Ik heb de code hierboven ingevoerd)

Kladblok icoon.png
Dit is een pagina die: inhoud nodig heeft. Je kunt de Isogg Wiki helpen door er een bijdrage aan te leveren. Meer pagina ‘ s die hulp nodig hebben vergelijkbaar met deze zijn hier.

Haplogroup R1b (R-M343) is de meest frequent voorkomende Y-chromosoom haplogroup in West-Europa en de meest voorkomende haplogroup in de genetische Genealogie databases. R1b1a2 (R-M269) is de dominante tak van R1b in West-Europa.

wanneer u een standaard Y-chromosoom DNA test met een bedrijf zoals stamboom DNA u zal worden gegeven een basis haplogroup opdracht zoals R1b1a2 (R-M269). Het is noodzakelijk om extra SNP-testen te bestellen om te bevestigen tot welke subclade van R1b u behoort. Het is soms mogelijk om de R1B subclade te voorspellen van een 67-marker y-STR haplotype. Als de deelnemer heeft nauwe wedstrijden op 67 markers de voorspelling kan soms worden geà nformeerd door de SNP-status van zijn wedstrijden. Als de subclade met redelijk vertrouwen kan worden voorspeld, dan kan een enkele SNP-test worden besteld bij stamboom DNA ‘ s à la carte SNP menu. Anders is het noodzakelijk om een volledige SNP-test te bestellen voor bevestiging van uw SNP-status. SNP status kan ook worden bevestigd met de 23andMe test hoewel dit bevat een veel kleiner bereik van Y-SNPs en zal niet verstrekken dergelijke een gedetailleerde haplogroup toewijzing.

als gevolg van de snelle bevolkingsgroei in de laatste 4000-5000 jaar hebben sommige van de geslachten binnen R1b1a2 een convergentie van St vlaues ervaren. Als onderdeel van het random mutatieproces zijn meer verre afstammelingen dichter bij elkaar gekomen om toevallige matching haplotypes te produceren. Als je veel wedstrijden met verschillende achternamen SNP testen wordt aanbevolen om dergelijke toevallige wedstrijden te elimineren. Als twee mannen in verschillende subkladen van R1b zijn zullen ze op verschillende subtakken van de Y-SNP boom staan en zullen ze geen gemeenschappelijke voorouder delen binnen een genealogisch tijdsbestek. In sommige gevallen zijn particuliere SNP ‘ s gevonden die in de afgelopen 500 jaar of zo zijn ontstaan en die beperkt zijn tot één achternaam en de verwante Y-lijn genetische families. SNP-testen zullen de komende jaren steeds belangrijker worden in familienamen DNA-projecten. SNP testen is ook van groot belang voor degenen die meer willen weten over de oorsprong van hun achternaam en hun diepe afkomst in een antropologisch tijdsbestek.

R1b projecten

alle R1B mannen worden in eerste instantie aangemoedigd om deel te nemen aan het R1B en subclades project dat dient als gateway voor R1b. de beheerders zullen in staat zijn om te adviseren over de juiste SNP testen en wanneer het testen is voltooid zal u in de juiste subclade project. Zie de Wiki pagina over Y-DNA haplogroup projecten voor een volledige lijst van R1b projecten.

voor advies over SNP-testen kunt u ook deelnemen aan de R1B Yahoo mailinglijst waar u een kaart kunt zien met de fylogenetische boom van R1b en zijn subclades.

P312 of U106?

de twee dominante subclades van L11 zijn P312 en U106, maar het is vaak moeilijk om onderscheid te maken tussen deze twee subclades, vooral van een haplotype van een 37-marker. Het dominante West-Atlantische modale Haplotype wordt gevonden in zowel P312 als U106.In November 2012 analyseerde Tim Janzen een bestand van 1089 SNP-geteste R-U106 haplotypes en 701 SNP-geteste R-P312 haplotypes. Hij vond dat de modale (meest voorkomende) allelwaarden bij 37 markers hetzelfde waren voor zowel R-U106 als R-P312 met uitzondering van deze markers: DYS390, DYS576 en CDYa. Hieronder staan de modale waarden voor deze drie markers voor elke subclade:

Haplogroep DYS390 DYS576 CDYa
R-U106 23 17 37
R-P312 24 18 36

Hieronder zijn de frequenties van elk allel waarde voor deze drie markers uitgedrukt als percentages:

Haplogroup Locus Count 21 22 23 24 25 26
R-P312 DYS390 701 0.3 1.0 10.4 73.0 14.4 0.86
R-U106 DYS390 1089 0.09 3.1 54.8 32.5 8.6 0.83
Haplogroup Locus Count 14 15 16 17 18 19 20 21 22
R-P312 DYS576 701 0 0.47 4.81 23.6 40.5 19.7 8.5 2.0 0.31
R-U106 DYS576 1089 0.1 1.2 12.0 43.0 30.2 10.2 3.0 0.3 0
Haplogroep Plaats Graaf 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40
R-P312 CDYa 701 0 0.15 1.2 5.1 15.7 30.5 26.2 12.4 7.4 1.3
R-U106 CDYa 1089 0.1 0.4 0.6 3.7 13.3 30.9 33.2 15.1 2.6 0

Merk echter op dat CDYa is een snel muterende marker, dus het is niet een goede marker voor het voorspellen van een haplogroep. Mike Maddi waarschuwt dat ” de cijfers voor DYS390 misleidend zijn. Hoewel een meerderheid van alle mannen die U106+ hebben een telling van 23 of minder bij DYS390, dit is voornamelijk te wijten aan een subclade van R1b-U106 – R1b-L48. Ook een andere kleinere subclade van R1b-U106 (R1b-U198) heeft DYS390=23 als modaal. Echter, alle andere subclades van R1b-U106 hebben hetzelfde modaal als R1b-P312 en zijn subclades, DYS390=24. Aangezien R1b-L48 en R1b-u198 waarschijnlijk ongeveer 50% van de R1B-U106 mannen vertegenwoordigen, verdraaien ze de resultaten van de tabel Tim hierboven om het te laten lijken dat DYS390=23 het modaal is voor alle R1b-u106.”

DYS492, die wordt gevonden in stamboom DNA 38-67 marker paneel, is een goede voorspeller voor u106 status. Mike Maddi meldt dat meer dan 90% van de mannen in het R1B-U106 project DYS492=13 hebben, maar de zeer sterke modale (ruim 90%) van R1b-P312 en zijn subclades is DYS492=12.

Tim Janzen heeft de frequenties van elk allel waarde voor DYS492 uitgedrukt als percentages aan te vullen Maddi opmerkingen:

Haplogroep Plaats Graaf 10 11 12 13 14 15
R-P312 DYS492 701 0 1.17 95.10 1.95 1.76 0
R-U106 DYS492 1089 0.12 0 0.95 96.00 2.85 0.12

P312 en subclades

R-P312 (fylogenetische naam, R1b1a2a1a2) is één van de twee overheersend takken van R1b in Europa. (De andere is R1b1a2a1a1 of R-u106 hieronder. P312 is ook bekend als (AKA) S116

P312 vertoont een grote diversiteit en lijkt ongeveer twee keer zo vaak voor te komen als U106 op de Britse eilanden. De subclades omvatten::

  • DF27, ook bekend als S250
  • U152, ook bekend als PF6570 & S28
  • L21, ook bekend als M529 & S145, met geassocieerd L459 & S461/Z290. Alex Williamson heeft een ontwerp fylogenetische boom van L21 opgesteld die hier te vinden is
  • L238, ook bekend als S182
  • DF19, ook bekend als S232
  • DF99, ook bekend als S11987

elk van deze heeft ook verdere downstream SNP ‘ s die zijn geïdentificeerd.

U106 en subclades

de U106/S21 SNP werd voor het eerst ontdekt in 2005. De SNP werd voor het eerst aangeboden als S21 in augustus 2005 door Etnoancestry (nu BritainsDNA). Het werd later aangeboden voor het testen door stamboom DNA als U106, de naam waaronder het nu bekend is. Iedereen die positief getest heeft op U106/S21 wordt aangemoedigd om deel te nemen aan het u106/S21 project. Voor algemeen advies en discussies over U106/S21 Word lid van de U106/S21 Yahoo mailinglijst.

de officiële U106 SNP boom wordt onderhouden door Raymond Wing en is hier te zien.

voor een overzicht van U106 en zijn geografische verspreiding, zie de rapporten van Iain MacDonald op zijn recente website over de menselijke genetische antropologie.

Z12

U106>L48>Z9>Z30>Z2>Z7>Z8>Z11>Z12
grondlegger schatting: 1400-1500 jaar vóór heden
Z12 wordt gevonden in een tak van de Anglo-Normandische achternaam Cruwys (varianten Cruse, Cruise, Crewes, Crews). De achternamen Cruwys, Cruse en Crewes zijn allemaal te vinden in het zuidwesten van Engeland met Crewes voornamelijk in Cornwall en Cruwys in Devon. De naam van de Cruise komt voornamelijk voor in Ierland. Z12 is ook gevonden in een Amerikaanse Raney wiens lijn wordt verondersteld af te stammen van de Cruses van Mississippi door middel van een niet-vaderschap gebeurtenis. Z12 is ook gevonden in Amerika in een Taylor met gerapporteerde oorsprong in Herefordshire, een Morlan uit Illinois en een Stevens uit Maryland. L148 is een private SNP (founder estimate: 575+ ybp) die tot nu toe alleen is gevonden in Amerika in de familienamen Wade, Mitchell, Crisps en Cripps. De naam Cripps is vermoedelijk afkomstig uit Bampton, Oxfordshire.

Z18

U106>Z18

  • R-Z18 website

Z326

U106>L48>Z9>Z331>Z326
Oprichter schatting: 3000 years before present
Z326+ of L48+/null 425 (ook wel bekend als de “null 425 cluster”) werd voor het eerst geïdentificeerd door wijlen Leo wat die schatte zijn leeftijd op ongeveer 2-3 .000 jaar. Michael Maddi schat de leeftijd nu op ongeveer 3000 jaar. Hij houdt een kaart bij met de bekende Europese voorouderlijke locaties van alle mannen die z326 + hebben getest of die L48 + / null 425 zijn. De kaart is hier te vinden. Voor informatie over nulls zie het Wiki artikel null waarde die een link bevat naar het Null 425 Project.

R1b middelen

  • Wikipedia artikel over haplogroep R1b
  • Eupedia artikel over haplogroep R1b
  • Genebase artikel en tutorial over haplogroep R
  • Whit Athey ‘ s R1B frequentietabellen
  • Y-DNA haplogroep R1B-FTDNA vs. ISOGG Haplotrees op 24 Mei 2012 door Diana Gale Matthiesen
  • Modal haplotype voor sommige R1b subclades van Diana Gale Matthiesen

R1b bomen

  • ISOGG Y-SNP boom voor haplogroep R
  • De Phylotree Y-boom – een minimale verwijzing boom die de positie van haplogroep R en de grote subclades in de context van de volledige SNP boom
  • Rb1 boom diagram Een diagram van Mike Walsh het tonen van de belangrijkste takken van de R1b boom (PNG-formaat)
  • R1b boom diagram Een diagram van Mike Walsh het tonen van de belangrijkste takken van de R1b boom (PNG formaat)
  • een R1B-boomanalyse opgesteld door Alexander R Williamson de grafiek toont de R1B-boom en zijn takken samen met het modale haplotype en de markerfrequenties voor elke tak. Het is noodzakelijk om het PDF-bestand te downloaden om de Adobe Acrobat zoekfuncties te gebruiken en alle 168 pagina ‘ s van het bestand te bekijken.
  • James Kane ‘ s experimentele haplogroep R boom
  • de u106 boom
  • de m222 boom
  • de u198 boom

verder lezen

  • aan SNP of niet aan SNP door Roberta Estes, DNAeXplained blog, 10 augustus 2012

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.