Haploryhmä R1b (Y-DNA)

muistilehtiön kuvake.png
tämä on sivu, joka: tarvitsee sisältöä. Voit auttaa ISOGG Wiki osallistumalla siihen. Lisää sivuja, jotka tarvitsevat apua samanlainen kuin tämä on täällä.

Haploryhmä R1b (R-M343) on Länsi-Euroopan yleisimmin esiintyvä Y-kromosomin haploryhmä ja yleisin haploryhmä geneettisissä sukututkimustietokannoissa. R1b1a2 (r-M269) on R1B: n hallitseva haara Länsi-Euroopassa.

kun otat tavallisen Y-kromosomin DNA-testin yrityksen, kuten sukupuun DNA: n kanssa, sinulle annetaan emäs-haplogroup-toimeksianto, kuten R1b1a2 (R-M269). On tarpeen tilata lisää SNP-testejä sen varmistamiseksi, mihin R1B: n alaluokkaan kuulut. Joskus on mahdollista ennustaa R1b-alaluokka 67-merkkisestä Y-STR-haplotyypistä. Jos osallistuja on lähellä ottelut 67 markkereita ennuste voi joskus ilmoittaa SNP tilan hänen ottelut. Jos alaluokan voi ennustaa kohtuullisella varmuudella, yksittäisiä SNP-testejä voi tilata sukupuu DNA: n à la carte SNP-valikosta. Muussa tapauksessa on tarpeen tilata täydellinen SNP-testi SNP-statuksesi vahvistamiseksi. SNP tila voidaan myös vahvistaa 23andMe testi, vaikka tämä sisältää paljon pienempi valikoima Y-SNPs ja ei tarjoa tällaista yksityiskohtaista haplogroup toimeksianto.

viimeisten 4000-5000 vuoden aikana tapahtuneen nopean väestönkasvun seurauksena osa r1b1a2: n sukulinjoista on kokenut Str vlauesin lähentymistä. Osana satunnaista mutaatioprosessia kaukaisemmat sukulinjat ovat lähentyneet toisiaan tuottaen yhteensattumia vastaavia haplotyyppejä. Jos sinulla on paljon otteluita eri sukunimillä SNP testaus on suositeltavaa poistaa tällaisia yhteensattumia ottelut. Jos kaksi miestä on R1B: n eri alaluokilla, he ovat Y-SNP: n puun eri alahaaroilla, eikä heillä ole yhteistä esi-isää sukututkimusajan kuluessa. Joissakin tapauksissa on löydetty yksityisiä SNP-sukuja, jotka ovat syntyneet noin 500 viime vuoden aikana ja jotka rajoittuvat yhteen sukunimeen ja siihen liittyviin y-linjaisiin geneettisiin sukuihin. SNP: n testaus tulee tulevina vuosina korostumaan sukunimien DNA-hankkeissa. SNP testaus on myös erittäin mielenkiintoinen niille, jotka haluavat oppia lisää alkuperää sukunimensä ja niiden syvä syntyperä antropologinen aikataulussa.

R1b-projektit

kaikkia R1B-miehiä kannustetaan ensisijaisesti liittymään R1B-ja subclades-projektiin, joka toimii porttina R1b: lle. ylläpitäjät voivat neuvoa sopivassa SNP-testauksessa ja kun testaus on suoritettu, he sijoittavat sinut asianmukaiseen alaryhmäprojektiin. Katso Y-DNA haplogroup-projektien Wiki-sivulta täydellinen luettelo R1b-projekteista.

neuvoja SNP-testaukseen voit myös liittyä R1B Yahoon postituslistalle, jossa näet kartan, jossa näkyy R1b: n fylogeneettinen puu ja sen alaluokat.

P312 vai U106?

L11: n kaksi hallitsevaa alaluokkaa ovat P312 ja U106, mutta näiden kahden alaluokan erottaminen toisistaan on usein vaikeaa, erityisesti 37-merkkisestä haplotyypistä. Hallitseva Länsi-Atlantin Modaalinen haplotyyppi löytyy sekä P312: sta että U106: sta.

marraskuussa 2012 Tim Janzen analysoi tiedoston 1089 SNP-testatusta R-U106-haplotyypistä ja 701 SNP-testatusta R-P312-haplotyypistä. Hän havaitsi, että modaalinen (yleisin) alleeli arvot 37 markkereita olivat samat sekä R-U106 ja R-P312 lukuun ottamatta näitä markkereita: DYS390, DYS576 ja CDYa. Alla on näiden kolmen merkin modaaliset arvot kullekin alaluokalle:

Haploryhmä DYS390 DYS576 CDYa
R-U106 23 17 37
R-P312 24 18 36

alla on kunkin alleeliarvon frekvenssit näille kolmelle markkerille prosentteina ilmaistuna:

Haplogroup Locus Count 21 22 23 24 25 26
R-P312 DYS390 701 0.3 1.0 10.4 73.0 14.4 0.86
R-U106 DYS390 1089 0.09 3.1 54.8 32.5 8.6 0.83
Haplogroup Locus Count 14 15 16 17 18 19 20 21 22
R-P312 DYS576 701 0 0.47 4.81 23.6 40.5 19.7 8.5 2.0 0.31
R-U106 DYS576 1089 0.1 1.2 12.0 43.0 30.2 10.2 3.0 0.3 0
Haploryhmä Lokus Kreivi 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40
R-P312 CDYa 701 0 0.15 1.2 5.1 15.7 30.5 26.2 12.4 7.4 1.3
R-U106 CDYa 1089 0.1 0.4 0.6 3.7 13.3 30.9 33.2 15.1 2.6 0

Huomaa kuitenkin, että CDYa on nopeasti mutatoiva merkki, joten se ei ole hyvä merkki haplogroupin ennustamiseen. Mike Maddi varoittaa, että ” DYS390: n luvut ovat petollisia. Vaikka suurin osa kaikista miehistä, jotka ovat U106+, on 23 tai vähemmän DYS390: ssä, tämä johtuu pääasiassa yhdestä alaluokasta R1B-U106 – R1b-L48. Myös toisessa pienemmässä R1B-U106: n alaluokassa (R1b-U198) on MODAALINA myös DYS390=23. Kaikilla muilla R1B-U106: n alaluokilla on kuitenkin sama modaali kuin R1b-P312: lla ja sen alaluokilla, DYS390=24. Koska R1b-L48 ja R1b-U198 edustavat luultavasti noin 50% R1B-U106 miehistä, he vääristävät edellä esitetyn taulukon Tim tulokset, jotta näyttäisi siltä, että DYS390=23 on modaali kaikille R1b-U106: lle.”

DYS492, joka löytyy sukupuun DNA: n 38-67 merkkipaneelista, on hyvä ennustaja U106-statukselle. Mike Maddi kertoo, että yli 90 prosentilla R1B-U106-projektin miehistä on DYS492=13, Mutta R1B-P312: n erittäin vahva modaali (reilusti yli 90%) ja sen alaluokka on DYS492=12.

Tim Janzen on toimittanut DYS492: lle kunkin alleelin frekvenssit prosentteina ilmaistuna täydentääkseen Maddin kommentteja:

Haploryhmä lokus kreivi 10 11 12 13 14 15
R-P312 DYS492 701 0 1.17 95.10 1.95 1.76 0
R-U106 DYS492 1089 0.12 0 0.95 96.00 2.85 0.12

P312 ja alaluokat

R-P312 (fylogeneettinen nimi, R1b1a2a1a2) on toinen R1B: n kahdesta vallitsevasta haarasta Euroopassa. (Toinen on r1b1a2a1a1 tai R-U106 alla.) P312 tunnetaan myös nimellä (AKA) S116

P312 on hyvin monimuotoinen ja näyttää olevan noin kaksi kertaa yleisempi kuin U106 Britteinsaarilla. Sen alaluokkia ovat:

  • DF27, eli S250
  • U152, eli PF6570 & S28
  • L21, eli M529 & S145, johon liittyy l459 & S461/Z290. Alex Williamson on laatinut luonnoksen L21: n fylogeneettiseksi puuksi, joka löytyy täältä
  • L238, alias S182
  • DF19, alias S232
  • DF99, alias S11987

jokaisella näistä on myös myöhemmin tunnistetut SNP: t.

U106 ja alaluokat

U106 / S21 SNP löydettiin ensimmäisen kerran vuonna 2005. Ethnoancestry (nykyisin BritainsDNA) tarjosi SNP: tä ensimmäisen kerran testattavaksi nimellä S21 elokuussa 2005. Sitä tarjottiin myöhemmin sukupuu DNA: n testattavaksi nimellä U106, jolla nimellä se nykyisin tunnetaan tutummin. Kaikkia U106/S21-testeissä positiivisia henkilöitä kannustetaan liittymään u106/S21-projektiin. Yleisiä neuvoja ja keskusteluja u106 / S21 liittyä U106 / S21 Yahoo postituslistalle.

virallista U106 SNP-puuta ylläpitää Raymond Wing ja se on nähtävissä täällä.

katso Iain Macdonaldin raportit U106: sta ja sen maantieteellisestä leviämisestä hänen tuoreelta ihmisen geneettinen antropologia-sivustoltaan.

Z12

U106>L48>Z9>Z30>Z7>Z8>Z11>Z12
perustajan arvio: 1400-1500 vuotta ennen nykyisyyttä
Z12 esiintyy yhdessä haarassa Anglo-normanninkielinen sukunimi cruwys (muunnelmat cruse, Cruise, Crewes, Crews). Sukunimet Cruwys, Cruse ja Crewes ovat kaikki löytyy Lounais-Englannissa Crewes löytyy enimmäkseen Cornwall ja Cruwys Devonissa. Cruise-sukunimi esiintyy pääasiassa Irlannissa. Z12 on myös löydetty amerikkalainen Raney, jonka linjan uskotaan polveutuvan Cruses Mississippi kautta ei-isyys tapahtuma. Z12 on myös löydetty Amerikassa Taylor raportoitu alkuperä Herefordshire, Morlan Illinois ja Stevens Marylandista. L148 on yksityinen SNP (perustajan arvio: 575+ ybp), joka on tähän mennessä löydetty Amerikassa vain sukunimistä Wade, Mitchell, Crips ja Cripps. Cripps-sukunimen arvellaan olevan peräisin Bamptonista, Oxfordshirestä.

Z18

U106> Z18

  • R-Z18-sivusto

Z326

U106>L48>Z9>Z331>Z326
perustajan arvio: 3000 vuotta ennen nykyisyyttä
Z326+ tai L48+/null 425 (tunnetaan myös nimellä ”null 425 Cluster”) tunnisti ensimmäisenä edesmennyt Leo little,joka arvioi sen iäksi noin 2-3 000 vuotta. Michael Maddi arvioi iäksi nyt noin 3 000 vuotta. Hän ylläpitää karttaa, jossa näkyvät kaikkien Z326+ – testin tehneiden tai L48+/null 425-testin tehneiden miesten tunnetut eurooppalaiset esi-isien sijainnit. Kartta löytyy täältä. Lisätietoja nulleista on Wikiartikkelissa null value, joka sisältää linkin null 425-projektiin.

R1b resurssit

  • Wikipedian artikkeli Haploryhmästä R1b
  • Eupedian artikkeli Haploryhmästä R1B
  • Genebase-artikkeli ja tutorial Haploryhmästä R
  • Whit Atheyn R1b — taajuustaulukot
  • Y-DNA haploryhmä R1B-Ftdna vs. ISOGG HAPLOTREES as of 24 May 2012 by Diana Gale Matthiesen
  • Modal haplotypes for some R1b subclades from Diana Gale Matthiesen

R1b trees

  • ISOGG Y-SNP tree for haplogroup R
  • The PHYLOTREE y-Tree – minimaalinen vertailupuu, joka näyttää haploryhmän r ja sen tärkeimpien alaluokkien sijainnin koko SNP-puun yhteydessä
  • RB1-Puukaavio Mike Walshin kaavio, jossa näkyvät R1B-puun tärkeimmät haarat (PNG)
  • R1B-puukaavio Mike Walshin kaavio, jossa näkyvät R1B-puun tärkeimmät haarat (PNG) format)
  • Alexander R. Williamsonin laatima R1B-puuanalyysi kaaviossa näkyy R1B-puu ja sen haarat sekä kunkin haaran modaalinen haplotyyppi ja merkkitaajuudet. PDF-tiedosto on ladattava Adobe Acrobat-hakutoimintojen käyttämiseksi ja tiedoston kaikki 168 sivua on nähtävä.
  • James Kanen kokeellinen haploryhmä R puu
  • U106-puu
  • M222-puu
  • U198-puu

Jatkoluku

  • Robertan SNP: hen tai ei SNP: hen estes, dnaexplained blog, 10. elokuuta 2012

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.