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L’haplogroupe R1b (R-M343) est l’haplogroupe du chromosome Y le plus fréquent en Europe occidentale et l’haplogroupe le plus répandu dans les bases de données de généalogie génétique. R1b1a2 (R-M269) est la branche dominante de R1b en Europe occidentale.
Lorsque vous effectuez un test d’ADN du chromosome Y standard avec une entreprise telle que l’ADN de l’arbre généalogique, vous recevrez une affectation d’haplogroupe de base telle que R1b1a2 (R-M269). Il est nécessaire de commander des tests SNP supplémentaires pour confirmer à quel sous-clade de R1b vous appartenez. Il est parfois possible de prédire le sous-clade R1b à partir d’un haplotype Y-STR à 67 marqueurs. Si le participant a des correspondances proches à 67 marqueurs, la prédiction peut parfois être informée par le statut SNP de ses correspondances. Si le sous-clade peut être prédit avec une confiance raisonnable, un seul test de SNP peut être commandé dans le menu SNP à la carte de l’ADN de l’arbre généalogique. Sinon, il est nécessaire de commander un test SNP complet pour confirmer votre statut SNP. Le statut SNP peut également être confirmé avec le test 23andMe, bien que cela incorpore une gamme beaucoup plus petite de SNP-Y et ne fournira pas une affectation d’haplogroupe aussi détaillée.
En raison de l’expansion rapide de la population au cours des 4000-5000 dernières années, certaines des lignées au sein de R1b1a2 ont connu une convergence des vlaues STR. Dans le cadre du processus de mutation aléatoire, des lignées plus éloignées se sont rapprochées, produisant des haplotypes correspondants coïncidents. Si vous avez beaucoup de correspondances avec des noms de famille différents, il est recommandé de tester SNP pour éliminer ces correspondances fortuites. Si deux hommes sont dans des sous-clades différents de R1b, ils seront sur des sous-branches différentes de l’arbre Y-SNP et ne partageront pas d’ancêtre commun dans un délai généalogique. Dans certains cas, des SNP privés ont été trouvés qui sont apparus au cours des 500 dernières années environ et qui sont limités à un seul nom de famille et à ses familles génétiques apparentées de la lignée Y. Les tests SNP deviendront de plus en plus importants dans les projets d’ADN de nom de famille dans les années à venir. Les tests SNP sont également d’un grand intérêt pour ceux qui souhaitent en savoir plus sur les origines de leur nom de famille et leur ascendance profonde dans une période anthropologique.
Projets R1b
Tous les hommes R1b sont encouragés dans un premier temps à rejoindre le projet R1b et sous-clades qui sert de passerelle pour R1b. Les administrateurs seront en mesure de vous conseiller sur les tests SNP appropriés et lorsque les tests seront terminés, vous placerez dans le projet de sous-clade approprié. Voir la page Wiki sur les projets de l’haplogroupe Y-ADN pour une liste complète des projets R1b.
Pour obtenir des conseils sur les tests SNP, vous pouvez également rejoindre la liste de diffusion Yahoo R1b où vous pouvez voir une carte montrant l’arbre phylogénétique de R1b et de ses sous-clades.
P312 ou U106 ?
Les deux sous-clades dominants de L11 sont P312 et U106 mais il est souvent difficile de différencier ces deux sous-clades, en particulier à partir d’un haplotype à 37 marqueurs. L’Haplotype modal dominant de l’Atlantique Occidental se trouve chez P312 et U106.
En novembre 2012, Tim Janzen a analysé un fichier de 1089 haplotypes R-U106 testés par SNP et de 701 haplotypes R-P312 testés par SNP. Il a constaté que les valeurs d’allèles modaux (les plus courantes) à 37 marqueurs étaient les mêmes pour R-U106 et R-P312 à l’exception de ces marqueurs: DYS390, DYS576 et CDYa. Vous trouverez ci-dessous les valeurs modales de ces trois marqueurs pour chaque sous-clade:
| Haplogroupe | DYS390 | DYS576 | CDYa |
|---|---|---|---|
| L-U106 | 23 | 17 | 37 |
| R-P312 | 24 | 18 | 36 |
Voici les fréquences de chaque valeur d’allèle pour ces trois marqueurs exprimées en pourcentages:
| Haplogroup | Locus | Count | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| R-P312 | DYS390 | 701 | 0.3 | 1.0 | 10.4 | 73.0 | 14.4 | 0.86 |
| R-U106 | DYS390 | 1089 | 0.09 | 3.1 | 54.8 | 32.5 | 8.6 | 0.83 |
| Haplogroup | Locus | Count | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| R-P312 | DYS576 | 701 | 0 | 0.47 | 4.81 | 23.6 | 40.5 | 19.7 | 8.5 | 2.0 | 0.31 |
| R-U106 | DYS576 | 1089 | 0.1 | 1.2 | 12.0 | 43.0 | 30.2 | 10.2 | 3.0 | 0.3 | 0 |
| Haplogroupe | Locus | Nombre | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | 38 | 39 | 40 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| R-P312 | CDYa | 701 | 0 | 0.15 | 1.2 | 5.1 | 15.7 | 30.5 | 26.2 | 12.4 | 7.4 | 1.3 |
| R-U106 | CDYa | 1089 | 0.1 | 0.4 | 0.6 | 3.7 | 13.3 | 30.9 | 33.2 | 15.1 | 2.6 | 0 |
Notez cependant que CDYa est un marqueur à mutation rapide, ce n’est donc pas un excellent marqueur pour prédire un haplogroupe. Mike Maddi prévient que « Les chiffres de DYS390 sont trompeurs. Bien qu’une majorité de tous les hommes qui sont U106+ ont un compte de 23 ou moins à DYS390, cela est principalement dû à un sous-clade de R1b-U106-R1b-L48. De plus, un autre sous-clade plus petit de R1b-U106 (R1b-U198) a également DYS390 = 23 comme modal. Cependant, tous les autres sous-clades de R1b-U106 ont le même modal que R1b-P312 et ses sous-clades, DYS390 = 24. Puisque R1b-L48 et R1b-U198 représentent probablement environ 50% des hommes R1b-U106, ils biaisent les résultats du tableau Tim présenté ci-dessus pour faire croire que DYS390 = 23 est le modal pour tous les R1b-U106. »
DYS492, qui se trouve dans le panneau marqueur 38-67 de l’ADN de l’arbre généalogique, est un bon prédicteur du statut U106. Mike Maddi rapporte que plus de 90% des hommes du projet R1b-U106 ont DYS492 = 13, mais le modal très fort (bien plus de 90%) de R1b-P312 et de ses sous-clades est DYS492 = 12.
Tim Janzen a fourni les fréquences de chaque valeur d’allèle pour DYS492 exprimées en pourcentages pour compléter les commentaires de Maddi:
| Haplogroupe | Locus | Nombre | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| R-P312 | DYS492 | 701 | 0 | 1.17 | 95.10 | 1.95 | 1.76 | 0 |
| R-U106 | DYS492 | 1089 | 0.12 | 0 | 0.95 | 96.00 | 2.85 | 0.12 |
P312 et sous-clades
R-P312 (nom phylogénétique, R1b1a2a1a2) est l’une des deux branches prédominantes de R1b en Europe. (L’autre est R1b1a2a1a1 ou R-U106 ci-dessous.) P312 est également connu sous le nom de (AKA) S116
P312 présente une grande diversité et semble être environ deux fois plus fréquent que U106 dans les îles britanniques. Ses sous-clades comprennent:
- DF27, ALIAS S250
- U152, ALIAS PF6570 & S28
- L21, ALIAS M529 & S145, avec L459 & S461/Z290 associé. Alex Williamson a préparé un projet d’arbre phylogénétique de L21 qui peut être trouvé ici
- L238, ALIAS S182
- DF19, ALIAS S232
- DF99, ALIAS S11987
Chacun d’entre eux a également des SNP plus en aval qui ont été identifiés.
U106 et sous-clades
Le SNP U106/S21 a été découvert pour la première fois en 2005. Le SNP a été proposé pour la première fois en tant que S21 en août 2005 par Ethnoancestry (maintenant BritainsDNA). Il a ensuite été proposé aux tests par l’ADN de l’arbre généalogique sous le nom de U106, le nom sous lequel il est maintenant plus connu. Tous ceux qui ont été testés positifs pour U106 / S21 sont encouragés à rejoindre le projet U106 / S21. Pour des conseils généraux et des discussions sur U106 / S21, rejoignez la liste de diffusion Yahoo U106 / S21.
L’arbre officiel du SNP U106 est maintenu par Raymond Wing et peut être vu ici.
Pour un aperçu de U106 et de sa propagation géographique, voir les rapports de Iain MacDonald sur son récent site Web d’anthropologie génétique humaine.
Z12
U106 > L48 > Z9 > Z30 > Z2 > Z7 > Z8 > Z11 > Z12
Estimation du fondateur: 1400-1500 ans avant le présent
Z12 se trouve dans une branche de le nom de famille anglo-normand Cruwys (variantes Cruse, Cruise, Crewes, Crews). Les noms de famille Cruwys, Cruse et Crewes se trouvent tous dans le sud-ouest de l’Angleterre, les Crewes se trouvant principalement en Cornouailles et Cruwys dans le Devon. Le nom de famille Cruise se trouve principalement en Irlande. Z12 a également été trouvé chez un Raney américain dont on pense que la lignée descend des Crus du Mississippi par un événement de non-paternité. Z12 a également été trouvé en Amérique chez un Taylor dont les origines auraient été rapportées dans le Herefordshire, un Morlan de l’Illinois et un Stevens du Maryland. L148 est un SNP privé (estimation du fondateur: 575 + ybp) qui n’a jusqu’à présent été trouvé en Amérique que dans les noms de famille Wade, Mitchell, Crisps et Cripps. Le nom de famille Cripps serait originaire de Bampton, dans l’Oxfordshire.
Z18
U106 > Z18
- Site web R-Z18
Z326
U106 > L48 > Z9 > Z331 > Z326
Estimation du fondateur: 3000 ans avant le présent
Z326 + ou L48 + / null 425 (également connu sous le nom de « cluster null 425 » ) a été identifié pour la première fois par feu Leo Little qui a estimé son âge à environ 2-3 000 ans. Michael Maddi estime maintenant l’âge à environ 3 000 ans. Il maintient une carte montrant les emplacements ancestraux européens connus de tous les hommes qui ont testé Z326+ ou qui sont L48 + / null 425. La carte peut être trouvée ici. Pour plus d’informations sur les valeurs nulles, consultez l’article du Wiki valeur null qui inclut un lien vers le projet Null 425.
Ressources R1b
- Article Wikipedia sur l’Haplogroupe R1b
- Article Eupedia sur l’Haplogroupe R1b
- Article sur la base de gènes et tutoriel sur l’Haplogroupe R
- Tables de fréquences R1b de Whit Athey
- Y- Haplogroupe d’ADN R1b— ADNT FT vs. Haplotrees ISOGG au 24 mai 2012 par Diana Gale Matthiesen
- Haplotypes modaux pour certaines sous-clades R1b de Diana Gale Matthiesen
Arbres R1b
- Arbre ISOGG Y-SNP pour l’haplogroupe R
- Le Phylotree Y-tree – un arbre de référence minimal montrant la position de l’haplogroupe R et de ses sous-clades principaux dans le contexte de l’arbre SNP complet
- Diagramme de l’arbre Rb1 Un diagramme de Mike Walsh montrant les branches principales de l’arbre R1b (format PNG)
- Diagramme de l’arbre R1b Un diagramme de Mike Walsh montrant les branches principales de l’arbre R1b (PNG format)
- Une analyse de l’arbre R1b préparée par Alexander R Williamson Le graphique montre l’arbre R1b et ses branches ainsi que l’haplotype modal et les fréquences de marqueur pour chaque branche. Il est nécessaire de télécharger le fichier PDF pour utiliser les fonctions de recherche Adobe Acrobat et voir les 168 pages du fichier.
- Arbre expérimental de l’haplogroupe R de James Kane
- L’arbre U106
- L’arbre M222
- L’arbre U198
Lectures supplémentaires
- À SNP ou non à SNP par Roberta Estes , Blog expliqué par DNA10 août 2012