politieke intriges.Savonarola ‘ s triomf was te groot en te plotseling om geen aanleiding te geven tot jaloezie en achterdocht. Een Florentijnse partij genaamd de Arrabbiati werd gevormd in tegenstelling tot hem. Deze interne vijanden vormden een alliantie met machtige buitenlandse krachten, vooral de hertog van Milaan en de paus, die zich hadden aangesloten bij de Heilige Liga tegen de koning van Frankrijk en in Savonarola de belangrijkste hindernis zagen om zich bij hen aan te sluiten. Het was dan, na een ferme afwijzing van de bond door Florence, dat de paus zond naar Savonarola de brief van 21 juli 1495, waarin hij prees de wonderbaarlijke vruchten van Savonarola ‘ s werk en riep hem naar Rome om zijn profetieën uit te spreken van zijn eigen lippen. Omdat die paus de corrupte Alexander VI was, was de val te duidelijk. Savonarola vroeg om toestemming om zijn reis uit te stellen en bood ziekte als zijn excuus aan.De paus leek tevreden te zijn, maar op 8 September, onder druk van zijn politieke vrienden en Savonarola ‘ s vijanden, stuurde hij hem een tweede brief waarin lof werd omgezet in vituperatie. Hij beval hem naar Bologna te gaan op straffe van excommunicatie. Savonarola antwoordde op dit vreemde document met respectvolle vastberadenheid en wees op niet minder dan 18 fouten erin. De brief werd vervangen door een andere van 16 oktober, waarin hij verboden werd om te preken. Zoals de paus zelf eerlijk bekende, was het de Heilige Bond die erop stond. Na een paar maanden, toen de vastentijd van 1496 naderde, gaf Alexander VI, terwijl hij de Florentijnse ambassadeurs een formele intrekking van het verbod weigerde, dit mondeling toe. Zo kon Savonarola zijn preken geven over Amos, een van zijn beste en meest krachtige, waarin hij het Romeinse Hof met hernieuwde kracht aanviel. Hij leek ook te verwijzen naar het schandalige privé-leven van de paus, en de laatste nam aanstoot aan dit. Een college van theologen vond niets te bekritiseren in wat de monnik had gezegd, zodat hij na de vasten in staat was om, zonder verdere remonstrances uit Rome, de preken over Ruth en Micha te beginnen.Toen Savonarola ‘ s gezag toenam, probeerde de paus hem voor zich te winnen door hem een kardinaalshoed aan te bieden. Hij antwoordde: “een rode hoed? Ik wil een hoed met bloed.”Toen zette Alexander VI, onder druk van de League en Arrabbiati, een nieuwe aanval op. In een brief van Nov. 7, 1496, voegt hij de Congregatie van San Marco, waarvan Savonarola vicaris was, met een andere waarin hij al zijn gezag zou hebben verloren. Als hij gehoorzaamde, zouden zijn hervormingen verloren gaan. Als hij ongehoorzaam was, zou hij geëxcommuniceerd worden. Savonarola, echter, terwijl krachtig protesteren, niet ongehoorzaam, omdat niemand naar voren kwam om de opdracht in werking te zetten. Hij ging daarom onverstoord door in Advent 1496 en in 1497 met zijn reeks preken over Ezechiël. Tijdens het carnaval dat jaar ontving zijn autoriteit een symbolisch eerbetoon in de” verbranding van de ijdelheden”, toen persoonlijke ornamenten, onzedelijke foto ‘ s, kaarten en speeltafels werden verbrand. Vernietiging van boeken en kunstwerken was verwaarloosbaar.De gebeurtenissen in Italië keerden zich nu echter tegen Savonarola, en zelfs in Florence werd zijn macht verminderd door ongunstige politieke en economische ontwikkelingen. Een regering van Arrabbiati dwong hem te stoppen met preken en zette heiligschennis tegen hem op op Hemelvaartsdag. De Arrabbiati verkregen van het Romeinse Hof, voor een financiële vergoeding, de gewenste stier van excommunicatie tegen hun vijand. In feite was de excommunicatie, behalve heimelijk, vol van zulke duidelijke fouten van vorm en inhoud, dat ze nietig en nietig zou maken, en de paus zelf moest haar verloochenen. De Florentijnse regering trachtte echter tevergeefs haar formele terugtrekking te verkrijgen; Er waren bredere politieke kwesties bij betrokken. Verzonken in studie en gebed, zwijgt Savonarola. Pas toen Rome een onwaardige regeling voorstelde, die de intrekking van de censuur afhankelijk maakte van de toetreding van Florence tot de Liga, ging hij opnieuw naar de preekstoel (de Lent 1498) om die preken over Exodus te geven die zijn eigen vertrek van de preekstoel en van het leven markeerden. Hij werd al snel het zwijgen opgelegd door het interdict waarmee de stad werd bedreigd. Hij had geen andere uitweg dan een beroep op een kerkraad, en hij begon een beweging in deze richting, maar vervolgens verbrandde de brieven aan de prinsen die hij al had geschreven, om geen onenigheid binnen de kerk veroorzaken. Toen deze weg eenmaal afgesloten was, leidde de enige overgebleven weg tot martelaarschap.