Canionul San Francisquito a fost locul de exploatare a aurului de către misionarii spanioli din misiunile San Fernando și San Buenaventura, iar mai târziu de Californios Mexicani. Activitatea lor s-a oprit în 1848, când descoperirea aurului la Sutter ‘ s Mill a început Goana după aur din California. Placer miniere mai târziu a avut loc în canion în cel puțin la sfârșitul secolului al 19-lea.
Sf. Francis DamEdit
între 1924 și 1928, canionul a fost locul barajului Sf. La 11: 57 PM pe 12 martie 1928, barajul a eșuat catastrofal, iar inundația rezultată a luat viața a până la 400 de persoane. Prăbușirea barajului St. Francis este considerată a fi una dintre cele mai grave dezastre americane de Inginerie Civilă din secolul 20 și rămâne a doua cea mai mare pierdere de vieți omenești din istoria Californiei, după cutremurul și incendiul din San Francisco din 1906. Ruinele acestui dezastru pot fi văzute și astăzi.
Drumurimodificare
din 1820, San Francisquito Canyon și San Francisquito Pass au făcut parte din traseul original al El Camino Viejo. Din 1854, traseul vagonului Stockton – Los Angeles Road și-a urmat cursul, la fel ca Butterfield Overland Mail în California din 1858 până în 1861. Acest traseu Tejon Pass și traseul Tehachapi sau Midway (urmat mai întâi de Calea Ferată a Pacificului de Sud), a rămas principalul vagon nord-sud și mai târziu rutele auto către Valea San Joaquin până la construirea traseului de creastă mai direct în 1915.
astăzi, un drum cu două benzi numit după Canionul în sine leagă Santa Clarita de comunitățile montane din Green Valley și Elizabeth Lake. Este aproximativ paralel cu cursul râului între pasul San Francisquito și capătul său sudic din nord Valea Santa Clarita.