; 1940 hän oli toipunut ja kutsuttiin jopa Monarchs’ main squad, jossa hän tuli heidän alkuun piirustus kortti. Paigesta kirjoitettiin paljon tarinoita, sekä totta että kansanperinnettä, ja hänestä tuli legenda ihmisille, jotka eivät edes seuraa baseballia. Hänen tiedettiin esimerkiksi tunteneen laitapelaajien istuvan maassa takanaan, kun hän löi lyöjää ja tukikohdassa oli joku, joka voisi mahdollisesti sitoa pelin. Paige lämmitteli myös ennen syöttöä ottelussa heittämällä purkkapaperin poikki kotilevyksi. Paige johti toista loistavaa Monarchsin henkilökuntaa, johon kuuluivat fellow Hall of Fame Hilton Smith, veteraani Chet Brewer, Booker McDaniels, Jim LaMarque ja useat muut. Joukkue voitti viimeisen NAL-mestaruuden vuonna 1946, mutta hävisi seitsenottelun World Seriesissä Newark Eaglesille; tässä sarjassa se hävisi neljä ottelua ja voitti kolme.
vuonna 1945 UCLA: n jalkapallotähti ja armeijan luutnantti Jackie Robinson osui .387 Monarchsin polttajana. Hänestä tuli ensimmäinen Valkoiseen baseballiin hypännyt monarkki, joka teki sopimuksen Brooklyn Dodgersin kanssa vuonna 1946. Hän rikkoi minor Leaguen värilinjan vuonna 1946 Montreal Royalsin kanssa ja yhdisti major Leaguen Dodgersin kanssa vuonna 1947. Kun baseball vähitellen hajaantui 1940-luvun lopulla ja 1950-luvulla, Monarchs kehitti markkinaraon mustien kykyjen etevimpänä kehittäjänä major leaguesille. Joukkue lähetti enemmän pelaajia kuin mikään muu Negro league franchising, kuten Robinson, Paige, Ernie Banks, Elston Howard, Hank Thompson, ja Willard Brown.
Newt Allen seurasi Cooperia managerina vuonna 1941 ja häntä seurasi Frank Duncan vuonna 1942. Duncan pysyi ruorissa läpi kauden 1947 voittaen kaksi liigamestaruutta ja yhden maailmanmestaruuden. Duncanin astuttua syrjään paikan otti pitkäaikainen ykkösvahti Buck O ’ Neil. Sitten Monarchs hävisi liigamestaruuden Birmingham Black Baronsille vuonna 1948, mikä esti heitä esiintymästä viimeisessä Negro World Seriesissä. 1948 oli myös vuosi, että Wilkinson myi Monarchs Tom Baird, joka omisti joukkueen kautta alaikäisten liigan päivää 1950-luvulla. Monarchs voitti liigan western division ensimmäisen puoli viirin vuonna 1949, mutta kieltäytyi osallistua playoff Chicago American Giants, koska niiden roster oli tyhjentynyt pelaaja myynti major league seurat. He voittivat Nal West Divisionin mestaruuden vuonna 1950, mutta eivät kohdanneet Itäistä mestaria Indianapolis Clownsia samana vuonna. Joukkue voitti puoli kautta kestäneen viirin vuonna 1951, mutta hävisi pudotuspeliottelun. O ’ Neil voitti vain kaksi liigamestaruutta 1953 ja 1955, jossa viimeinen sija sandwiched välillä 1954 kuin Negro American League 1950 laski laatua ja kutistui kooltaan, kun samalla grooming useita lopulta major league pelaajia.